More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2542 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2542  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 206 aa  407  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.671872  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003257  threonine efflux protein  47.06 
 
 		 211 aa  192  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5054  lysine exporter protein LysE/YggA  45.03 
 
 		 212 aa  168  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199833  normal  0.295211 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5396  lysine exporter protein LysE/YggA  44.68 
 
 		 212 aa  167  7e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3556  lysine exporter protein LysE/YggA  44.68 
 
 		 212 aa  167  8e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.384892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1476  lysine exporter protein LysE/YggA  44.5 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3537  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.68 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.575737  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0468  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45 
 
 		 215 aa  162  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.521562  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6764  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.71 
 
 		 211 aa  158  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406386  normal  0.273065 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3869  lysine exporter protein LysE/YggA  45.74 
 
 		 212 aa  158  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.61339 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4711  lysine exporter protein LysE/YggA  45.74 
 
 		 212 aa  157  7e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1218  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3652  lysine exporter protein LysE/YggA  45.74 
 
 		 212 aa  157  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2460  lysine exporter protein LysE/YggA  45.74 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2779  amino acid efflux pump, RhtB family protein  41.05 
 
 		 211 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000004006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5524  lysine exporter protein LysE/YggA  41.67 
 
 		 212 aa  151  8e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0728137  normal  0.0390592 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3712  lysine exporter protein LysE/YggA  40.29 
 
 		 211 aa  150  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4194  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.71 
 
 		 210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4482  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.1 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1050  lysine exporter protein LysE/YggA  36.7 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5706  lysine exporter protein LysE/YggA  40.62 
 
 		 213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.128668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0289  RhtB family transporter  37.5 
 
 		 209 aa  111  7.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6400  lysine exporter protein LysE/YggA  29.81 
 
 		 215 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.436888 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2239  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.42 
 
 		 204 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.678713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3097  lysine exporter protein LysE/YggA  29.63 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2343  RhtB family threonine efflux protein  36.17 
 
 		 204 aa  105  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1792  putative LysE type translocator  35.5 
 
 		 203 aa  104  8e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00860151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6693  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.85 
 
 		 190 aa  104  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1018  lysine exporter protein LysE/YggA  36.17 
 
 		 204 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0776742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3973  threonine efflux system  31.22 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3293  threonine efflux protein, putative  29.72 
 
 		 217 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0428  LysE type translocator  29.72 
 
 		 217 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0377494  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3387  putative threonine efflux protein  29.72 
 
 		 217 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0246  LysE family translocator protein  29.72 
 
 		 217 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2959  putative threonine efflux protein  29.72 
 
 		 217 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2129  putative threonine efflux protein  29.72 
 
 		 217 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4156  homoserine/threonine efflux pump  29.76 
 
 		 206 aa  101  7e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4185  threonine efflux system  29.76 
 
 		 206 aa  101  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4047  threonine efflux system  29.76 
 
 		 204 aa  101  7e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0856  lysine exporter protein LysE/YggA  30.37 
 
 		 200 aa  101  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.985682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5264  threonine efflux system  29.76 
 
 		 204 aa  101  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.613043 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4290  threonine efflux system  29.76 
 
 		 206 aa  101  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1227  lysine exporter protein LysE/YggA  34.92 
 
 		 207 aa  101  8e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03702  threonine efflux system  29.76 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03651  hypothetical protein  29.76 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4344  threonine efflux system  29.76 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4190  threonine efflux system  29.76 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587316 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2963  lysine exporter protein LysE/YggA  28.85 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0194  threonine efflux system  28.99 
 
 		 207 aa  99.8  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0100  lysine exporter protein LysE/YggA  29.95 
 
 		 213 aa  99.8  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4239  threonine efflux system  29.56 
 
 		 206 aa  99  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.588967  normal  0.890135 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4167  threonine efflux system  29.56 
 
 		 206 aa  98.2  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4188  threonine efflux system  29.56 
 
 		 206 aa  98.2  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4286  threonine efflux system  29.56 
 
 		 206 aa  98.2  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.492935 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4346  threonine efflux system  29.56 
 
 		 206 aa  98.2  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.459932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  29.85 
 
 		 206 aa  98.2  8e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1435  amino acid transporter LysE  30.96 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.410501  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0233  RhtB family transporter  30.85 
 
 		 209 aa  97.4  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2958  threonine efflux protein  31.58 
 
 		 214 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10248  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2743  lysine exporter protein LysE/YggA  31.58 
 
 		 214 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0265185  normal  0.024176 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0194  threonine efflux system  28.99 
 
 		 208 aa  96.3  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.331917  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4978  lysine exporter protein LysE/YggA  35.05 
 
 		 207 aa  96.3  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0556  threonine efflux system  28.99 
 
 		 206 aa  95.1  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0219  threonine efflux system  28.99 
 
 		 206 aa  95.1  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3997  threonine efflux system  28.99 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2347  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 		 207 aa  91.7  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2922  lysine exporter protein LysE/YggA  31 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4153  threonine efflux system  27.67 
 
 		 207 aa  89.4  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000179823  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3963  threonine efflux system  27.67 
 
 		 207 aa  89.4  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245678  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5115  lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.29 
 
 		 203 aa  89.7  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.127177  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3142  amino acid transporter LysE  28.64 
 
 		 218 aa  89  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142315  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4718  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.41 
 
 		 206 aa  86.3  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.721084 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0009  lysine exporter protein LysE/YggA  25.52 
 
 		 245 aa  86.7  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0108149 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3113  lysine exporter protein LysE/YggA  29.57 
 
 		 209 aa  85.5  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.050755  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7118  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.14 
 
 		 205 aa  85.5  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  25.37 
 
 		 209 aa  84.7  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5142  lysine exporter protein LysE/YggA  31.35 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1730  amino acid transporter LysE  33.67 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000126843  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0418  lysine exporter protein LysE/YggA  30.41 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0493  lysine exporter protein LysE/YggA  25.39 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0721  amino acid efflux pump, RhtB family protein  27.94 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.914234  normal  0.346615 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0912  lysine exporter protein LysE/YggA  28.65 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2431  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.32 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2572  hypothetical protein  27.18 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0359  putative homoserine/threonine efflux protein  25.76 
 
 		 210 aa  81.3  0.000000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.672304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.3 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3450  lysine exporter protein LysE/YggA  30.64 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.270784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0399  putative transport protein  26.5 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0399  putative homoserine/threonine efflux protein  25.76 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0459  putative transport protein  26.5 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321828 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0396  putative transport protein  26.5 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979225  hitchhiker  0.00000000000454708 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5270  lysine exporter protein LysE/YggA  30.64 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27713  normal  0.342162 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0417  putative transport protein  26.5 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0405  putative transport protein  26.5 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000145475 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0234  LysE type translocator  27.72 
 
 		 173 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0377259  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0078  amino acid efflux protein  25.74 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4189  lysine exporter protein LysE/YggA  24.64 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2617  lysine exporter protein LysE/YggA  34.46 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.635296 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1219  hypothetical protein  25.13 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1213  hypothetical protein  25.13 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0051  amino acid transporter LysE  28.27 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>