More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2794 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2794  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 		 204 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.940238  normal  0.870805 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4166  lysine exporter protein LysE/YggA  59.71 
 
 		 212 aa  224  5.0000000000000005e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77037  normal  0.273019 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3295  lysine exporter protein LysE/YggA  54.81 
 
 		 213 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5077  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  58.13 
 
 		 208 aa  208  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6091  lysine exporter protein LysE/YggA  56.44 
 
 		 209 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0972486  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1986  lysine exporter protein LysE/YggA  56.44 
 
 		 209 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5879  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.52 
 
 		 212 aa  165  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2075  amino acid efflux pump, RhtB family protein  46.04 
 
 		 212 aa  158  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.400632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3407  lysine exporter protein LysE/YggA  44.06 
 
 		 210 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4336  RhtB family transporter  45.41 
 
 		 212 aa  152  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2697  lysine exporter protein LysE/YggA  44.06 
 
 		 210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5239  lysine exporter protein LysE/YggA  43.56 
 
 		 210 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0418  lysine exporter protein LysE/YggA  47.24 
 
 		 213 aa  151  5.9999999999999996e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4060  lysine exporter protein LysE/YggA  44.55 
 
 		 210 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3461  lysine exporter protein LysE/YggA  44.55 
 
 		 210 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3132  lysine exporter protein LysE/YggA  41.71 
 
 		 212 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0857  lysine exporter protein LysE/YggA  40.11 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.154499  normal  0.0418461 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2845  hypothetical protein  39.15 
 
 		 209 aa  112  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.85185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0912  lysine exporter protein LysE/YggA  33.02 
 
 		 213 aa  101  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0194  threonine efflux system  32.85 
 
 		 208 aa  90.9  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.331917  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0194  threonine efflux system  33.33 
 
 		 207 aa  90.5  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0519  lysine exporter protein LysE/YggA  43.75 
 
 		 198 aa  90.1  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0858  lysine exporter protein LysE/YggA  32.31 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.74992  normal  0.0747821 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3973  threonine efflux system  29.33 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4188  threonine efflux system  30.1 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4239  threonine efflux system  28.86 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.588967  normal  0.890135 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4346  threonine efflux system  30.05 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.459932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4167  threonine efflux system  30.05 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4286  threonine efflux system  30.05 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.492935 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  31.22 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03702  threonine efflux system  28.08 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4190  threonine efflux system  28.08 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587316 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03651  hypothetical protein  28.08 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4156  homoserine/threonine efflux pump  28.08 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0219  threonine efflux system  31.25 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4718  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.721084 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5264  threonine efflux system  28.08 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.613043 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3997  threonine efflux system  31.25 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0556  threonine efflux system  31.25 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4185  threonine efflux system  27.59 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4290  threonine efflux system  27.59 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4047  threonine efflux system  27.59 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4344  threonine efflux system  27.59 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1421  lysine exporter protein LysE/YggA  29.76 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3963  threonine efflux system  30.24 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245678  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0856  lysine exporter protein LysE/YggA  32.35 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.985682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4153  threonine efflux system  29.76 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000179823  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0396  putative transport protein  31.18 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979225  hitchhiker  0.00000000000454708 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0459  putative transport protein  31.18 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321828 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0399  putative transport protein  31.18 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0417  putative transport protein  31.18 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0405  putative transport protein  31.18 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000145475 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0352  putative homoserine/threonine efflux protein  28.34 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00283  neutral amino-acid efflux system  29.1 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3278  homoserine/threonine efflux pump  29.1 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00287  hypothetical protein  29.1 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3296  homoserine/threonine efflux pump  29.1 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0359  putative homoserine/threonine efflux protein  28.34 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.672304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0399  putative homoserine/threonine efflux protein  29.1 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0394  putative homoserine/threonine efflux protein  28.57 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0914  amino acid efflux protein, putative  34.04 
 
 		 209 aa  72  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1147  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.69 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2958  threonine efflux protein  28.12 
 
 		 214 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10248  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2743  lysine exporter protein LysE/YggA  27.6 
 
 		 214 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0265185  normal  0.024176 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.17 
 
 		 207 aa  71.2  0.000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2239  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.81 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.678713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3488  lysine exporter protein LysE/YggA  29.69 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2431  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.54 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.82 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000642  transporter LysE family  29.8 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6693  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.14 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  30.23 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0100  lysine exporter protein LysE/YggA  30.73 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6400  lysine exporter protein LysE/YggA  28.1 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.436888 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  33.83 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  29.3 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0721  amino acid efflux pump, RhtB family protein  26.87 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.914234  normal  0.346615 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3097  lysine exporter protein LysE/YggA  27.14 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0929  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.72 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0823  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.16 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000549104  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3921  lysine exporter protein LysE/YggA  26.11 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  23.59 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4385  lysine exporter protein LysE/YggA  25.56 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  0.231735 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0976  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.02 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1350  amino acid efflux pump, RhtB family protein  27.93 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641415  normal  0.0201928 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7385  putative threonine efflux protein  30.41 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0325259  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  34.4 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1369  lysine exporter protein LysE/YggA  26.11 
 
 		 194 aa  62  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459986  normal  0.11161 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  32 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5673  lysine exporter protein LysE/YggA  28.28 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3911  putative amino acid (threonine) efflux protein  31.43 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.856049  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  34.4 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2711  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  24.44 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.223328  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  34.4 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0092  lysine exporter protein LysE/YggA  30.96 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5270  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.9 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.912842 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  32.26 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  33.54 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4244  lysine exporter protein LysE/YggA  26.88 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6011  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.89 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.513568 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>