More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2431 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2431  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 		 209 aa  399  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4978  lysine exporter protein LysE/YggA  39.29 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2347  lysine exporter protein LysE/YggA  38.66 
 
 		 207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6400  lysine exporter protein LysE/YggA  36 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.436888 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3097  lysine exporter protein LysE/YggA  36.5 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4239  threonine efflux system  33.51 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.588967  normal  0.890135 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0194  threonine efflux system  36.22 
 
 		 207 aa  116  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2963  lysine exporter protein LysE/YggA  35.18 
 
 		 215 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0194  threonine efflux system  36.22 
 
 		 208 aa  114  7.999999999999999e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.331917  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4167  threonine efflux system  32.99 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4188  threonine efflux system  32.99 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4286  threonine efflux system  32.99 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.492935 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4346  threonine efflux system  32.99 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.459932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4190  threonine efflux system  32.84 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587316 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03702  threonine efflux system  32.84 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03651  hypothetical protein  32.84 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4156  homoserine/threonine efflux pump  32.84 
 
 		 206 aa  113  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5264  threonine efflux system  32.84 
 
 		 204 aa  112  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.613043 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3973  threonine efflux system  33.51 
 
 		 206 aa  112  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4185  threonine efflux system  32.35 
 
 		 206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4047  threonine efflux system  32.35 
 
 		 204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4290  threonine efflux system  32.35 
 
 		 206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4344  threonine efflux system  32.35 
 
 		 204 aa  112  6e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2958  threonine efflux protein  36.13 
 
 		 214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10248  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2482  lysine exporter protein LysE/YggA  28.16 
 
 		 224 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  34.36 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0556  threonine efflux system  32.47 
 
 		 206 aa  109  4.0000000000000004e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0219  threonine efflux system  32.47 
 
 		 206 aa  109  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2743  lysine exporter protein LysE/YggA  36.13 
 
 		 214 aa  108  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0265185  normal  0.024176 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3387  putative threonine efflux protein  34.36 
 
 		 217 aa  108  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3293  threonine efflux protein, putative  34.36 
 
 		 217 aa  108  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0246  LysE family translocator protein  34.36 
 
 		 217 aa  108  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0428  LysE type translocator  34.36 
 
 		 217 aa  108  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0377494  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2129  putative threonine efflux protein  34.36 
 
 		 217 aa  108  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2959  putative threonine efflux protein  34.36 
 
 		 217 aa  108  6e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3997  threonine efflux system  31.96 
 
 		 206 aa  108  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2239  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.87 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.678713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0100  lysine exporter protein LysE/YggA  32.34 
 
 		 213 aa  106  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3712  lysine exporter protein LysE/YggA  39.47 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5142  lysine exporter protein LysE/YggA  36.7 
 
 		 204 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  30.3 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2768  lysine exporter protein LysE/YggA  32.51 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3537  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.62 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.575737  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4153  threonine efflux system  37.5 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000179823  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4710  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 209 aa  102  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3963  threonine efflux system  36.96 
 
 		 207 aa  102  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245678  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1920  amino acid transporter LysE  28.86 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1849  amino acid transporter LysE  28.86 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.402974  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7118  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.16 
 
 		 205 aa  99.8  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5915  LysE family transporter  31.28 
 
 		 204 aa  99.4  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.723016 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26160  hypothetical protein  36.68 
 
 		 204 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.519724  normal  0.19854 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1476  lysine exporter protein LysE/YggA  35.1 
 
 		 212 aa  99.8  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5115  lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.3 
 
 		 203 aa  98.6  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.127177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6693  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.7 
 
 		 190 aa  98.6  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5054  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 		 212 aa  98.6  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199833  normal  0.295211 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1435  amino acid transporter LysE  30.2 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.410501  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06605  putative threonine efflux protein  28.65 
 
 		 203 aa  97.8  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5396  lysine exporter protein LysE/YggA  33.9 
 
 		 212 aa  97.4  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3556  lysine exporter protein LysE/YggA  33.9 
 
 		 212 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.384892 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1147  transporter, LysE family  33.01 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3404  lysine exporter protein LysE/YggA  26.6 
 
 		 211 aa  96.3  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0989  lysine exporter protein LysE/YggA  33.02 
 
 		 210 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05080  putative threonine efflux protein  36.06 
 
 		 224 aa  95.9  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.9 
 
 		 204 aa  95.5  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1060  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.46 
 
 		 209 aa  95.5  5e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.741251  normal  0.078929 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1462  lysine exporter protein LysE/YggA  34.16 
 
 		 216 aa  95.5  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0721  amino acid efflux pump, RhtB family protein  32.66 
 
 		 205 aa  95.5  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.914234  normal  0.346615 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3869  lysine exporter protein LysE/YggA  34.03 
 
 		 212 aa  95.5  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.61339 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.13 
 
 		 212 aa  94.7  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0936  lysine exporter protein LysE/YggA  28.43 
 
 		 212 aa  94.7  9e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.950459  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3663  lysine exporter protein LysE/YggA  31.1 
 
 		 209 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2617  lysine exporter protein LysE/YggA  32.62 
 
 		 204 aa  94  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.635296 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4711  lysine exporter protein LysE/YggA  35.03 
 
 		 212 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1218  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2230  hypothetical protein  36.18 
 
 		 204 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3652  lysine exporter protein LysE/YggA  35.03 
 
 		 212 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4118  RhtB family transporter  26.13 
 
 		 213 aa  93.6  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4189  lysine exporter protein LysE/YggA  26.7 
 
 		 212 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2460  lysine exporter protein LysE/YggA  34.46 
 
 		 212 aa  93.2  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3113  lysine exporter protein LysE/YggA  36.51 
 
 		 209 aa  93.2  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.050755  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0009  lysine exporter protein LysE/YggA  26.25 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0108149 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3976  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 205 aa  93.2  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1555  putative LysE family amino-acid efflux protein  29.47 
 
 		 201 aa  92.4  4e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2796  lysine exporter protein LysE/YggA  27.45 
 
 		 214 aa  92.8  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4247  putative homoserine/threonine efflux protein  26.98 
 
 		 208 aa  92.4  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000239469 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3142  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.2 
 
 		 208 aa  92  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0269907  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2572  hypothetical protein  30.29 
 
 		 222 aa  92  6e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2779  amino acid efflux pump, RhtB family protein  33.51 
 
 		 211 aa  91.7  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000004006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1814  lysine exporter protein LysE/YggA  31.55 
 
 		 205 aa  91.7  8e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000397951  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3142  amino acid transporter LysE  26.57 
 
 		 218 aa  91.3  9e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142315  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1730  amino acid transporter LysE  27.47 
 
 		 208 aa  90.9  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000126843  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2542  lysine exporter protein LysE/YggA  32.42 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.671872  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7469  lysine exporter protein LysE/YggA  32.28 
 
 		 205 aa  90.5  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6528  lysine exporter protein LysE/YggA  32.46 
 
 		 205 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6764  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.52 
 
 		 211 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406386  normal  0.273065 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3644  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.02 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1071  putative RhtB protein  32.38 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1227  lysine exporter protein LysE/YggA  34.72 
 
 		 207 aa  89.4  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5524  lysine exporter protein LysE/YggA  32.85 
 
 		 212 aa  89.4  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0728137  normal  0.0390592 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1213  hypothetical protein  27.07 
 
 		 219 aa  89.4  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5352  lysine exporter protein LysE/YggA  36.31 
 
 		 204 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128052 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>