More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0289 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0289  RhtB family transporter  100 
 
 		 209 aa  403  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5054  lysine exporter protein LysE/YggA  52.43 
 
 		 212 aa  190  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199833  normal  0.295211 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3712  lysine exporter protein LysE/YggA  52.45 
 
 		 211 aa  188  5e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5524  lysine exporter protein LysE/YggA  54.07 
 
 		 212 aa  185  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0728137  normal  0.0390592 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6764  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.12 
 
 		 211 aa  184  8e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406386  normal  0.273065 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2779  amino acid efflux pump, RhtB family protein  48.19 
 
 		 211 aa  181  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000004006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5396  lysine exporter protein LysE/YggA  51.81 
 
 		 212 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3556  lysine exporter protein LysE/YggA  51.81 
 
 		 212 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.384892 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4194  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  57.58 
 
 		 210 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4482  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  56.7 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1476  lysine exporter protein LysE/YggA  44.17 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3537  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.52 
 
 		 208 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.575737  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3869  lysine exporter protein LysE/YggA  51.85 
 
 		 212 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.61339 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4711  lysine exporter protein LysE/YggA  51.85 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1218  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3652  lysine exporter protein LysE/YggA  51.85 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2460  lysine exporter protein LysE/YggA  50.79 
 
 		 212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5706  lysine exporter protein LysE/YggA  53.14 
 
 		 213 aa  142  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.128668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0468  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.54 
 
 		 215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.521562  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003257  threonine efflux protein  37.38 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2542  lysine exporter protein LysE/YggA  38.46 
 
 		 206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.671872  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2239  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.77 
 
 		 204 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.678713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6400  lysine exporter protein LysE/YggA  35.05 
 
 		 215 aa  122  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.436888 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3997  threonine efflux system  33.82 
 
 		 206 aa  122  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0556  threonine efflux system  33.82 
 
 		 206 aa  122  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0219  threonine efflux system  33.82 
 
 		 206 aa  122  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3097  lysine exporter protein LysE/YggA  34.11 
 
 		 215 aa  121  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0194  threonine efflux system  35.71 
 
 		 208 aa  121  8e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.331917  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0194  threonine efflux system  36.55 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  33.99 
 
 		 206 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2963  lysine exporter protein LysE/YggA  33.65 
 
 		 215 aa  118  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2959  putative threonine efflux protein  32.73 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3293  threonine efflux protein, putative  32.73 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0428  LysE type translocator  32.73 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0377494  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2129  putative threonine efflux protein  32.73 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3387  putative threonine efflux protein  32.73 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0246  LysE family translocator protein  32.73 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4239  threonine efflux system  31.71 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.588967  normal  0.890135 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0100  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4167  threonine efflux system  31.22 
 
 		 206 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4286  threonine efflux system  31.22 
 
 		 206 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.492935 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4346  threonine efflux system  31.22 
 
 		 206 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.459932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4188  threonine efflux system  31.22 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4153  threonine efflux system  33.5 
 
 		 207 aa  108  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000179823  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3963  threonine efflux system  33.5 
 
 		 207 aa  108  8.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245678  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3973  threonine efflux system  29.95 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03702  threonine efflux system  30.05 
 
 		 206 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03651  hypothetical protein  30.05 
 
 		 206 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4190  threonine efflux system  30.05 
 
 		 206 aa  105  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587316 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4344  threonine efflux system  30.61 
 
 		 204 aa  106  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4156  homoserine/threonine efflux pump  30.05 
 
 		 206 aa  105  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5264  threonine efflux system  30.61 
 
 		 204 aa  105  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.613043 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4290  threonine efflux system  29.56 
 
 		 206 aa  105  7e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4047  threonine efflux system  30.1 
 
 		 204 aa  105  7e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4185  threonine efflux system  29.56 
 
 		 206 aa  105  7e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2958  threonine efflux protein  32.83 
 
 		 214 aa  102  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10248  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2743  lysine exporter protein LysE/YggA  32.83 
 
 		 214 aa  102  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0265185  normal  0.024176 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1050  lysine exporter protein LysE/YggA  35.83 
 
 		 204 aa  97.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5694  lysine exporter protein LysE/YggA  36.27 
 
 		 205 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6528  lysine exporter protein LysE/YggA  35.03 
 
 		 205 aa  95.9  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5142  lysine exporter protein LysE/YggA  31.15 
 
 		 204 aa  94.7  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0856  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 		 200 aa  94.7  8e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.985682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7469  lysine exporter protein LysE/YggA  35 
 
 		 205 aa  94.7  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2431  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.9 
 
 		 209 aa  93.2  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0233  RhtB family transporter  32.11 
 
 		 209 aa  92.8  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0417  putative transport protein  31.38 
 
 		 210 aa  92  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0396  putative transport protein  31.38 
 
 		 210 aa  92  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979225  hitchhiker  0.00000000000454708 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0459  putative transport protein  31.38 
 
 		 210 aa  92  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321828 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0399  putative transport protein  31.38 
 
 		 210 aa  92.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0405  putative transport protein  31.38 
 
 		 210 aa  92.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000145475 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2617  lysine exporter protein LysE/YggA  33.51 
 
 		 204 aa  90.5  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.635296 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1435  amino acid transporter LysE  32.37 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.410501  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06605  putative threonine efflux protein  29.73 
 
 		 203 aa  89.7  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5115  lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.5 
 
 		 203 aa  89.7  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.127177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6693  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.72 
 
 		 190 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3450  lysine exporter protein LysE/YggA  30.86 
 
 		 204 aa  89  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.270784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1814  lysine exporter protein LysE/YggA  36.41 
 
 		 205 aa  88.6  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000397951  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2461  lysine exporter protein LysE/YggA  31.07 
 
 		 210 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5270  lysine exporter protein LysE/YggA  30.86 
 
 		 204 aa  88.2  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27713  normal  0.342162 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3976  lysine exporter protein LysE/YggA  32.99 
 
 		 205 aa  88.2  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3488  lysine exporter protein LysE/YggA  31.11 
 
 		 223 aa  87.4  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0394  putative homoserine/threonine efflux protein  30.16 
 
 		 222 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5674  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 205 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4978  lysine exporter protein LysE/YggA  30.89 
 
 		 207 aa  87.4  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6038  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 205 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.133303 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00283  neutral amino-acid efflux system  30.16 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3278  homoserine/threonine efflux pump  30.16 
 
 		 223 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0359  putative homoserine/threonine efflux protein  30.16 
 
 		 210 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.672304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00287  hypothetical protein  30.16 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3296  homoserine/threonine efflux pump  30.16 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0399  putative homoserine/threonine efflux protein  30.16 
 
 		 223 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2347  lysine exporter protein LysE/YggA  29.47 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0352  putative homoserine/threonine efflux protein  30.16 
 
 		 215 aa  87  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0699  amino acid transporter LysE  31.03 
 
 		 204 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0691811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2922  lysine exporter protein LysE/YggA  31.37 
 
 		 206 aa  86.3  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3113  lysine exporter protein LysE/YggA  31.05 
 
 		 209 aa  85.5  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.050755  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0530  amino acid transporter LysE  32.16 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1730  amino acid transporter LysE  30.65 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000126843  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5352  lysine exporter protein LysE/YggA  36.81 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1018  lysine exporter protein LysE/YggA  35.29 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0776742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1071  putative RhtB protein  30.69 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>