More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1017 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1017  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 218 aa  428  1e-119  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000020336  hitchhiker  0.001054 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0810  leucine export protein LeuE  48.37 
 
 		 219 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1168  leucine export protein LeuE  49.54 
 
 		 223 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.950564  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1291  leucine export protein LeuE  48.37 
 
 		 219 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62920  leucine export protein LeuE  48.84 
 
 		 216 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1371  leucine export protein LeuE  48.86 
 
 		 222 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0655348  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5477  leucine export protein LeuE  48.84 
 
 		 216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2029  leucine export protein LeuE  49.77 
 
 		 219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1412  leucine export protein LeuE  48.61 
 
 		 222 aa  196  3e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.250602 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1262  leucine export protein LeuE  47.44 
 
 		 219 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00908947  normal  0.254179 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4433  leucine export protein LeuE  48.15 
 
 		 219 aa  192  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0518339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1180  leucine export protein LeuE  48.17 
 
 		 223 aa  190  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1324  leucine export protein LeuE  50.52 
 
 		 222 aa  188  5e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0341072  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1018  lysine exporter protein  52.31 
 
 		 218 aa  186  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  0.285378 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2005  leucine export protein LeuE  48.44 
 
 		 226 aa  185  5e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.214703  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2194  leucine export protein LeuE  45.58 
 
 		 223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.250499  normal  0.121922 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0586  leucine export protein LeuE  49.47 
 
 		 220 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117669  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0771  leucine export protein LeuE  49.47 
 
 		 220 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.398532  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1914  leucine export protein LeuE  47.93 
 
 		 216 aa  179  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250271  normal  0.498691 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1609  leucine export protein LeuE  49.47 
 
 		 220 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0565  leucine export protein LeuE  49.47 
 
 		 220 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1282  leucine export protein LeuE  49.47 
 
 		 220 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324732  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1506  leucine export protein LeuE  49.47 
 
 		 220 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.619764  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1476  leucine export protein LeuE  49.47 
 
 		 220 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2176  leucine export protein LeuE  47.25 
 
 		 227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.902588  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1727  leucine export protein LeuE  46.3 
 
 		 224 aa  177  8e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.859689 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2035  leucine export protein LeuE  46.3 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2782  leucine export protein LeuE  48.4 
 
 		 219 aa  174  7e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1520  leucine export protein LeuE  45.83 
 
 		 220 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3114  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.08 
 
 		 224 aa  168  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.683402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0986  leucine export protein LeuE  44.55 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4188  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.93 
 
 		 216 aa  162  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34113  normal  0.0417151 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3181  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.7 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.170342  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2092  leucine export protein LeuE  42.79 
 
 		 212 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0133634  hitchhiker  0.00000159654 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1375  leucine export protein LeuE  42.79 
 
 		 212 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000252722  hitchhiker  0.0000730997 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1911  leucine export protein LeuE  42.79 
 
 		 212 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000808789  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1391  leucine export protein LeuE  42.79 
 
 		 212 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.036985  normal  0.343779 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1359  leucine export protein LeuE  41.86 
 
 		 212 aa  154  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0105441  normal  0.312431 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01768  neutral amino-acid efflux system  40.93 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01756  hypothetical protein  40.93 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2918  leucine export protein LeuE  39.25 
 
 		 211 aa  153  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.438377 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1845  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.47 
 
 		 212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1835  leucine export protein LeuE  40.47 
 
 		 212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.966652  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1886  leucine export protein LeuE  40.47 
 
 		 212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1390  leucine export protein LeuE  40.47 
 
 		 212 aa  152  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2524  leucine export protein LeuE  40.47 
 
 		 212 aa  152  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2024  leucine export protein LeuE  40.47 
 
 		 212 aa  152  4e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000174933  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2293  leucine export protein LeuE  37.91 
 
 		 211 aa  150  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.993752  normal  0.789702 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0660  lysine exporter protein LysE/YggA  39.91 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1065  lysine exporter protein LysE/YggA  33.96 
 
 		 204 aa  115  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.180582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4198  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 203 aa  115  6.9999999999999995e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000025376 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4028  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.24 
 
 		 209 aa  113  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.180103 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  32.08 
 
 		 210 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1277  lysine exporter protein LysE/YggA  29.63 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.476992 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1248  amino acid transporter LysE  29.63 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.483142 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  32.08 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0048  lysine exporter protein LysE/YggA  31.6 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4604  lysine exporter protein LysE/YggA  28.77 
 
 		 203 aa  109  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0053  lysine exporter protein LysE/YggA  31.02 
 
 		 204 aa  109  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0047  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.7 
 
 		 204 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.743196  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0028  lysine exporter protein LysE/YggA  30.7 
 
 		 204 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.214928 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3385  lysine exporter protein LysE/YggA  32.08 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201071 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4143  lysine exporter protein LysE/YggA  29.72 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  36.57 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3931  amino acid transporter LysE  32.86 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  32.72 
 
 		 217 aa  102  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1303  amino acid transporter LysE  28.71 
 
 		 201 aa  102  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.520276  normal  0.253886 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  31.39 
 
 		 217 aa  102  6e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.58 
 
 		 218 aa  101  8e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6476  lysine exporter protein LysE/YggA  29.63 
 
 		 211 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.772782 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  31.34 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  28.77 
 
 		 211 aa  99.4  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  28.77 
 
 		 211 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  28.77 
 
 		 211 aa  99.4  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  28.77 
 
 		 211 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  28.77 
 
 		 211 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  28.77 
 
 		 211 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0065  lysine exporter protein LysE/YggA  29.52 
 
 		 208 aa  99  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.969114 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.52 
 
 		 218 aa  98.2  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  28.77 
 
 		 211 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0075  lysine exporter protein LysE/YggA  30.48 
 
 		 208 aa  94.7  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0037  lysine exporter protein LysE/YggA  27.36 
 
 		 214 aa  94.7  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.91 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0311  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.09 
 
 		 214 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  29.05 
 
 		 215 aa  92.8  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  28.3 
 
 		 211 aa  93.2  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3141  lysine exporter protein LysE/YggA  29.63 
 
 		 213 aa  92  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.514565  normal  0.554318 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0047  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.16 
 
 		 204 aa  91.7  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2511  lysine exporter protein LysE/YggA  29.17 
 
 		 213 aa  91.7  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3125  lysine exporter protein LysE/YggA  29.17 
 
 		 213 aa  91.7  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.298747  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2925  amino acid transporter LysE  29.36 
 
 		 209 aa  91.3  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0920317  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3063  lysine exporter protein LysE/YggA  28.24 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3180  lysine exporter protein LysE/YggA  28.24 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.920743  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1754  lysine exporter protein LysE/YggA  27.55 
 
 		 211 aa  88.2  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.335434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.33 
 
 		 212 aa  87.8  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3399  lysine exporter protein LysE/YggA  29.3 
 
 		 221 aa  87.8  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944216  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4414  amino acid efflux pump, RhtB family protein  30 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.897061 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  30.53 
 
 		 213 aa  86.7  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1238  lysine exporter protein LysE/YggA  29.25 
 
 		 212 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0801686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.33 
 
 		 208 aa  86.3  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>