More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4143 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4143  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 205 aa  407  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218888  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1248  amino acid transporter LysE  92.2 
 
 		 255 aa  384  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.483142 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1277  lysine exporter protein LysE/YggA  92.68 
 
 		 205 aa  384  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.476992 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4604  lysine exporter protein LysE/YggA  74.13 
 
 		 203 aa  300  1e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0053  lysine exporter protein LysE/YggA  66.34 
 
 		 204 aa  278  4e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1065  lysine exporter protein LysE/YggA  66.34 
 
 		 204 aa  268  2.9999999999999997e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.180582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0047  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  64.36 
 
 		 204 aa  268  4e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.743196  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0028  lysine exporter protein LysE/YggA  64.36 
 
 		 204 aa  268  4e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.214928 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1303  amino acid transporter LysE  65.5 
 
 		 201 aa  268  5e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.520276  normal  0.253886 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0065  lysine exporter protein LysE/YggA  68.63 
 
 		 208 aa  265  5e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.969114 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0048  lysine exporter protein LysE/YggA  64.36 
 
 		 204 aa  253  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0075  lysine exporter protein LysE/YggA  66.67 
 
 		 208 aa  247  8e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0047  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  65.37 
 
 		 204 aa  244  6.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4198  lysine exporter protein LysE/YggA  54.23 
 
 		 203 aa  228  3e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000025376 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4028  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.06 
 
 		 209 aa  176  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.180103 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3399  lysine exporter protein LysE/YggA  39.02 
 
 		 221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944216  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1262  leucine export protein LeuE  38.28 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00908947  normal  0.254179 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0810  leucine export protein LeuE  37.8 
 
 		 219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1291  leucine export protein LeuE  37.8 
 
 		 219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4433  leucine export protein LeuE  37.44 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0518339  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1845  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.5 
 
 		 212 aa  129  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1835  leucine export protein LeuE  33.5 
 
 		 212 aa  129  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.966652  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1886  leucine export protein LeuE  33.5 
 
 		 212 aa  129  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  33.96 
 
 		 217 aa  129  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2029  leucine export protein LeuE  36.49 
 
 		 219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1390  leucine export protein LeuE  33.01 
 
 		 212 aa  128  6e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1168  leucine export protein LeuE  37.09 
 
 		 223 aa  128  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.950564  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2024  leucine export protein LeuE  33.01 
 
 		 212 aa  128  6e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000174933  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01768  neutral amino-acid efflux system  32.52 
 
 		 212 aa  127  9.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01756  hypothetical protein  32.52 
 
 		 212 aa  127  9.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2524  leucine export protein LeuE  32.52 
 
 		 212 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 217 aa  126  3e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2782  leucine export protein LeuE  37.04 
 
 		 219 aa  124  9e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2194  leucine export protein LeuE  34.29 
 
 		 223 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.250499  normal  0.121922 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1391  leucine export protein LeuE  34.3 
 
 		 212 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.036985  normal  0.343779 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2092  leucine export protein LeuE  34.3 
 
 		 212 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0133634  hitchhiker  0.00000159654 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1359  leucine export protein LeuE  34.3 
 
 		 212 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0105441  normal  0.312431 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1911  leucine export protein LeuE  34.3 
 
 		 212 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000808789  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1375  leucine export protein LeuE  34.3 
 
 		 212 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000252722  hitchhiker  0.0000730997 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1506  leucine export protein LeuE  36.84 
 
 		 220 aa  121  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.619764  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1476  leucine export protein LeuE  36.84 
 
 		 220 aa  121  7e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1282  leucine export protein LeuE  36.84 
 
 		 220 aa  121  7e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324732  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0771  leucine export protein LeuE  36.84 
 
 		 220 aa  121  7e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.398532  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2176  leucine export protein LeuE  33.64 
 
 		 227 aa  121  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.902588  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1609  leucine export protein LeuE  36.84 
 
 		 220 aa  121  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0586  leucine export protein LeuE  36.84 
 
 		 220 aa  121  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117669  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0565  leucine export protein LeuE  36.84 
 
 		 220 aa  121  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  31.6 
 
 		 217 aa  121  8e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1180  leucine export protein LeuE  35.48 
 
 		 223 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2035  leucine export protein LeuE  35.88 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1727  leucine export protein LeuE  35.29 
 
 		 224 aa  116  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.859689 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62920  leucine export protein LeuE  34.13 
 
 		 216 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5477  leucine export protein LeuE  33.65 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1412  leucine export protein LeuE  33.18 
 
 		 222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.250602 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1371  leucine export protein LeuE  33.64 
 
 		 222 aa  111  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0655348  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1324  leucine export protein LeuE  33.5 
 
 		 222 aa  109  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0341072  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2918  leucine export protein LeuE  27.67 
 
 		 211 aa  108  5e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.438377 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1520  leucine export protein LeuE  33.53 
 
 		 220 aa  106  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1017  lysine exporter protein LysE/YggA  29.72 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000020336  hitchhiker  0.001054 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3114  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.64 
 
 		 224 aa  105  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.683402  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1018  lysine exporter protein  35.24 
 
 		 218 aa  105  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  0.285378 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2005  leucine export protein LeuE  34.56 
 
 		 226 aa  105  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.214703  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2293  leucine export protein LeuE  33.65 
 
 		 211 aa  102  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.993752  normal  0.789702 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1914  leucine export protein LeuE  33.96 
 
 		 216 aa  101  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250271  normal  0.498691 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7098  RhtB family transporter  34.36 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  30.66 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  35.32 
 
 		 206 aa  99.4  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2925  amino acid transporter LysE  28.85 
 
 		 209 aa  99  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0920317  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0986  leucine export protein LeuE  30.43 
 
 		 225 aa  98.6  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.84 
 
 		 209 aa  98.2  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  31.73 
 
 		 215 aa  97.4  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.68 
 
 		 208 aa  97.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.28 
 
 		 218 aa  96.7  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5030  lysine exporter protein LysE/YggA  31.41 
 
 		 242 aa  96.7  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778866  normal  0.678911 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.33 
 
 		 218 aa  95.9  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4188  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.24 
 
 		 216 aa  95.5  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34113  normal  0.0417151 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  30.88 
 
 		 208 aa  95.1  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1078  lysine exporter protein LysE/YggA  30.35 
 
 		 204 aa  95.1  6e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1238  lysine exporter protein LysE/YggA  30.33 
 
 		 212 aa  94  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0801686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0037  lysine exporter protein LysE/YggA  31.43 
 
 		 214 aa  93.2  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  31.41 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0893485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.01 
 
 		 211 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  29.47 
 
 		 211 aa  92.8  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  29.47 
 
 		 211 aa  92.8  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  29.47 
 
 		 211 aa  92.8  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1618  lysine exporter protein LysE/YggA  34.39 
 
 		 209 aa  92.8  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  29.47 
 
 		 211 aa  92.8  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3704  lysine exporter protein LysE/YggA  31.41 
 
 		 208 aa  92.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.326067  normal  0.173855 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4659  lysine exporter protein LysE/YggA  31.41 
 
 		 208 aa  92.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.80151  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  29.47 
 
 		 211 aa  92  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.47 
 
 		 211 aa  92  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.23 
 
 		 204 aa  92  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2456  putative homoserine/threonine efflux protein  30.58 
 
 		 210 aa  91.7  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.506268  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1394  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.71 
 
 		 207 aa  91.7  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.05 
 
 		 218 aa  91.7  7e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3206  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 		 208 aa  91.3  8e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.84476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  31.4 
 
 		 211 aa  91.7  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  30.39 
 
 		 211 aa  91.3  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2405  lysine exporter protein LysE/YggA  30.89 
 
 		 208 aa  90.9  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0577  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.1 
 
 		 219 aa  91.3  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>