More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_2276 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_2276  amino acid transporter  100 
 
 
220 aa  441  1e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2183  lysine exporter protein LysE/YggA  98.5 
 
 
200 aa  393  1e-108  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 
217 aa  112  5e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1609  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.22 
 
 
210 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.127652  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.97 
 
 
218 aa  106  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2589  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.81 
 
 
243 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4520  lysine exporter protein LysE/YggA  34.15 
 
 
211 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286419  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  35.05 
 
 
210 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  35.05 
 
 
210 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  34.48 
 
 
211 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  34.2 
 
 
210 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.48 
 
 
211 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  34.48 
 
 
211 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  34.54 
 
 
210 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1795  lysine exporter protein LysE/YggA  31.82 
 
 
212 aa  100  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  34.48 
 
 
211 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  34.48 
 
 
211 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  34.48 
 
 
211 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  34.48 
 
 
211 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  35.12 
 
 
210 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  29.02 
 
 
210 aa  99.8  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  35.71 
 
 
210 aa  99  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  33.85 
 
 
215 aa  98.6  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3931  amino acid transporter LysE  29.29 
 
 
213 aa  98.2  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1611  lysine exporter protein LysE/YggA  30.41 
 
 
207 aa  98.2  9e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0311017  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5446  lysine exporter protein LysE/YggA  33.66 
 
 
214 aa  96.7  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1147  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.77 
 
 
208 aa  97.4  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0356  lysine exporter protein LysE/YggA  31.61 
 
 
203 aa  96.7  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.404606 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4164  RhtB family transporter  29.89 
 
 
213 aa  95.9  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.4 
 
 
218 aa  95.5  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  31.34 
 
 
217 aa  95.5  5e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.69 
 
 
208 aa  95.5  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3344  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.7 
 
 
210 aa  95.9  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240621 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.4 
 
 
218 aa  95.9  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1238  lysine exporter protein LysE/YggA  34.39 
 
 
212 aa  95.5  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0801686  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  29.8 
 
 
216 aa  94.4  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0823  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.64 
 
 
208 aa  94.4  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000549104  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.59 
 
 
205 aa  93.6  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2862  lysine exporter protein LysE/YggA  33.14 
 
 
213 aa  92.4  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  30.85 
 
 
217 aa  92  7e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  30.21 
 
 
208 aa  91.3  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.64 
 
 
208 aa  91.3  9e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6008  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.61 
 
 
208 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.435355 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08451  hypothetical protein  34.02 
 
 
203 aa  91.3  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3130  lysine exporter protein LysE/YggA  29.17 
 
 
215 aa  90.1  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.376796 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2925  amino acid transporter LysE  30.41 
 
 
209 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0920317  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0577  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.5 
 
 
219 aa  90.1  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0086  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.04 
 
 
204 aa  90.1  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3105  lysine exporter protein LysE/YggA  32.32 
 
 
207 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0929  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.98 
 
 
209 aa  89.7  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1886  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.86 
 
 
214 aa  90.1  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.259351  normal  0.142425 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0914  amino acid efflux protein, putative  30.81 
 
 
209 aa  89.4  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.05 
 
 
209 aa  89  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  27.84 
 
 
203 aa  88.6  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0905  hypothetical protein  30.19 
 
 
208 aa  88.2  9e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.772442  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.5 
 
 
211 aa  88.2  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.18 
 
 
207 aa  87.8  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  32.26 
 
 
208 aa  87.8  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2405  lysine exporter protein LysE/YggA  30.91 
 
 
208 aa  87.8  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  31.76 
 
 
211 aa  87.8  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00299  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.07 
 
 
204 aa  87.8  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  27.55 
 
 
206 aa  87.4  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2416  RhtB family transporter  29.79 
 
 
210 aa  87.4  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1730  amino acid transporter LysE  30.48 
 
 
208 aa  87  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000126843  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3064  lysine exporter protein LysE/YggA  32.56 
 
 
213 aa  87  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  31.41 
 
 
210 aa  87  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0452  lysine exporter protein LysE/YggA  30.68 
 
 
211 aa  87.4  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0867  lysine exporter protein LysE/YggA  31.71 
 
 
207 aa  87  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.627781  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.5 
 
 
211 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.4 
 
 
209 aa  87  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0836  lysine exporter protein LysE/YggA  30.86 
 
 
207 aa  86.3  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3911  putative amino acid (threonine) efflux protein  34.24 
 
 
208 aa  86.7  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.856049  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4042  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.74 
 
 
213 aa  86.3  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4345  homoserine/homoserine lactone efflux protein  28.24 
 
 
206 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  30.91 
 
 
208 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0893485  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4659  lysine exporter protein LysE/YggA  30.91 
 
 
208 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.80151  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3704  lysine exporter protein LysE/YggA  30.91 
 
 
208 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.326067  normal  0.173855 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0885  lysine exporter protein LysE/YggA  31.94 
 
 
218 aa  85.9  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347055  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03703  neutral amino-acid efflux system  28.24 
 
 
206 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4155  homoserine/threonine efflux pump  28.24 
 
 
206 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4048  homoserine/homoserine lactone efflux protein  28.24 
 
 
206 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03652  hypothetical protein  28.24 
 
 
206 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0088  lysine exporter protein LysE/YggA  29.89 
 
 
219 aa  85.5  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5265  homoserine/homoserine lactone efflux protein  28.24 
 
 
206 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.624144 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4291  homoserine/homoserine lactone efflux protein  28.24 
 
 
206 aa  85.5  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4184  homoserine/homoserine lactone efflux protein  28.24 
 
 
206 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.340963 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4191  homoserine/homoserine lactone efflux protein  28.24 
 
 
206 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349541 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5030  lysine exporter protein LysE/YggA  30.3 
 
 
242 aa  85.1  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778866  normal  0.678911 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6476  lysine exporter protein LysE/YggA  32.45 
 
 
211 aa  85.1  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.772782 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003307  putative threonine efflux protein  30.26 
 
 
208 aa  84.7  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5636  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.46 
 
 
211 aa  84.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0625165 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  29.19 
 
 
211 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3399  lysine exporter protein LysE/YggA  35.97 
 
 
221 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944216  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2833  hypothetical protein  34.19 
 
 
212 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.11 
 
 
212 aa  84  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  31.64 
 
 
213 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2043  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.08 
 
 
208 aa  83.6  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000125036  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1520  leucine export protein LeuE  32.52 
 
 
220 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73556  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  26.86 
 
 
205 aa  83.2  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62920  leucine export protein LeuE  35.82 
 
 
216 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>