More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1371 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1371  leucine export protein LeuE  100 
 
 
222 aa  430  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0655348  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1412  leucine export protein LeuE  92.27 
 
 
222 aa  390  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.250602 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1168  leucine export protein LeuE  64.25 
 
 
223 aa  277  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.950564  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0810  leucine export protein LeuE  64.71 
 
 
219 aa  275  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1291  leucine export protein LeuE  64.71 
 
 
219 aa  275  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1262  leucine export protein LeuE  63.8 
 
 
219 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00908947  normal  0.254179 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4433  leucine export protein LeuE  63.96 
 
 
219 aa  271  6e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0518339  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1180  leucine export protein LeuE  64.25 
 
 
223 aa  266  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62920  leucine export protein LeuE  63.89 
 
 
216 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5477  leucine export protein LeuE  63.43 
 
 
216 aa  259  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2029  leucine export protein LeuE  64.57 
 
 
219 aa  255  4e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278253  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2194  leucine export protein LeuE  59.09 
 
 
223 aa  250  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.250499  normal  0.121922 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1018  lysine exporter protein  63.72 
 
 
218 aa  242  3e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  0.285378 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2035  leucine export protein LeuE  61.4 
 
 
224 aa  241  7e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2176  leucine export protein LeuE  59.82 
 
 
227 aa  241  9e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.902588  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1476  leucine export protein LeuE  63.8 
 
 
220 aa  240  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0565  leucine export protein LeuE  63.8 
 
 
220 aa  240  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0771  leucine export protein LeuE  63.8 
 
 
220 aa  240  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.398532  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1506  leucine export protein LeuE  63.8 
 
 
220 aa  240  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.619764  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1609  leucine export protein LeuE  63.8 
 
 
220 aa  240  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1914  leucine export protein LeuE  62.1 
 
 
216 aa  240  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250271  normal  0.498691 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1282  leucine export protein LeuE  63.8 
 
 
220 aa  240  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324732  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0586  leucine export protein LeuE  63.8 
 
 
220 aa  240  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117669  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2782  leucine export protein LeuE  63.35 
 
 
219 aa  238  4e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1727  leucine export protein LeuE  60.47 
 
 
224 aa  237  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.859689 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1520  leucine export protein LeuE  60.37 
 
 
220 aa  228  6e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73556  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1324  leucine export protein LeuE  60.73 
 
 
222 aa  224  6e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0341072  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4188  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  61.36 
 
 
216 aa  219  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34113  normal  0.0417151 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3181  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  62.62 
 
 
215 aa  217  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.170342  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2005  leucine export protein LeuE  55.91 
 
 
226 aa  217  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.214703  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3114  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  54.26 
 
 
224 aa  207  8e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.683402  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1017  lysine exporter protein LysE/YggA  48.86 
 
 
218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000020336  hitchhiker  0.001054 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2918  leucine export protein LeuE  43.87 
 
 
211 aa  181  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.438377 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01768  neutral amino-acid efflux system  41.78 
 
 
212 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01756  hypothetical protein  41.78 
 
 
212 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0986  leucine export protein LeuE  42.66 
 
 
225 aa  174  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2024  leucine export protein LeuE  41.31 
 
 
212 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000174933  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1390  leucine export protein LeuE  41.31 
 
 
212 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547214  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2524  leucine export protein LeuE  40.85 
 
 
212 aa  172  5e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1845  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.31 
 
 
212 aa  171  5.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1886  leucine export protein LeuE  41.31 
 
 
212 aa  171  5.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1835  leucine export protein LeuE  41.31 
 
 
212 aa  171  5.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.966652  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1911  leucine export protein LeuE  41.59 
 
 
212 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000808789  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1375  leucine export protein LeuE  41.59 
 
 
212 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000252722  hitchhiker  0.0000730997 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1391  leucine export protein LeuE  41.59 
 
 
212 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.036985  normal  0.343779 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2092  leucine export protein LeuE  41.59 
 
 
212 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0133634  hitchhiker  0.00000159654 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1359  leucine export protein LeuE  41.31 
 
 
212 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0105441  normal  0.312431 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2293  leucine export protein LeuE  42.66 
 
 
211 aa  159  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.993752  normal  0.789702 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0660  lysine exporter protein LysE/YggA  43.46 
 
 
226 aa  150  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  32.26 
 
 
210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1248  amino acid transporter LysE  34.58 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.483142 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1277  lysine exporter protein LysE/YggA  34.58 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.476992 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4143  lysine exporter protein LysE/YggA  33.64 
 
 
205 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218888  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1065  lysine exporter protein LysE/YggA  35.48 
 
 
204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.180582  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.26 
 
 
208 aa  109  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4604  lysine exporter protein LysE/YggA  32.39 
 
 
203 aa  107  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4028  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.58 
 
 
209 aa  103  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.180103 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3931  amino acid transporter LysE  32.56 
 
 
213 aa  104  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0047  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.1 
 
 
204 aa  104  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.743196  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0028  lysine exporter protein LysE/YggA  34.1 
 
 
204 aa  104  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.214928 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1303  amino acid transporter LysE  33.49 
 
 
201 aa  102  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.520276  normal  0.253886 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  28.44 
 
 
217 aa  102  4e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4198  lysine exporter protein LysE/YggA  33.18 
 
 
203 aa  99.8  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000025376 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0053  lysine exporter protein LysE/YggA  32.41 
 
 
204 aa  98.6  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  29.28 
 
 
217 aa  98.2  9e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4520  lysine exporter protein LysE/YggA  34.86 
 
 
211 aa  98.2  9e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286419  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0048  lysine exporter protein LysE/YggA  31.34 
 
 
204 aa  97.1  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  27.98 
 
 
217 aa  96.7  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3399  lysine exporter protein LysE/YggA  34.26 
 
 
221 aa  95.9  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944216  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3385  lysine exporter protein LysE/YggA  31.31 
 
 
214 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201071 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
203 aa  94.7  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.18 
 
 
218 aa  91.3  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  31.65 
 
 
211 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  31.65 
 
 
211 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.12 
 
 
209 aa  91.3  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  31.65 
 
 
211 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  31.65 
 
 
211 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  31.65 
 
 
211 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.65 
 
 
211 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3105  lysine exporter protein LysE/YggA  28.85 
 
 
207 aa  89.7  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0065  lysine exporter protein LysE/YggA  31.19 
 
 
208 aa  89.4  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.969114 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3077  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.1 
 
 
206 aa  89  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  32.13 
 
 
211 aa  89  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0836  lysine exporter protein LysE/YggA  28.37 
 
 
207 aa  89  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6476  lysine exporter protein LysE/YggA  31.8 
 
 
211 aa  87.8  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.772782 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.34 
 
 
218 aa  85.5  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.34 
 
 
218 aa  85.5  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2025  lysine exporter protein LysE/YggA  27.4 
 
 
208 aa  85.5  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.464731  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0867  lysine exporter protein LysE/YggA  28.37 
 
 
207 aa  85.5  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.627781  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2300  lysine exporter protein LysE/YggA  27.4 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.735083  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2313  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.4 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00564099  hitchhiker  0.00590082 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3063  lysine exporter protein LysE/YggA  31.34 
 
 
213 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4414  amino acid efflux pump, RhtB family protein  32.58 
 
 
213 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.897061 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  31.19 
 
 
211 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  30.88 
 
 
208 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6008  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.65 
 
 
208 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.435355 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2073  lysine exporter protein LysE/YggA  26.15 
 
 
208 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106619  normal  0.299626 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3180  lysine exporter protein LysE/YggA  31.34 
 
 
213 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.920743  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3909  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
210 aa  82.4  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.806528  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7098  RhtB family transporter  35.81 
 
 
199 aa  82  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>