More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3295 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3295  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
213 aa  417  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4166  lysine exporter protein LysE/YggA  71.56 
 
 
212 aa  303  1.0000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77037  normal  0.273019 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5077  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  64.39 
 
 
208 aa  250  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128072  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6091  lysine exporter protein LysE/YggA  50.5 
 
 
209 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0972486  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1986  lysine exporter protein LysE/YggA  50.5 
 
 
209 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2794  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  54.11 
 
 
204 aa  202  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.940238  normal  0.870805 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5239  lysine exporter protein LysE/YggA  46.83 
 
 
210 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446466  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2697  lysine exporter protein LysE/YggA  47.32 
 
 
210 aa  177  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3407  lysine exporter protein LysE/YggA  46.83 
 
 
210 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3132  lysine exporter protein LysE/YggA  46.83 
 
 
212 aa  168  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4060  lysine exporter protein LysE/YggA  45.37 
 
 
210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3461  lysine exporter protein LysE/YggA  45.37 
 
 
210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4336  RhtB family transporter  42.64 
 
 
212 aa  162  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2075  amino acid efflux pump, RhtB family protein  43.9 
 
 
212 aa  159  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.400632  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0418  lysine exporter protein LysE/YggA  45.59 
 
 
213 aa  159  4e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5879  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.39 
 
 
212 aa  157  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2845  hypothetical protein  36.23 
 
 
209 aa  125  6e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.85185  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0912  lysine exporter protein LysE/YggA  36.84 
 
 
213 aa  122  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0857  lysine exporter protein LysE/YggA  36.56 
 
 
213 aa  117  9e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.154499  normal  0.0418461 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0858  lysine exporter protein LysE/YggA  35.9 
 
 
211 aa  105  6e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.74992  normal  0.0747821 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0519  lysine exporter protein LysE/YggA  40.7 
 
 
198 aa  102  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3973  threonine efflux system  27.96 
 
 
206 aa  84.7  8e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4344  threonine efflux system  28.29 
 
 
204 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4239  threonine efflux system  28.86 
 
 
206 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.588967  normal  0.890135 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03702  threonine efflux system  28.29 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4286  threonine efflux system  28.86 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.492935 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03651  hypothetical protein  28.29 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4346  threonine efflux system  28.86 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.459932  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4167  threonine efflux system  28.86 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4190  threonine efflux system  28.29 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587316 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0194  threonine efflux system  29.47 
 
 
207 aa  82.4  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4188  threonine efflux system  28.86 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08451  hypothetical protein  38.46 
 
 
203 aa  82.4  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4156  homoserine/threonine efflux pump  28.78 
 
 
206 aa  82  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5264  threonine efflux system  28.78 
 
 
204 aa  82  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.613043 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4047  threonine efflux system  28.78 
 
 
204 aa  81.6  0.000000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4185  threonine efflux system  28.78 
 
 
206 aa  81.3  0.000000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4290  threonine efflux system  28.78 
 
 
206 aa  81.3  0.000000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1147  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.3 
 
 
208 aa  79.3  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6400  lysine exporter protein LysE/YggA  31.16 
 
 
215 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.436888 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2129  putative threonine efflux protein  28.89 
 
 
217 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3293  threonine efflux protein, putative  28.89 
 
 
217 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0246  LysE family translocator protein  28.89 
 
 
217 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0428  LysE type translocator  28.89 
 
 
217 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0377494  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2959  putative threonine efflux protein  28.89 
 
 
217 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3387  putative threonine efflux protein  28.89 
 
 
217 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2925  amino acid transporter LysE  31.79 
 
 
209 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0920317  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3097  lysine exporter protein LysE/YggA  29.8 
 
 
215 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0405  putative transport protein  29.95 
 
 
210 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000145475 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0399  putative transport protein  30.81 
 
 
210 aa  75.9  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0396  putative transport protein  29.95 
 
 
210 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979225  hitchhiker  0.00000000000454708 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0459  putative transport protein  29.95 
 
 
210 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000321828 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0417  putative transport protein  29.95 
 
 
210 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0194  threonine efflux system  27.4 
 
 
208 aa  75.9  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.331917  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0929  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.57 
 
 
209 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3997  threonine efflux system  27.62 
 
 
206 aa  75.5  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0219  threonine efflux system  27.62 
 
 
206 aa  75.1  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0823  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.02 
 
 
208 aa  75.1  0.0000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000549104  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0556  threonine efflux system  27.62 
 
 
206 aa  75.1  0.0000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2743  lysine exporter protein LysE/YggA  30.46 
 
 
214 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0265185  normal  0.024176 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.91 
 
 
218 aa  74.7  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2958  threonine efflux protein  30.46 
 
 
214 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10248  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  27.05 
 
 
206 aa  74.7  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2572  hypothetical protein  28.27 
 
 
222 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0394  putative homoserine/threonine efflux protein  28.08 
 
 
222 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00283  neutral amino-acid efflux system  28.08 
 
 
223 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3278  homoserine/threonine efflux pump  28.08 
 
 
223 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  31.25 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00287  hypothetical protein  28.08 
 
 
223 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0352  putative homoserine/threonine efflux protein  28.08 
 
 
215 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3296  homoserine/threonine efflux pump  28.08 
 
 
223 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0399  putative homoserine/threonine efflux protein  27.59 
 
 
223 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0359  putative homoserine/threonine efflux protein  27.09 
 
 
210 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.672304  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1421  lysine exporter protein LysE/YggA  33.09 
 
 
207 aa  71.6  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4718  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.71 
 
 
206 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.721084 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0100  lysine exporter protein LysE/YggA  30.65 
 
 
213 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4247  putative homoserine/threonine efflux protein  25.39 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000239469 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2347  lysine exporter protein LysE/YggA  30.1 
 
 
207 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3963  threonine efflux system  25.96 
 
 
207 aa  70.1  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245678  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4978  lysine exporter protein LysE/YggA  30.1 
 
 
207 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2862  lysine exporter protein LysE/YggA  28.18 
 
 
213 aa  69.3  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5054  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199833  normal  0.295211 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1701  amino acid transporter LysE  24.87 
 
 
208 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0912104  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  27.83 
 
 
203 aa  68.6  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  23.76 
 
 
209 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  27.83 
 
 
211 aa  68.2  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4153  threonine efflux system  25.48 
 
 
207 aa  68.2  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000179823  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.71 
 
 
208 aa  68.2  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1925  putative homoserine/threonine efflux protein  26.4 
 
 
208 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82308e-38 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1730  amino acid transporter LysE  23.79 
 
 
208 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000126843  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0976  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.21 
 
 
209 aa  67.4  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.81 
 
 
207 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2963  lysine exporter protein LysE/YggA  29.8 
 
 
215 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0009  lysine exporter protein LysE/YggA  23.4 
 
 
245 aa  67.8  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0108149 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0856  lysine exporter protein LysE/YggA  29.69 
 
 
200 aa  67.8  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.985682  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1744  lysine exporter protein LysE/YggA  25.73 
 
 
208 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0257251  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2239  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.72 
 
 
204 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.678713  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1611  lysine exporter protein LysE/YggA  26.18 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0311017  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4520  lysine exporter protein LysE/YggA  31.43 
 
 
211 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286419  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  30.48 
 
 
211 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>