More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2239 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2239  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 
204 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.678713  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5115  lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  49.76 
 
 
203 aa  191  8e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.127177  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2617  lysine exporter protein LysE/YggA  53.19 
 
 
204 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.635296 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5142  lysine exporter protein LysE/YggA  49.21 
 
 
204 aa  176  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3450  lysine exporter protein LysE/YggA  48.63 
 
 
204 aa  170  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.270784  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5270  lysine exporter protein LysE/YggA  48.09 
 
 
204 aa  168  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27713  normal  0.342162 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2959  putative threonine efflux protein  34.1 
 
 
217 aa  144  9e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3293  threonine efflux protein, putative  34.1 
 
 
217 aa  144  9e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0428  LysE type translocator  34.1 
 
 
217 aa  144  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0377494  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0246  LysE family translocator protein  34.1 
 
 
217 aa  144  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3387  putative threonine efflux protein  34.1 
 
 
217 aa  144  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2129  putative threonine efflux protein  34.1 
 
 
217 aa  144  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3097  lysine exporter protein LysE/YggA  33.95 
 
 
215 aa  141  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4978  lysine exporter protein LysE/YggA  38.14 
 
 
207 aa  138  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6400  lysine exporter protein LysE/YggA  32.72 
 
 
215 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.436888 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2963  lysine exporter protein LysE/YggA  32.7 
 
 
215 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2347  lysine exporter protein LysE/YggA  37.11 
 
 
207 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0100  lysine exporter protein LysE/YggA  33.82 
 
 
213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2743  lysine exporter protein LysE/YggA  36.59 
 
 
214 aa  128  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0265185  normal  0.024176 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2958  threonine efflux protein  37.07 
 
 
214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10248  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6764  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.1 
 
 
211 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406386  normal  0.273065 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2779  amino acid efflux pump, RhtB family protein  37.43 
 
 
211 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000004006  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3556  lysine exporter protein LysE/YggA  36.22 
 
 
212 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.384892 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5396  lysine exporter protein LysE/YggA  36.22 
 
 
212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7118  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.54 
 
 
205 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5054  lysine exporter protein LysE/YggA  34.17 
 
 
212 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199833  normal  0.295211 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5524  lysine exporter protein LysE/YggA  35.53 
 
 
212 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0728137  normal  0.0390592 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0234  LysE type translocator  32.84 
 
 
173 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0377259  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4711  lysine exporter protein LysE/YggA  36.22 
 
 
212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1218  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3652  lysine exporter protein LysE/YggA  36.22 
 
 
212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3869  lysine exporter protein LysE/YggA  36.22 
 
 
212 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.61339 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2460  lysine exporter protein LysE/YggA  36.22 
 
 
212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0721  amino acid efflux pump, RhtB family protein  31.98 
 
 
205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.914234  normal  0.346615 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0289  RhtB family transporter  40 
 
 
209 aa  108  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2542  lysine exporter protein LysE/YggA  32.4 
 
 
206 aa  106  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.671872  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0233  RhtB family transporter  31.44 
 
 
209 aa  105  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3404  lysine exporter protein LysE/YggA  29.9 
 
 
211 aa  105  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325379  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1476  lysine exporter protein LysE/YggA  31.22 
 
 
212 aa  104  9e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3663  lysine exporter protein LysE/YggA  33.51 
 
 
209 aa  104  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0194  threonine efflux system  31.84 
 
 
207 aa  103  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0405  putative transport protein  30.54 
 
 
210 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000145475 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0399  putative transport protein  30.54 
 
 
210 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0989  lysine exporter protein LysE/YggA  33.67 
 
 
210 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0459  putative transport protein  30.54 
 
 
210 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000321828 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0396  putative transport protein  30.54 
 
 
210 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979225  hitchhiker  0.00000000000454708 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0417  putative transport protein  30.54 
 
 
210 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7385  putative threonine efflux protein  32.84 
 
 
216 aa  101  7e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0325259  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3712  lysine exporter protein LysE/YggA  34.57 
 
 
211 aa  101  9e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00283  neutral amino-acid efflux system  29.06 
 
 
223 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3278  homoserine/threonine efflux pump  29.06 
 
 
223 aa  100  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00287  hypothetical protein  29.06 
 
 
223 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0394  putative homoserine/threonine efflux protein  29.06 
 
 
222 aa  100  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0399  putative homoserine/threonine efflux protein  29.06 
 
 
223 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3296  homoserine/threonine efflux pump  29.06 
 
 
223 aa  100  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4189  lysine exporter protein LysE/YggA  29.95 
 
 
212 aa  100  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4710  lysine exporter protein LysE/YggA  32.99 
 
 
209 aa  100  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0352  putative homoserine/threonine efflux protein  29.06 
 
 
215 aa  100  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0359  putative homoserine/threonine efflux protein  28.57 
 
 
210 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.672304  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  31.5 
 
 
206 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3537  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.57 
 
 
208 aa  99.8  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.575737  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4239  threonine efflux system  30.85 
 
 
206 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.588967  normal  0.890135 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3973  threonine efflux system  31 
 
 
206 aa  99.4  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4346  threonine efflux system  30.85 
 
 
206 aa  99  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.459932  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1147  transporter, LysE family  32.66 
 
 
210 aa  99  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4188  threonine efflux system  30.85 
 
 
206 aa  99  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4286  threonine efflux system  30.85 
 
 
206 aa  99  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.492935 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4344  threonine efflux system  29.08 
 
 
204 aa  99  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4167  threonine efflux system  30.85 
 
 
206 aa  99  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03702  threonine efflux system  29.08 
 
 
206 aa  98.6  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03651  hypothetical protein  29.08 
 
 
206 aa  98.6  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4190  threonine efflux system  29.08 
 
 
206 aa  98.6  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2431  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.97 
 
 
209 aa  98.6  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4156  homoserine/threonine efflux pump  29.08 
 
 
206 aa  98.2  7e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1435  amino acid transporter LysE  29.05 
 
 
210 aa  98.2  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.410501  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5264  threonine efflux system  29.08 
 
 
204 aa  98.2  7e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.613043 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0418  lysine exporter protein LysE/YggA  32.37 
 
 
213 aa  97.4  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003257  threonine efflux protein  30.48 
 
 
211 aa  97.4  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4290  threonine efflux system  28.57 
 
 
206 aa  97.8  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4047  threonine efflux system  28.57 
 
 
204 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1814  lysine exporter protein LysE/YggA  31.63 
 
 
205 aa  97.4  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000397951  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4185  threonine efflux system  28.57 
 
 
206 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3113  lysine exporter protein LysE/YggA  32.8 
 
 
209 aa  96.7  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.050755  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3976  lysine exporter protein LysE/YggA  30.16 
 
 
205 aa  95.1  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0078  amino acid efflux protein  30.85 
 
 
205 aa  94.4  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06605  putative threonine efflux protein  30.48 
 
 
203 aa  93.2  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3488  lysine exporter protein LysE/YggA  30.43 
 
 
223 aa  93.2  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1219  hypothetical protein  31.89 
 
 
219 aa  92.8  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0194  threonine efflux system  29.7 
 
 
208 aa  92.8  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.331917  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3997  threonine efflux system  29.35 
 
 
206 aa  92.4  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0219  threonine efflux system  29.35 
 
 
206 aa  92.4  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0556  threonine efflux system  29.35 
 
 
206 aa  92.4  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1227  lysine exporter protein LysE/YggA  37.1 
 
 
207 aa  92.4  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1213  hypothetical protein  32.09 
 
 
219 aa  91.7  6e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1050  lysine exporter protein LysE/YggA  34.24 
 
 
204 aa  91.3  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2461  lysine exporter protein LysE/YggA  30.14 
 
 
210 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283309  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3521  lysine exporter family protein (LysE/YggA)  48.96 
 
 
118 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.561475  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5915  LysE family transporter  28.79 
 
 
204 aa  90.5  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.723016 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5694  lysine exporter protein LysE/YggA  30.21 
 
 
205 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3644  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.26 
 
 
204 aa  89.4  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0009  lysine exporter protein LysE/YggA  26.03 
 
 
245 aa  89  5e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0108149 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>