More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C4286 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A4346  threonine efflux system  100 
 
 		 206 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.459932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4188  threonine efflux system  99.51 
 
 		 206 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4167  threonine efflux system  100 
 
 		 206 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4286  threonine efflux system  100 
 
 		 206 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.492935 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4239  threonine efflux system  99.51 
 
 		 206 aa  410  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.588967  normal  0.890135 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03702  threonine efflux system  90.78 
 
 		 206 aa  384  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4156  homoserine/threonine efflux pump  91.26 
 
 		 206 aa  385  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4290  threonine efflux system  91.75 
 
 		 206 aa  385  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4190  threonine efflux system  90.78 
 
 		 206 aa  384  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587316 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03651  hypothetical protein  90.78 
 
 		 206 aa  384  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4185  threonine efflux system  91.75 
 
 		 206 aa  385  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4344  threonine efflux system  90.69 
 
 		 204 aa  381  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5264  threonine efflux system  91.18 
 
 		 204 aa  382  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.613043 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4047  threonine efflux system  91.67 
 
 		 204 aa  382  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3973  threonine efflux system  87.86 
 
 		 206 aa  369  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0194  threonine efflux system  73.91 
 
 		 207 aa  325  3e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  72.33 
 
 		 206 aa  317  7.999999999999999e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0194  threonine efflux system  72.12 
 
 		 208 aa  314  5e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.331917  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0556  threonine efflux system  72.33 
 
 		 206 aa  311  2.9999999999999996e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0219  threonine efflux system  72.33 
 
 		 206 aa  311  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3997  threonine efflux system  71.84 
 
 		 206 aa  310  9e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3963  threonine efflux system  72.46 
 
 		 207 aa  299  2e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245678  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4153  threonine efflux system  71.98 
 
 		 207 aa  298  6e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000179823  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2743  lysine exporter protein LysE/YggA  34.47 
 
 		 214 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0265185  normal  0.024176 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2958  threonine efflux protein  33.98 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10248  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6400  lysine exporter protein LysE/YggA  31.13 
 
 		 215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.436888 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3097  lysine exporter protein LysE/YggA  31.13 
 
 		 215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6693  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.13 
 
 		 190 aa  125  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0834  lysine exporter protein  36.41 
 
 		 209 aa  121  9e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0107637  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3488  lysine exporter protein LysE/YggA  37.89 
 
 		 223 aa  119  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0100  lysine exporter protein LysE/YggA  31.22 
 
 		 213 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2129  putative threonine efflux protein  31.53 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3293  threonine efflux protein, putative  31.53 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3387  putative threonine efflux protein  31.53 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0428  LysE type translocator  31.53 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0377494  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0246  LysE family translocator protein  31.53 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2959  putative threonine efflux protein  31.53 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2963  lysine exporter protein LysE/YggA  30.66 
 
 		 215 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3663  lysine exporter protein LysE/YggA  33.01 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2572  hypothetical protein  31.09 
 
 		 222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2347  lysine exporter protein LysE/YggA  36.36 
 
 		 207 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3976  lysine exporter protein LysE/YggA  32.16 
 
 		 205 aa  111  8.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1071  putative RhtB protein  31.31 
 
 		 212 aa  111  8.000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4978  lysine exporter protein LysE/YggA  34.78 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2779  amino acid efflux pump, RhtB family protein  34.52 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000004006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2482  lysine exporter protein LysE/YggA  30.56 
 
 		 224 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1147  transporter, LysE family  31.07 
 
 		 210 aa  108  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0765  threonine efflux protein, putative  28.32 
 
 		 234 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3556  lysine exporter protein LysE/YggA  34.2 
 
 		 212 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.384892 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5054  lysine exporter protein LysE/YggA  32.99 
 
 		 212 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199833  normal  0.295211 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3536  lysine exporter protein LysE/YggA  28.32 
 
 		 234 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5396  lysine exporter protein LysE/YggA  34.2 
 
 		 212 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6764  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.9 
 
 		 211 aa  106  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406386  normal  0.273065 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1555  putative LysE family amino-acid efflux protein  35.14 
 
 		 201 aa  106  3e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0989  lysine exporter protein LysE/YggA  30.1 
 
 		 210 aa  105  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3688  lysine exporter protein LysE/YggA  32.11 
 
 		 235 aa  105  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  28.92 
 
 		 209 aa  105  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3366  lysine exporter protein LysE/YggA  28.95 
 
 		 234 aa  104  7e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0699  lysine exporter protein LysE/YggA  32.11 
 
 		 235 aa  104  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4710  lysine exporter protein LysE/YggA  29.41 
 
 		 209 aa  104  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2431  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.99 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0689  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.94 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7469  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0668  lysine exporter protein LysE/YggA  31.65 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3644  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.46 
 
 		 204 aa  102  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0587  lysine exporter protein LysE/YggA  27.35 
 
 		 236 aa  102  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1219  hypothetical protein  31.41 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0936  lysine exporter protein LysE/YggA  30.96 
 
 		 212 aa  102  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.950459  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1476  lysine exporter protein LysE/YggA  36.46 
 
 		 212 aa  102  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1213  hypothetical protein  31.75 
 
 		 219 aa  102  6e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0717  lysine exporter protein LysE/YggA  30.43 
 
 		 204 aa  101  9e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1800  threonine efflux protein, putative  30.2 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.46 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2461  lysine exporter protein LysE/YggA  31.77 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5694  lysine exporter protein LysE/YggA  32.84 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5142  lysine exporter protein LysE/YggA  32.65 
 
 		 204 aa  99  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3142  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.88 
 
 		 208 aa  99.4  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0269907  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0009  lysine exporter protein LysE/YggA  29.41 
 
 		 245 aa  98.6  5e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0108149 
 
 
-
 
NC_004310  BR1920  amino acid transporter LysE  29.5 
 
 		 212 aa  98.6  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1757  lysine exporter protein LysE/YggA  29.9 
 
 		 214 aa  98.6  6e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.290271  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2363  lysine exporter protein LysE/YggA  28.93 
 
 		 249 aa  98.6  6e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1849  amino acid transporter LysE  29.5 
 
 		 212 aa  98.6  6e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.402974  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2796  lysine exporter protein LysE/YggA  29.13 
 
 		 214 aa  98.6  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2239  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.38 
 
 		 204 aa  98.2  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.678713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0035  threonine efflux protein  33.5 
 
 		 200 aa  98.2  9e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.34 
 
 		 204 aa  97.4  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3142  amino acid transporter LysE  28.16 
 
 		 218 aa  97.4  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142315  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2617  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 204 aa  97.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.635296 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003257  threonine efflux protein  28.86 
 
 		 211 aa  97.4  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2768  lysine exporter protein LysE/YggA  27.23 
 
 		 221 aa  96.7  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6528  lysine exporter protein LysE/YggA  30.65 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3869  lysine exporter protein LysE/YggA  33.68 
 
 		 212 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.61339 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1641  lysine exporter protein LysE/YggA  27.5 
 
 		 212 aa  96.7  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.950543  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3113  lysine exporter protein LysE/YggA  32.24 
 
 		 209 aa  97.1  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.050755  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4118  RhtB family transporter  30.96 
 
 		 213 aa  95.9  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4711  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 		 212 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1218  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3652  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 		 212 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4194  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.02 
 
 		 210 aa  95.5  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0596  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.29 
 
 		 230 aa  95.5  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1462  lysine exporter protein LysE/YggA  31.68 
 
 		 216 aa  95.1  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>