More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1168 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1180  leucine export protein LeuE  99.1 
 
 		 223 aa  434  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1168  leucine export protein LeuE  100 
 
 		 223 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.950564  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0810  leucine export protein LeuE  95.96 
 
 		 219 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1291  leucine export protein LeuE  95.96 
 
 		 219 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1262  leucine export protein LeuE  95.52 
 
 		 219 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00908947  normal  0.254179 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4433  leucine export protein LeuE  94.17 
 
 		 219 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0518339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2029  leucine export protein LeuE  93.72 
 
 		 219 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2782  leucine export protein LeuE  88.34 
 
 		 219 aa  353  1e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1506  leucine export protein LeuE  88.39 
 
 		 220 aa  352  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.619764  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0771  leucine export protein LeuE  88.39 
 
 		 220 aa  352  2e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.398532  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1609  leucine export protein LeuE  88.39 
 
 		 220 aa  352  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1476  leucine export protein LeuE  88.39 
 
 		 220 aa  352  2e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1282  leucine export protein LeuE  88.39 
 
 		 220 aa  352  2e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324732  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0586  leucine export protein LeuE  88.39 
 
 		 220 aa  352  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117669  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0565  leucine export protein LeuE  88.39 
 
 		 220 aa  352  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2194  leucine export protein LeuE  67.57 
 
 		 223 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.250499  normal  0.121922 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1412  leucine export protein LeuE  65 
 
 		 222 aa  279  3e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.250602 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62920  leucine export protein LeuE  66.21 
 
 		 216 aa  278  4e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5477  leucine export protein LeuE  65.75 
 
 		 216 aa  277  8e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1371  leucine export protein LeuE  64.25 
 
 		 222 aa  277  1e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0655348  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2176  leucine export protein LeuE  67.27 
 
 		 227 aa  260  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.902588  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1914  leucine export protein LeuE  65.9 
 
 		 216 aa  258  7e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250271  normal  0.498691 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2035  leucine export protein LeuE  65.92 
 
 		 224 aa  256  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1520  leucine export protein LeuE  66.37 
 
 		 220 aa  254  9e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73556  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1727  leucine export protein LeuE  65.02 
 
 		 224 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.859689 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1324  leucine export protein LeuE  61.64 
 
 		 222 aa  240  1e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0341072  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1018  lysine exporter protein  61.11 
 
 		 218 aa  232  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  0.285378 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2005  leucine export protein LeuE  54.95 
 
 		 226 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.214703  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3181  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  62.15 
 
 		 215 aa  231  9e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.170342  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4188  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  57.14 
 
 		 216 aa  213  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34113  normal  0.0417151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3114  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  51.82 
 
 		 224 aa  211  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.683402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1017  lysine exporter protein LysE/YggA  49.54 
 
 		 218 aa  199  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000020336  hitchhiker  0.001054 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1845  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.23 
 
 		 212 aa  198  7e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1835  leucine export protein LeuE  46.23 
 
 		 212 aa  198  7e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.966652  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1886  leucine export protein LeuE  46.23 
 
 		 212 aa  198  7e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2024  leucine export protein LeuE  45.75 
 
 		 212 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000174933  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1390  leucine export protein LeuE  45.75 
 
 		 212 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547214  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01768  neutral amino-acid efflux system  45.28 
 
 		 212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1911  leucine export protein LeuE  47.64 
 
 		 212 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000808789  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2092  leucine export protein LeuE  47.64 
 
 		 212 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0133634  hitchhiker  0.00000159654 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1391  leucine export protein LeuE  47.64 
 
 		 212 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.036985  normal  0.343779 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1375  leucine export protein LeuE  47.64 
 
 		 212 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000252722  hitchhiker  0.0000730997 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01756  hypothetical protein  45.28 
 
 		 212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1359  leucine export protein LeuE  47.64 
 
 		 212 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0105441  normal  0.312431 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2524  leucine export protein LeuE  45.28 
 
 		 212 aa  196  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0986  leucine export protein LeuE  45.12 
 
 		 225 aa  195  5.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2918  leucine export protein LeuE  43.06 
 
 		 211 aa  189  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.438377 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2293  leucine export protein LeuE  42.92 
 
 		 211 aa  169  4e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.993752  normal  0.789702 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0660  lysine exporter protein LysE/YggA  43.46 
 
 		 226 aa  151  8.999999999999999e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1303  amino acid transporter LysE  37.09 
 
 		 201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.520276  normal  0.253886 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4143  lysine exporter protein LysE/YggA  37.09 
 
 		 205 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0053  lysine exporter protein LysE/YggA  37.38 
 
 		 204 aa  125  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.92 
 
 		 208 aa  124  8.000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1277  lysine exporter protein LysE/YggA  34.27 
 
 		 205 aa  121  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.476992 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1248  amino acid transporter LysE  34.27 
 
 		 255 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.483142 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4028  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.64 
 
 		 209 aa  119  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.180103 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  32.23 
 
 		 217 aa  119  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3931  amino acid transporter LysE  32.57 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3385  lysine exporter protein LysE/YggA  34.74 
 
 		 214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201071 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0028  lysine exporter protein LysE/YggA  34.58 
 
 		 204 aa  116  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.214928 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0047  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.58 
 
 		 204 aa  116  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.743196  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1065  lysine exporter protein LysE/YggA  35.81 
 
 		 204 aa  115  6e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.180582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  30.88 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4520  lysine exporter protein LysE/YggA  35.98 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.84 
 
 		 209 aa  113  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  31.92 
 
 		 217 aa  112  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4604  lysine exporter protein LysE/YggA  33.18 
 
 		 203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.79 
 
 		 218 aa  111  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0048  lysine exporter protein LysE/YggA  35.05 
 
 		 204 aa  111  9e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  33.02 
 
 		 203 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  31.34 
 
 		 217 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.18 
 
 		 218 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  30.7 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.7 
 
 		 211 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4198  lysine exporter protein LysE/YggA  32.7 
 
 		 203 aa  106  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000025376 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  30.7 
 
 		 211 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  30.7 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  30.7 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0065  lysine exporter protein LysE/YggA  33.64 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.969114 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  30.7 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  33.33 
 
 		 215 aa  105  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.65 
 
 		 218 aa  105  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  30.7 
 
 		 211 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0075  lysine exporter protein LysE/YggA  35 
 
 		 208 aa  102  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  30.7 
 
 		 211 aa  102  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  31.5 
 
 		 210 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  31.5 
 
 		 210 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  31 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  31.63 
 
 		 210 aa  99.8  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0131  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.74 
 
 		 216 aa  99.4  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6476  lysine exporter protein LysE/YggA  30.7 
 
 		 211 aa  98.6  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.772782 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  30.61 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6008  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 		 208 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.435355 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.66 
 
 		 211 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1194  amino acid transporter LysE  34.01 
 
 		 206 aa  96.3  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00235397  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  32.41 
 
 		 208 aa  96.3  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3399  lysine exporter protein LysE/YggA  32.55 
 
 		 221 aa  96.3  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944216  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0577  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.32 
 
 		 219 aa  96.3  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4414  amino acid efflux pump, RhtB family protein  32.09 
 
 		 213 aa  95.9  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.897061 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  31.02 
 
 		 208 aa  95.5  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.272931  normal  0.707068 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>