More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1462 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1462  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 216 aa  419  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1757  lysine exporter protein LysE/YggA  62.86 
 
 		 214 aa  256  2e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.290271  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1800  threonine efflux protein, putative  61.43 
 
 		 212 aa  251  5.000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2796  lysine exporter protein LysE/YggA  59.05 
 
 		 214 aa  242  3e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0765  threonine efflux protein, putative  51.72 
 
 		 234 aa  224  7e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3366  lysine exporter protein LysE/YggA  50.86 
 
 		 234 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3536  lysine exporter protein LysE/YggA  51.72 
 
 		 234 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2482  lysine exporter protein LysE/YggA  53.05 
 
 		 224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0587  lysine exporter protein LysE/YggA  50.43 
 
 		 236 aa  210  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0668  lysine exporter protein LysE/YggA  52.89 
 
 		 235 aa  207  7e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0699  lysine exporter protein LysE/YggA  52.89 
 
 		 235 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0689  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  53.15 
 
 		 235 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3688  lysine exporter protein LysE/YggA  52.44 
 
 		 235 aa  205  4e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2363  lysine exporter protein LysE/YggA  45.27 
 
 		 249 aa  189  4e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0694  lysine exporter protein LysE/YggA  52.58 
 
 		 227 aa  177  9e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1550  threonine efflux protein, putative  47.03 
 
 		 227 aa  169  4e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.306225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3653  hypothetical protein  44.71 
 
 		 213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43570  hypothetical protein  43.48 
 
 		 213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.443465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2572  hypothetical protein  44.71 
 
 		 222 aa  160  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2461  lysine exporter protein LysE/YggA  44.98 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00347  threonine efflux system  44.76 
 
 		 234 aa  142  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002089  threonine efflux protein  43.75 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1213  hypothetical protein  35.03 
 
 		 219 aa  122  4e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1219  hypothetical protein  34.34 
 
 		 219 aa  121  6e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2958  threonine efflux protein  32.34 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10248  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3663  lysine exporter protein LysE/YggA  37.7 
 
 		 209 aa  112  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2743  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 		 214 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0265185  normal  0.024176 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4710  lysine exporter protein LysE/YggA  37.02 
 
 		 209 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3488  lysine exporter protein LysE/YggA  35.36 
 
 		 223 aa  109  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1147  transporter, LysE family  36.11 
 
 		 210 aa  108  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2977  amino acid transporter LysE  28.08 
 
 		 228 aa  108  7.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06605  putative threonine efflux protein  32.54 
 
 		 203 aa  107  9.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0596  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.69 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0194  threonine efflux system  34.34 
 
 		 207 aa  106  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0989  lysine exporter protein LysE/YggA  36.11 
 
 		 210 aa  105  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4239  threonine efflux system  31.68 
 
 		 206 aa  104  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.588967  normal  0.890135 
 
 
-
 
NC_004310  BR1920  amino acid transporter LysE  32.02 
 
 		 212 aa  104  8e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1849  amino acid transporter LysE  32.02 
 
 		 212 aa  104  8e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.402974  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4167  threonine efflux system  31.68 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  31.02 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2939  lysine exporter protein LysE/YggA  31.96 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.63 
 
 		 204 aa  103  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4286  threonine efflux system  31.68 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.492935 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0936  lysine exporter protein LysE/YggA  32.35 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.950459  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0194  threonine efflux system  32.51 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.331917  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4346  threonine efflux system  31.68 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.459932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4188  threonine efflux system  31.19 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2833  amino acid transporter LysE  32.43 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.318432  normal  0.661514 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3987  hypothetical protein  30.27 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3404  lysine exporter protein LysE/YggA  32.83 
 
 		 211 aa  103  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3973  threonine efflux system  29.85 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4156  homoserine/threonine efflux pump  30.81 
 
 		 206 aa  101  8e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4185  threonine efflux system  30.81 
 
 		 206 aa  101  9e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4290  threonine efflux system  30.81 
 
 		 206 aa  101  9e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03702  threonine efflux system  30.81 
 
 		 206 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1641  lysine exporter protein LysE/YggA  30.81 
 
 		 212 aa  101  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.950543  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4190  threonine efflux system  30.81 
 
 		 206 aa  101  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587316 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2768  lysine exporter protein LysE/YggA  29.21 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4118  RhtB family transporter  28.87 
 
 		 213 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03651  hypothetical protein  30.81 
 
 		 206 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29100  hypothetical protein  29.73 
 
 		 204 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136638 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4344  threonine efflux system  30.61 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5264  threonine efflux system  30.61 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.613043 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4047  threonine efflux system  30.61 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0219  threonine efflux system  32.66 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0556  threonine efflux system  32.66 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3644  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.02 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.98 
 
 		 204 aa  99.8  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3963  threonine efflux system  33 
 
 		 207 aa  99.8  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245678  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.56 
 
 		 205 aa  99.4  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2431  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.16 
 
 		 209 aa  99.4  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3997  threonine efflux system  32.16 
 
 		 206 aa  99  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0962  lysine exporter protein LysE/YggA  30.11 
 
 		 204 aa  99  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.55802  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3657  amino acid transporter LysE  31.18 
 
 		 229 aa  98.6  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4153  threonine efflux system  32.51 
 
 		 207 aa  98.2  8e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000179823  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  30.85 
 
 		 206 aa  98.2  9e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3142  amino acid transporter LysE  29.03 
 
 		 218 aa  97.4  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142315  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0699  amino acid transporter LysE  31.16 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0691811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  29.08 
 
 		 203 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.955446 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3991  lysine exporter protein LysE/YggA  30.11 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.1147  normal  0.39027 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1256  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.77 
 
 		 205 aa  97.4  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2912  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 		 215 aa  97.4  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1064  lysine exporter protein LysE/YggA  29.57 
 
 		 204 aa  96.3  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150207  normal  0.873963 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0732  lysine exporter protein LysE/YggA  30.65 
 
 		 204 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831174 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1031  lysine exporter protein LysE/YggA  29.57 
 
 		 204 aa  96.3  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0778058  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3224  lysine exporter protein LysE/YggA  30.11 
 
 		 204 aa  95.9  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0632575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6528  lysine exporter protein LysE/YggA  34.21 
 
 		 205 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0890  lysine exporter protein LysE/YggA  30.11 
 
 		 204 aa  95.9  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3132  lysine exporter protein LysE/YggA  30.11 
 
 		 204 aa  95.9  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0792555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02071  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36 
 
 		 208 aa  95.9  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0424528  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0111  hypothetical protein  29.73 
 
 		 215 aa  95.9  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2828  lysine exporter protein LysE/YggA  34.29 
 
 		 202 aa  95.5  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192947  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7469  lysine exporter protein LysE/YggA  34.44 
 
 		 205 aa  95.1  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3328  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.03 
 
 		 204 aa  95.1  7e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.740014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0717  lysine exporter protein LysE/YggA  27.46 
 
 		 204 aa  94.7  9e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5674  lysine exporter protein LysE/YggA  34.38 
 
 		 205 aa  94.7  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6038  lysine exporter protein LysE/YggA  34.38 
 
 		 205 aa  94.7  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3452  LysE family translocator protein  28.11 
 
 		 204 aa  94  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0493  lysine exporter protein LysE/YggA  28.05 
 
 		 219 aa  94.4  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0782  LysE family translocator protein  27.03 
 
 		 204 aa  94  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.492943  normal  0.203666 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>