More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3407 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3407  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 210 aa  408  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5239  lysine exporter protein LysE/YggA  98.1 
 
 		 210 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2697  lysine exporter protein LysE/YggA  90.95 
 
 		 210 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4060  lysine exporter protein LysE/YggA  88.1 
 
 		 210 aa  349  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3461  lysine exporter protein LysE/YggA  87.62 
 
 		 210 aa  348  4e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3132  lysine exporter protein LysE/YggA  59.72 
 
 		 212 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5879  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  57.35 
 
 		 212 aa  206  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2075  amino acid efflux pump, RhtB family protein  57.82 
 
 		 212 aa  205  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.400632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3295  lysine exporter protein LysE/YggA  46.83 
 
 		 213 aa  177  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4166  lysine exporter protein LysE/YggA  46.12 
 
 		 212 aa  176  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77037  normal  0.273019 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6091  lysine exporter protein LysE/YggA  46.12 
 
 		 209 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0972486  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1986  lysine exporter protein LysE/YggA  46.12 
 
 		 209 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5077  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.12 
 
 		 208 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128072  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2794  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.06 
 
 		 204 aa  145  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.940238  normal  0.870805 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4336  RhtB family transporter  39.23 
 
 		 212 aa  136  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0418  lysine exporter protein LysE/YggA  38.94 
 
 		 213 aa  135  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0912  lysine exporter protein LysE/YggA  40.2 
 
 		 213 aa  127  9.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0857  lysine exporter protein LysE/YggA  35.64 
 
 		 213 aa  93.2  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.154499  normal  0.0418461 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2845  hypothetical protein  33.49 
 
 		 209 aa  86.3  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.85185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7385  putative threonine efflux protein  34.78 
 
 		 216 aa  85.5  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0325259  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0519  lysine exporter protein LysE/YggA  41.62 
 
 		 198 aa  85.1  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2958  threonine efflux protein  31.71 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10248  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2743  lysine exporter protein LysE/YggA  31.44 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0265185  normal  0.024176 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0194  threonine efflux system  30.35 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.331917  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3712  lysine exporter protein LysE/YggA  33 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  33.12 
 
 		 204 aa  72  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  35.56 
 
 		 211 aa  72  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4978  lysine exporter protein LysE/YggA  34.08 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  33.12 
 
 		 204 aa  72  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  33.12 
 
 		 204 aa  72  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3537  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.69 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.575737  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.12 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0068  LysE family protein  33.12 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  33.12 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3099  LysE family protein  33.12 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2950  LysE family protein  33.12 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1522  LysE family protein  33.12 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0858  lysine exporter protein LysE/YggA  33.15 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.74992  normal  0.0747821 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08451  hypothetical protein  35.71 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0100  lysine exporter protein LysE/YggA  30.41 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0194  threonine efflux system  29.35 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  32.3 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0298  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.03 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  32.47 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4153  threonine efflux system  30.85 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000179823  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1421  lysine exporter protein LysE/YggA  28.48 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3963  threonine efflux system  30.85 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245678  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  33.85 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2542  lysine exporter protein LysE/YggA  29.84 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.671872  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  33.85 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  36.64 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2572  hypothetical protein  26.7 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3097  lysine exporter protein LysE/YggA  32.68 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1369  lysine exporter protein LysE/YggA  32.41 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459986  normal  0.11161 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.71 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  33.85 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3696  LysE family translocator protein  35.56 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0823  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.8 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000549104  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3939  LysE family translocator protein  35.56 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0257  lysine exporter protein LysE/YggA  35.56 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3997  threonine efflux system  28.57 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0394  putative homoserine/threonine efflux protein  25.13 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6400  lysine exporter protein LysE/YggA  30.92 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.436888 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0798  lysine exporter protein LysE/YggA  35.83 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2432  RhtB family transporter  29.55 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.274649  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00283  neutral amino-acid efflux system  24.62 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3278  homoserine/threonine efflux pump  24.62 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4286  threonine efflux system  28.23 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.492935 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0992  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.9 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0359  putative homoserine/threonine efflux protein  24.87 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.672304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.82 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0352  putative homoserine/threonine efflux protein  24.87 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3973  threonine efflux system  29.06 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0219  threonine efflux system  28.57 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4346  threonine efflux system  28.23 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.459932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3296  homoserine/threonine efflux pump  24.62 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1350  amino acid efflux pump, RhtB family protein  30.28 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641415  normal  0.0201928 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0556  threonine efflux system  28.57 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00287  hypothetical protein  24.62 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4167  threonine efflux system  28.23 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0399  putative homoserine/threonine efflux protein  24.62 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0405  putative transport protein  25.4 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000145475 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0417  putative transport protein  25.4 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  28.14 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0399  putative transport protein  25.4 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0396  putative transport protein  25.4 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979225  hitchhiker  0.00000000000454708 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4188  threonine efflux system  28.14 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0459  putative transport protein  25.4 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321828 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0784  amino acid efflux/transport protein  32.85 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4239  threonine efflux system  27.05 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.588967  normal  0.890135 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03702  threonine efflux system  27.14 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03651  hypothetical protein  27.14 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4190  threonine efflux system  27.14 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587316 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0289  RhtB family transporter  31.84 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2779  amino acid efflux pump, RhtB family protein  30.16 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000004006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5054  lysine exporter protein LysE/YggA  31.79 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199833  normal  0.295211 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2194  leucine export protein LeuE  34.25 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.250499  normal  0.121922 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0856  lysine exporter protein LysE/YggA  28.72 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.985682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0914  amino acid efflux protein, putative  28.24 
 
 		 209 aa  64.7  0.0000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.996112 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>