More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0519 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0519  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
198 aa  362  2e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3295  lysine exporter protein LysE/YggA  40.7 
 
 
213 aa  137  7e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4166  lysine exporter protein LysE/YggA  42.21 
 
 
212 aa  135  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77037  normal  0.273019 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6091  lysine exporter protein LysE/YggA  37.37 
 
 
209 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0972486  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1986  lysine exporter protein LysE/YggA  37.37 
 
 
209 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0418  lysine exporter protein LysE/YggA  44.1 
 
 
213 aa  125  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3407  lysine exporter protein LysE/YggA  41.62 
 
 
210 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5077  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38 
 
 
208 aa  111  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128072  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2697  lysine exporter protein LysE/YggA  39.09 
 
 
210 aa  111  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5239  lysine exporter protein LysE/YggA  41.12 
 
 
210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446466  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2794  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.75 
 
 
204 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.940238  normal  0.870805 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4060  lysine exporter protein LysE/YggA  38.07 
 
 
210 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3461  lysine exporter protein LysE/YggA  38.07 
 
 
210 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0912  lysine exporter protein LysE/YggA  36.14 
 
 
213 aa  99.4  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3132  lysine exporter protein LysE/YggA  36.45 
 
 
212 aa  99.4  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2845  hypothetical protein  39 
 
 
209 aa  94  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.85185  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4336  RhtB family transporter  34.87 
 
 
212 aa  92.4  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5879  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.85 
 
 
212 aa  92  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1147  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.09 
 
 
208 aa  87  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2075  amino acid efflux pump, RhtB family protein  33.66 
 
 
212 aa  87  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.400632  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0857  lysine exporter protein LysE/YggA  35.71 
 
 
213 aa  86.3  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.154499  normal  0.0418461 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0394  putative homoserine/threonine efflux protein  31.94 
 
 
222 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00283  neutral amino-acid efflux system  31.41 
 
 
223 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3278  homoserine/threonine efflux pump  29.9 
 
 
223 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0405  putative transport protein  32.11 
 
 
210 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000145475 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0359  putative homoserine/threonine efflux protein  31.94 
 
 
210 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.672304  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3296  homoserine/threonine efflux pump  31.41 
 
 
223 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0352  putative homoserine/threonine efflux protein  29.9 
 
 
215 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00287  hypothetical protein  31.41 
 
 
223 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0417  putative transport protein  32.11 
 
 
210 aa  82.4  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0399  putative transport protein  32.11 
 
 
210 aa  82.4  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0396  putative transport protein  32.11 
 
 
210 aa  82.4  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979225  hitchhiker  0.00000000000454708 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0459  putative transport protein  32.11 
 
 
210 aa  82.4  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000321828 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0399  putative homoserine/threonine efflux protein  29.9 
 
 
223 aa  81.6  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.1 
 
 
207 aa  81.3  0.000000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2743  lysine exporter protein LysE/YggA  32.34 
 
 
214 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0265185  normal  0.024176 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2958  threonine efflux protein  32.47 
 
 
214 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10248  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  37.9 
 
 
208 aa  79.7  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0858  lysine exporter protein LysE/YggA  37.22 
 
 
211 aa  79.3  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.74992  normal  0.0747821 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0356  lysine exporter protein LysE/YggA  40.32 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.404606 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0194  threonine efflux system  30.77 
 
 
207 aa  77  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2572  hypothetical protein  31.34 
 
 
222 aa  76.3  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0929  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.26 
 
 
209 aa  75.1  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0823  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.04 
 
 
208 aa  74.7  0.0000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000549104  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.61 
 
 
212 aa  72.8  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  34.38 
 
 
210 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4167  threonine efflux system  31.28 
 
 
206 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4188  threonine efflux system  31.28 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4346  threonine efflux system  31.28 
 
 
206 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.459932  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4239  threonine efflux system  31.28 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.588967  normal  0.890135 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0452  lysine exporter protein LysE/YggA  43.7 
 
 
211 aa  70.9  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4286  threonine efflux system  31.28 
 
 
206 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.492935 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  37.7 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  39.47 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  31.63 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  40.35 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03702  threonine efflux system  30.26 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4190  threonine efflux system  30.26 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587316 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03651  hypothetical protein  30.26 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  29.2 
 
 
209 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4344  threonine efflux system  29.38 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0194  threonine efflux system  30.1 
 
 
208 aa  69.3  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.331917  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1421  lysine exporter protein LysE/YggA  35.95 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  38.58 
 
 
206 aa  69.7  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1476  lysine exporter protein LysE/YggA  32 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.52 
 
 
208 aa  69.3  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08451  hypothetical protein  37.4 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  34.64 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5264  threonine efflux system  28.87 
 
 
204 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.613043 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4290  threonine efflux system  29.74 
 
 
206 aa  68.6  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4156  homoserine/threonine efflux pump  28.87 
 
 
206 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4185  threonine efflux system  29.74 
 
 
206 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4047  threonine efflux system  28.87 
 
 
204 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  37.72 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  37.72 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0009  lysine exporter protein LysE/YggA  29.01 
 
 
245 aa  68.2  0.00000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0108149 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0699  amino acid transporter LysE  35.34 
 
 
204 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0691811  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4074  RhtB family transporter  34.24 
 
 
215 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.472652  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3973  threonine efflux system  28.35 
 
 
206 aa  66.6  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  36.36 
 
 
203 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.955446 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4153  threonine efflux system  29.9 
 
 
207 aa  66.6  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000179823  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1050  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2276  amino acid transporter  32.79 
 
 
220 aa  67  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2925  amino acid transporter LysE  32.46 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0920317  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3344  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.7 
 
 
210 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240621 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2416  RhtB family transporter  38.66 
 
 
210 aa  66.2  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2862  lysine exporter protein LysE/YggA  35.54 
 
 
213 aa  66.2  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0834  lysine exporter protein  24.86 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0107637  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2183  lysine exporter protein LysE/YggA  32.79 
 
 
200 aa  65.5  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1609  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.9 
 
 
210 aa  65.5  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.127652  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0237  hypothetical protein  39.29 
 
 
209 aa  65.5  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3963  threonine efflux system  29.9 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245678  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1611  lysine exporter protein LysE/YggA  30.95 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0311017  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0992  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.29 
 
 
232 aa  63.9  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0784  amino acid efflux/transport protein  35.09 
 
 
208 aa  64.3  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0556  threonine efflux system  29.69 
 
 
206 aa  64.3  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3712  lysine exporter protein LysE/YggA  32 
 
 
211 aa  63.9  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4405  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.48 
 
 
215 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3997  threonine efflux system  29.69 
 
 
206 aa  63.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0195  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.43 
 
 
206 aa  64.3  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0042632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>