More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3132 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3132  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 212 aa  412  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5239  lysine exporter protein LysE/YggA  59.72 
 
 		 210 aa  241  7e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3407  lysine exporter protein LysE/YggA  59.72 
 
 		 210 aa  240  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2697  lysine exporter protein LysE/YggA  59.72 
 
 		 210 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5879  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  63.41 
 
 		 212 aa  229  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2075  amino acid efflux pump, RhtB family protein  59.43 
 
 		 212 aa  221  7e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.400632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4060  lysine exporter protein LysE/YggA  59.33 
 
 		 210 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3461  lysine exporter protein LysE/YggA  59.33 
 
 		 210 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6091  lysine exporter protein LysE/YggA  45.85 
 
 		 209 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0972486  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1986  lysine exporter protein LysE/YggA  45.85 
 
 		 209 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3295  lysine exporter protein LysE/YggA  46.83 
 
 		 213 aa  180  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4166  lysine exporter protein LysE/YggA  46.83 
 
 		 212 aa  173  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77037  normal  0.273019 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5077  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.17 
 
 		 208 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128072  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2794  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.71 
 
 		 204 aa  144  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.940238  normal  0.870805 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4336  RhtB family transporter  43.72 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0418  lysine exporter protein LysE/YggA  39.11 
 
 		 213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0912  lysine exporter protein LysE/YggA  39.41 
 
 		 213 aa  125  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2845  hypothetical protein  36.95 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.85185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0857  lysine exporter protein LysE/YggA  38.71 
 
 		 213 aa  104  9e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.154499  normal  0.0418461 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0856  lysine exporter protein LysE/YggA  31.68 
 
 		 200 aa  87.8  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.985682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0858  lysine exporter protein LysE/YggA  33.68 
 
 		 211 aa  86.3  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.74992  normal  0.0747821 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1476  lysine exporter protein LysE/YggA  36.41 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2958  threonine efflux protein  35.42 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10248  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2743  lysine exporter protein LysE/YggA  35.42 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0265185  normal  0.024176 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4344  threonine efflux system  30.65 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4239  threonine efflux system  30.65 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.588967  normal  0.890135 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03702  threonine efflux system  30.15 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4346  threonine efflux system  30.65 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.459932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4167  threonine efflux system  30.65 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4286  threonine efflux system  30.65 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.492935 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4190  threonine efflux system  30.15 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587316 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03651  hypothetical protein  30.15 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4185  threonine efflux system  30.15 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4290  threonine efflux system  30.15 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4188  threonine efflux system  30.65 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5264  threonine efflux system  30.15 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.613043 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4156  homoserine/threonine efflux pump  30.15 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4047  threonine efflux system  30.15 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3537  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.69 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.575737  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3097  lysine exporter protein LysE/YggA  36.44 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7385  putative threonine efflux protein  33.88 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0325259  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0194  threonine efflux system  28.57 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0976  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.65 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0100  lysine exporter protein LysE/YggA  32.84 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3973  threonine efflux system  28.64 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6400  lysine exporter protein LysE/YggA  34.67 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.436888 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1071  putative RhtB protein  31.41 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4482  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.45 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.65 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  29.65 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0519  lysine exporter protein LysE/YggA  36.45 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0721  amino acid efflux pump, RhtB family protein  28 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.914234  normal  0.346615 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4153  threonine efflux system  31.19 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000179823  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  27.78 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3997  threonine efflux system  28.21 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  27.78 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  29.5 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0556  threonine efflux system  28.21 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0219  threonine efflux system  28.21 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2542  lysine exporter protein LysE/YggA  30.56 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.671872  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  27.78 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0194  threonine efflux system  29.29 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.331917  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  27.78 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6693  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.53 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0289  RhtB family transporter  33.33 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3963  threonine efflux system  31.19 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245678  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0399  putative transport protein  28 
 
 		 210 aa  72  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0405  putative transport protein  28 
 
 		 210 aa  72  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000145475 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0459  putative transport protein  28 
 
 		 210 aa  72  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321828 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0417  putative transport protein  28 
 
 		 210 aa  72  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0396  putative transport protein  28 
 
 		 210 aa  72  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979225  hitchhiker  0.00000000000454708 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7118  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.44 
 
 		 205 aa  72  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  29 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0468  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.14 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.521562  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1350  amino acid efflux pump, RhtB family protein  32.99 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641415  normal  0.0201928 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  27.55 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0992  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.46 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.78 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5270  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.16 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.912842 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1017  lysine exporter protein LysE/YggA  29.17 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000020336  hitchhiker  0.001054 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2416  RhtB family transporter  35.23 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6764  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.69 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406386  normal  0.273065 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0233  RhtB family transporter  27.23 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2572  hypothetical protein  28.27 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1555  putative LysE family amino-acid efflux protein  32.2 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  30.81 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003257  threonine efflux protein  26.46 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3181  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.12 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.170342  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0827  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.32 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.282435 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5270  lysine exporter protein LysE/YggA  32.95 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27713  normal  0.342162 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3387  putative threonine efflux protein  34.45 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3293  threonine efflux protein, putative  34.45 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2276  amino acid transporter  29.58 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0428  LysE type translocator  34.45 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0377494  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0246  LysE family translocator protein  34.45 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2862  lysine exporter protein LysE/YggA  34.02 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3653  hypothetical protein  29.56 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4996  lysine exporter protein LysE/YggA  31.16 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.53634 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2129  putative threonine efflux protein  34.45 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5054  lysine exporter protein LysE/YggA  30.39 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199833  normal  0.295211 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>