More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0047 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0047  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 		 204 aa  394  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1065  lysine exporter protein LysE/YggA  78.43 
 
 		 204 aa  311  4.999999999999999e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.180582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0047  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  76.47 
 
 		 204 aa  310  1e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.743196  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0028  lysine exporter protein LysE/YggA  76.47 
 
 		 204 aa  310  1e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.214928 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0053  lysine exporter protein LysE/YggA  72.06 
 
 		 204 aa  298  5e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0065  lysine exporter protein LysE/YggA  77.23 
 
 		 208 aa  293  9e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.969114 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4604  lysine exporter protein LysE/YggA  67.98 
 
 		 203 aa  284  8e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0075  lysine exporter protein LysE/YggA  77.72 
 
 		 208 aa  281  6.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1303  amino acid transporter LysE  69.15 
 
 		 201 aa  279  2e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.520276  normal  0.253886 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0048  lysine exporter protein LysE/YggA  70.59 
 
 		 204 aa  271  7e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4143  lysine exporter protein LysE/YggA  65.37 
 
 		 205 aa  270  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1277  lysine exporter protein LysE/YggA  65.85 
 
 		 205 aa  269  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.476992 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1248  amino acid transporter LysE  65.37 
 
 		 255 aa  267  7e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.483142 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4198  lysine exporter protein LysE/YggA  59.9 
 
 		 203 aa  231  5e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000025376 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4028  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.08 
 
 		 209 aa  169  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.180103 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3399  lysine exporter protein LysE/YggA  40.1 
 
 		 221 aa  132  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944216  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2194  leucine export protein LeuE  35.24 
 
 		 223 aa  115  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.250499  normal  0.121922 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  32.11 
 
 		 217 aa  114  7.999999999999999e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1727  leucine export protein LeuE  36.49 
 
 		 224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.859689 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  32.11 
 
 		 217 aa  112  3e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2035  leucine export protein LeuE  36.02 
 
 		 224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2176  leucine export protein LeuE  34.58 
 
 		 227 aa  112  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.902588  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1359  leucine export protein LeuE  34.63 
 
 		 212 aa  111  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0105441  normal  0.312431 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1845  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.68 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1390  leucine export protein LeuE  32.68 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1375  leucine export protein LeuE  34.15 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000252722  hitchhiker  0.0000730997 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1886  leucine export protein LeuE  32.68 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2024  leucine export protein LeuE  32.68 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000174933  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1835  leucine export protein LeuE  32.68 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.966652  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  31.6 
 
 		 217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1911  leucine export protein LeuE  34.15 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000808789  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1391  leucine export protein LeuE  34.15 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.036985  normal  0.343779 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2092  leucine export protein LeuE  34.15 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0133634  hitchhiker  0.00000159654 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01768  neutral amino-acid efflux system  32.2 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1262  leucine export protein LeuE  33.81 
 
 		 219 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00908947  normal  0.254179 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01756  hypothetical protein  32.2 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1324  leucine export protein LeuE  34.67 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0341072  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0986  leucine export protein LeuE  33.7 
 
 		 225 aa  109  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4433  leucine export protein LeuE  34.27 
 
 		 219 aa  109  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0518339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2524  leucine export protein LeuE  32.2 
 
 		 212 aa  109  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0810  leucine export protein LeuE  33.81 
 
 		 219 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1168  leucine export protein LeuE  33.64 
 
 		 223 aa  108  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.950564  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1291  leucine export protein LeuE  33.81 
 
 		 219 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1017  lysine exporter protein LysE/YggA  31.16 
 
 		 218 aa  106  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000020336  hitchhiker  0.001054 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1018  lysine exporter protein  36.45 
 
 		 218 aa  105  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  0.285378 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2293  leucine export protein LeuE  35.58 
 
 		 211 aa  103  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.993752  normal  0.789702 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2918  leucine export protein LeuE  28.5 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.438377 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2029  leucine export protein LeuE  34.27 
 
 		 219 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1914  leucine export protein LeuE  35.07 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250271  normal  0.498691 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0771  leucine export protein LeuE  37.23 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.398532  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0586  leucine export protein LeuE  37.23 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117669  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1609  leucine export protein LeuE  37.23 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3114  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.38 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.683402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1506  leucine export protein LeuE  37.23 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.619764  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.29 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1476  leucine export protein LeuE  37.23 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0565  leucine export protein LeuE  37.23 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1282  leucine export protein LeuE  37.23 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324732  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1520  leucine export protein LeuE  35.29 
 
 		 220 aa  102  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1412  leucine export protein LeuE  32.41 
 
 		 222 aa  102  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.250602 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2782  leucine export protein LeuE  34.57 
 
 		 219 aa  102  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5477  leucine export protein LeuE  34.62 
 
 		 216 aa  101  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.67 
 
 		 211 aa  101  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1180  leucine export protein LeuE  32.24 
 
 		 223 aa  101  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5030  lysine exporter protein LysE/YggA  35.96 
 
 		 242 aa  101  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778866  normal  0.678911 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62920  leucine export protein LeuE  34.62 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  29.77 
 
 		 210 aa  97.8  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1371  leucine export protein LeuE  31.48 
 
 		 222 aa  97.8  9e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0655348  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4520  lysine exporter protein LysE/YggA  33.49 
 
 		 211 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2005  leucine export protein LeuE  32.11 
 
 		 226 aa  97.8  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.214703  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  30.88 
 
 		 208 aa  97.1  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.76 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  33.99 
 
 		 208 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0893485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6008  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.37 
 
 		 208 aa  95.9  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.435355 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4659  lysine exporter protein LysE/YggA  34.48 
 
 		 208 aa  95.5  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.80151  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3704  lysine exporter protein LysE/YggA  34.48 
 
 		 208 aa  95.5  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.326067  normal  0.173855 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2925  amino acid transporter LysE  27.27 
 
 		 209 aa  94.7  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0920317  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3591  lysine exporter protein LysE/YggA  34.31 
 
 		 209 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4686  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.41 
 
 		 216 aa  94.4  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5436  lysine exporter protein LysE/YggA  34.31 
 
 		 209 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2405  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 		 208 aa  93.2  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.69 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2358  putative lysine exporter protein  41.43 
 
 		 215 aa  93.2  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3931  amino acid transporter LysE  30.88 
 
 		 213 aa  92.4  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31 
 
 		 209 aa  91.7  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.19 
 
 		 211 aa  91.3  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  29.19 
 
 		 211 aa  91.3  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  29.19 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  29.19 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3206  lysine exporter protein LysE/YggA  36.68 
 
 		 208 aa  90.9  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.84476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4942  lysine exporter protein LysE/YggA  36.14 
 
 		 208 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.20679 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  29.19 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3040  lysine exporter protein LysE/YggA  36.14 
 
 		 208 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.408857  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  29.19 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3105  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5326  lysine exporter protein LysE/YggA  36.14 
 
 		 208 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.692371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.33 
 
 		 205 aa  90.5  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  33.99 
 
 		 216 aa  90.1  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  34.33 
 
 		 204 aa  89.7  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00299  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.34 
 
 		 204 aa  89.7  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>