More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0856 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0856  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 200 aa  388  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.985682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1476  lysine exporter protein LysE/YggA  35.61 
 
 		 212 aa  112  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5054  lysine exporter protein LysE/YggA  35 
 
 		 212 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199833  normal  0.295211 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5396  lysine exporter protein LysE/YggA  36.17 
 
 		 212 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3556  lysine exporter protein LysE/YggA  36.17 
 
 		 212 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.384892 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6764  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.51 
 
 		 211 aa  104  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406386  normal  0.273065 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3869  lysine exporter protein LysE/YggA  36.7 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.61339 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4711  lysine exporter protein LysE/YggA  36.17 
 
 		 212 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1218  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3652  lysine exporter protein LysE/YggA  36.17 
 
 		 212 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2460  lysine exporter protein LysE/YggA  35.64 
 
 		 212 aa  102  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1050  lysine exporter protein LysE/YggA  34.76 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2542  lysine exporter protein LysE/YggA  30.37 
 
 		 206 aa  96.3  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.671872  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1791  putative LysE type translocator  38.3 
 
 		 203 aa  95.5  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0179858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5524  lysine exporter protein LysE/YggA  33.82 
 
 		 212 aa  95.5  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0728137  normal  0.0390592 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0468  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33 
 
 		 215 aa  94.7  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.521562  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3537  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.09 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.575737  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2779  amino acid efflux pump, RhtB family protein  32.09 
 
 		 211 aa  93.6  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000004006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2743  lysine exporter protein LysE/YggA  32.68 
 
 		 214 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0265185  normal  0.024176 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2958  threonine efflux protein  32 
 
 		 214 aa  92  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10248  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003257  threonine efflux protein  29.12 
 
 		 211 aa  91.7  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2343  RhtB family threonine efflux protein  34.22 
 
 		 204 aa  89.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1018  lysine exporter protein LysE/YggA  34.22 
 
 		 204 aa  89.4  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0776742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1792  putative LysE type translocator  38.8 
 
 		 203 aa  88.6  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00860151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2572  hypothetical protein  30.9 
 
 		 222 aa  88.6  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3712  lysine exporter protein LysE/YggA  33.83 
 
 		 211 aa  85.9  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2922  lysine exporter protein LysE/YggA  27.36 
 
 		 206 aa  86.3  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2768  lysine exporter protein LysE/YggA  29.27 
 
 		 221 aa  85.5  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  34.36 
 
 		 206 aa  84.7  8e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0721  amino acid efflux pump, RhtB family protein  29.15 
 
 		 205 aa  84.7  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.914234  normal  0.346615 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3653  hypothetical protein  30.24 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002089  threonine efflux protein  31.94 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43570  hypothetical protein  31.94 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.443465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3132  lysine exporter protein LysE/YggA  31.68 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2461  lysine exporter protein LysE/YggA  30.1 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4189  lysine exporter protein LysE/YggA  27.92 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0732  lysine exporter protein LysE/YggA  31.09 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831174 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00347  threonine efflux system  30.89 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1060  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.69 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.741251  normal  0.078929 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0194  threonine efflux system  33.16 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29100  hypothetical protein  32.39 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136638 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7118  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.14 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4194  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.98 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3997  threonine efflux system  27.46 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0194  threonine efflux system  32.12 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.331917  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7385  putative threonine efflux protein  29.88 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0325259  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4482  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.02 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6693  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.61 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2833  amino acid transporter LysE  29.85 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.318432  normal  0.661514 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0289  RhtB family transporter  33.7 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1256  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.41 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0219  threonine efflux system  26.94 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0556  threonine efflux system  26.94 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4118  RhtB family transporter  28.29 
 
 		 213 aa  74.7  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1219  hypothetical protein  25.97 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3987  hypothetical protein  30.68 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05080  putative threonine efflux protein  29.7 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1213  hypothetical protein  25.97 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4344  threonine efflux system  26.94 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3113  lysine exporter protein LysE/YggA  31.18 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.050755  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03702  threonine efflux system  26.94 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03651  hypothetical protein  26.94 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1920  amino acid transporter LysE  26.96 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0233  RhtB family transporter  28.64 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14510  putative threonine efflux protein  31.08 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.93793  normal  0.0749541 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4190  threonine efflux system  26.94 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587316 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0962  lysine exporter protein LysE/YggA  27.86 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.55802  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0890  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3132  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0792555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1849  amino acid transporter LysE  26.96 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.402974  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3224  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0632575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0078  amino acid efflux protein  25 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4239  threonine efflux system  30.41 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.588967  normal  0.890135 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4188  threonine efflux system  27.46 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5264  threonine efflux system  26.94 
 
 		 204 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.613043 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4156  homoserine/threonine efflux pump  26.94 
 
 		 206 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4286  threonine efflux system  27.46 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.492935 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3100  lysine exporter protein LysE/YggA  37.12 
 
 		 212 aa  72  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2075  amino acid efflux pump, RhtB family protein  29.81 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.400632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4346  threonine efflux system  27.46 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.459932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4167  threonine efflux system  27.46 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0699  amino acid transporter LysE  28.27 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0691811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2431  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.86 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4185  threonine efflux system  26.94 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4290  threonine efflux system  26.94 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4047  threonine efflux system  26.94 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1064  lysine exporter protein LysE/YggA  27.36 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150207  normal  0.873963 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3328  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.36 
 
 		 204 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.740014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1031  lysine exporter protein LysE/YggA  27.36 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0778058  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3488  lysine exporter protein LysE/YggA  32.77 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0936  lysine exporter protein LysE/YggA  26.87 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.950459  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.13 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2183  lysine exporter protein LysE/YggA  29.29 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3991  lysine exporter protein LysE/YggA  26.4 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.1147  normal  0.39027 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.34 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3976  lysine exporter protein LysE/YggA  27.84 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5879  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.81 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3142  amino acid transporter LysE  27.18 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142315  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3657  amino acid transporter LysE  27.55 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0405  putative transport protein  35.07 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000145475 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3973  threonine efflux system  29.59 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>