More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_6091 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008062  Bcen_6091  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 209 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0972486  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1986  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 209 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4166  lysine exporter protein LysE/YggA  55.45 
 
 		 212 aa  217  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77037  normal  0.273019 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3295  lysine exporter protein LysE/YggA  50.5 
 
 		 213 aa  209  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2794  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  56.44 
 
 		 204 aa  191  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.940238  normal  0.870805 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5077  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  50.25 
 
 		 208 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5879  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.12 
 
 		 212 aa  174  8e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3407  lysine exporter protein LysE/YggA  46.12 
 
 		 210 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2075  amino acid efflux pump, RhtB family protein  46.34 
 
 		 212 aa  171  9e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.400632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5239  lysine exporter protein LysE/YggA  45.63 
 
 		 210 aa  171  9e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3132  lysine exporter protein LysE/YggA  45.85 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2697  lysine exporter protein LysE/YggA  43.9 
 
 		 210 aa  164  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4060  lysine exporter protein LysE/YggA  44.88 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3461  lysine exporter protein LysE/YggA  44.88 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4336  RhtB family transporter  44.5 
 
 		 212 aa  154  8e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0418  lysine exporter protein LysE/YggA  42.5 
 
 		 213 aa  137  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0857  lysine exporter protein LysE/YggA  40.22 
 
 		 213 aa  117  7.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.154499  normal  0.0418461 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0912  lysine exporter protein LysE/YggA  36.08 
 
 		 213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0519  lysine exporter protein LysE/YggA  37.37 
 
 		 198 aa  96.3  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2845  hypothetical protein  34.85 
 
 		 209 aa  95.1  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.85185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0721  amino acid efflux pump, RhtB family protein  28.8 
 
 		 205 aa  87.8  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.914234  normal  0.346615 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0858  lysine exporter protein LysE/YggA  31.35 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.74992  normal  0.0747821 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4239  threonine efflux system  28.5 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.588967  normal  0.890135 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3973  threonine efflux system  30.77 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4167  threonine efflux system  28.5 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4188  threonine efflux system  28.5 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4346  threonine efflux system  28.5 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.459932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4286  threonine efflux system  28.5 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.492935 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1147  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.17 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2239  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.5 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.678713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7118  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.8 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0914  amino acid efflux protein, putative  33.51 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02476  hypothetical protein  26.6 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  26.83 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1611  lysine exporter protein LysE/YggA  26.11 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0311017  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4344  threonine efflux system  28.28 
 
 		 204 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0194  threonine efflux system  26.83 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0823  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000549104  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03702  threonine efflux system  27.64 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4190  threonine efflux system  27.64 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587316 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.5 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03651  hypothetical protein  27.64 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4290  threonine efflux system  27.64 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4185  threonine efflux system  27.64 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4047  threonine efflux system  27.64 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1421  lysine exporter protein LysE/YggA  30.29 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4156  homoserine/threonine efflux pump  27.64 
 
 		 206 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0246  LysE family translocator protein  32.09 
 
 		 217 aa  72  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3293  threonine efflux protein, putative  32.09 
 
 		 217 aa  72  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5264  threonine efflux system  27.64 
 
 		 204 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.613043 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0428  LysE type translocator  32.09 
 
 		 217 aa  72  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0377494  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3387  putative threonine efflux protein  32.09 
 
 		 217 aa  72  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2129  putative threonine efflux protein  32.09 
 
 		 217 aa  72  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2959  putative threonine efflux protein  32.09 
 
 		 217 aa  72  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.16 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08451  hypothetical protein  29.19 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  30.99 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1031  hypothetical protein  27.27 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.332162  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0100  lysine exporter protein LysE/YggA  32.21 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.63 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1470  lysine exporter protein LysE/YggA  35.66 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2701  lysine exporter protein LysE/YggA  30.99 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.224581 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  30.71 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0798  lysine exporter protein LysE/YggA  30.62 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0005  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.17 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.610199  normal  0.647138 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2843  lysine exporter protein LysE/YggA  30.99 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003627  putative threonine efflux protein  25.87 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.78 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0219  threonine efflux system  28.93 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0556  threonine efflux system  28.93 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2347  lysine exporter protein LysE/YggA  31.5 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3997  threonine efflux system  28.93 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1476  lysine exporter protein LysE/YggA  31.43 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  31.16 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  31.16 
 
 		 227 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7385  putative threonine efflux protein  32.1 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0325259  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.77 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  31.16 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  29.85 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6400  lysine exporter protein LysE/YggA  32.49 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.436888 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0194  threonine efflux system  28.37 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.331917  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  30.43 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  26.85 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3099  LysE family protein  30.43 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2950  LysE family protein  30.43 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  30.43 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  30.43 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  26.85 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1522  LysE family protein  30.43 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0068  LysE family protein  30.43 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  30.43 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  26.85 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  35.25 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  26.85 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  29.44 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  26.85 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  26.85 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0945  lysine exporter protein LysE/YggA  29.63 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3963  threonine efflux system  25.85 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245678  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  32.39 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>