More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0721 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0721  amino acid efflux pump, RhtB family protein  100 
 
 		 205 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.914234  normal  0.346615 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7118  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  67.8 
 
 		 205 aa  268  4e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0100  lysine exporter protein LysE/YggA  32.99 
 
 		 213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3097  lysine exporter protein LysE/YggA  35 
 
 		 215 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3293  threonine efflux protein, putative  33.99 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0428  LysE type translocator  33.99 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0377494  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2959  putative threonine efflux protein  33.99 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2129  putative threonine efflux protein  33.99 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3387  putative threonine efflux protein  33.99 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0246  LysE family translocator protein  33.99 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6400  lysine exporter protein LysE/YggA  35 
 
 		 215 aa  112  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.436888 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2239  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.45 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.678713  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0468  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.1 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.521562  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5142  lysine exporter protein LysE/YggA  36.81 
 
 		 204 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2963  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1476  lysine exporter protein LysE/YggA  35.68 
 
 		 212 aa  102  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2617  lysine exporter protein LysE/YggA  35.16 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.635296 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6764  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.85 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406386  normal  0.273065 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5115  lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.29 
 
 		 203 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.127177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  29.23 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2743  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 		 214 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0265185  normal  0.024176 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0194  threonine efflux system  30.26 
 
 		 207 aa  97.1  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6693  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.43 
 
 		 190 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2958  threonine efflux protein  31.44 
 
 		 214 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10248  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0233  RhtB family transporter  30.85 
 
 		 209 aa  95.5  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5054  lysine exporter protein LysE/YggA  32.02 
 
 		 212 aa  95.5  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199833  normal  0.295211 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4344  threonine efflux system  29.74 
 
 		 204 aa  95.1  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4978  lysine exporter protein LysE/YggA  33.51 
 
 		 207 aa  95.1  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4047  threonine efflux system  29.74 
 
 		 204 aa  94.7  8e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03702  threonine efflux system  29.74 
 
 		 206 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5264  threonine efflux system  29.74 
 
 		 204 aa  94.4  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.613043 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4185  threonine efflux system  29.74 
 
 		 206 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4290  threonine efflux system  29.74 
 
 		 206 aa  94.7  9e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03651  hypothetical protein  29.74 
 
 		 206 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4190  threonine efflux system  29.74 
 
 		 206 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587316 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4156  homoserine/threonine efflux pump  29.74 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4239  threonine efflux system  30.1 
 
 		 206 aa  94  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.588967  normal  0.890135 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0219  threonine efflux system  28.72 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0556  threonine efflux system  28.72 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2779  amino acid efflux pump, RhtB family protein  31.38 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000004006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4188  threonine efflux system  30.1 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4167  threonine efflux system  30.1 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4346  threonine efflux system  30.1 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.459932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4286  threonine efflux system  30.1 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.492935 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3997  threonine efflux system  28.21 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0194  threonine efflux system  28.64 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.331917  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3973  threonine efflux system  30.1 
 
 		 206 aa  92.8  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0936  lysine exporter protein LysE/YggA  29.56 
 
 		 212 aa  92.4  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.950459  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2347  lysine exporter protein LysE/YggA  32.46 
 
 		 207 aa  91.3  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1227  lysine exporter protein LysE/YggA  34.95 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1849  amino acid transporter LysE  28.57 
 
 		 212 aa  89  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.402974  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1920  amino acid transporter LysE  28.57 
 
 		 212 aa  89  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5396  lysine exporter protein LysE/YggA  30.43 
 
 		 212 aa  89.4  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3556  lysine exporter protein LysE/YggA  30.43 
 
 		 212 aa  89  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.384892 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5270  lysine exporter protein LysE/YggA  37.36 
 
 		 204 aa  89  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27713  normal  0.342162 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0078  amino acid efflux protein  29.27 
 
 		 205 aa  88.2  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5524  lysine exporter protein LysE/YggA  33.49 
 
 		 212 aa  88.2  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0728137  normal  0.0390592 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3450  lysine exporter protein LysE/YggA  36.63 
 
 		 204 aa  87.8  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.270784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6091  lysine exporter protein LysE/YggA  28.8 
 
 		 209 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0972486  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1986  lysine exporter protein LysE/YggA  28.8 
 
 		 209 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.5 
 
 		 212 aa  86.7  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2939  lysine exporter protein LysE/YggA  31.55 
 
 		 214 aa  86.7  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2460  lysine exporter protein LysE/YggA  31.52 
 
 		 212 aa  85.5  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2796  lysine exporter protein LysE/YggA  28.78 
 
 		 214 aa  85.1  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3963  threonine efflux system  27.64 
 
 		 207 aa  84.7  9e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245678  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4718  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28 
 
 		 206 aa  84.7  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.721084 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0856  lysine exporter protein LysE/YggA  29.15 
 
 		 200 aa  84.7  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.985682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4153  threonine efflux system  27.64 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000179823  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7385  putative threonine efflux protein  32.96 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0325259  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2431  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.66 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4711  lysine exporter protein LysE/YggA  30.98 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1218  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43570  hypothetical protein  29.5 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.443465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3652  lysine exporter protein LysE/YggA  30.98 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3869  lysine exporter protein LysE/YggA  30.98 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.61339 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003257  threonine efflux protein  27.32 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3653  hypothetical protein  28.77 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4118  RhtB family transporter  26.83 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0234  LysE type translocator  30.05 
 
 		 173 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0377259  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3113  lysine exporter protein LysE/YggA  31.49 
 
 		 209 aa  81.3  0.000000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.050755  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0912  lysine exporter protein LysE/YggA  28.9 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.44 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0596  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.21 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.05 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.295219  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4482  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.61 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0717  lysine exporter protein LysE/YggA  24.34 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0989  lysine exporter protein LysE/YggA  32.67 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0493  lysine exporter protein LysE/YggA  27.27 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2461  lysine exporter protein LysE/YggA  30.58 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5674  lysine exporter protein LysE/YggA  28.87 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6038  lysine exporter protein LysE/YggA  28.87 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06605  putative threonine efflux protein  27.14 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0111  hypothetical protein  28.87 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3644  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.23 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  27.32 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2828  lysine exporter protein LysE/YggA  31.58 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192947  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2843  lysine exporter protein LysE/YggA  31.66 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1800  threonine efflux protein, putative  27.23 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6528  lysine exporter protein LysE/YggA  28.87 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2701  lysine exporter protein LysE/YggA  31.66 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.224581 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4194  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.47 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>