More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2768 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2768  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
221 aa  446  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7469  lysine exporter protein LysE/YggA  43.19 
 
 
205 aa  177  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3142  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.5 
 
 
208 aa  176  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0269907  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3976  lysine exporter protein LysE/YggA  41.71 
 
 
205 aa  169  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5694  lysine exporter protein LysE/YggA  40.38 
 
 
205 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6528  lysine exporter protein LysE/YggA  42.72 
 
 
205 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06605  putative threonine efflux protein  41.98 
 
 
203 aa  157  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1814  lysine exporter protein LysE/YggA  41.31 
 
 
205 aa  154  7e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000397951  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26160  hypothetical protein  41.67 
 
 
204 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.519724  normal  0.19854 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5674  lysine exporter protein LysE/YggA  42.25 
 
 
205 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5352  lysine exporter protein LysE/YggA  40.87 
 
 
204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6038  lysine exporter protein LysE/YggA  42.25 
 
 
205 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0936  lysine exporter protein LysE/YggA  36.79 
 
 
212 aa  152  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.950459  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1147  transporter, LysE family  39.81 
 
 
210 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0989  lysine exporter protein LysE/YggA  39.34 
 
 
210 aa  148  7e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0531  lysine exporter protein LysE/YggA  40 
 
 
203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3663  lysine exporter protein LysE/YggA  37.85 
 
 
209 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4710  lysine exporter protein LysE/YggA  37.44 
 
 
209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2230  hypothetical protein  40.28 
 
 
204 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1920  amino acid transporter LysE  34.91 
 
 
212 aa  145  6e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1849  amino acid transporter LysE  34.91 
 
 
212 aa  145  6e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.402974  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0732  lysine exporter protein LysE/YggA  37.8 
 
 
204 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.831174 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4118  RhtB family transporter  33.95 
 
 
213 aa  144  9e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  35.51 
 
 
203 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.955446 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5915  LysE family transporter  39.34 
 
 
204 aa  143  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.723016 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0530  amino acid transporter LysE  38.14 
 
 
203 aa  142  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0699  amino acid transporter LysE  35.98 
 
 
204 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0691811  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1256  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.79 
 
 
205 aa  141  7e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2939  lysine exporter protein LysE/YggA  35.55 
 
 
214 aa  140  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419308  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0111  hypothetical protein  33.49 
 
 
215 aa  139  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0618  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.33 
 
 
211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0490  lysine exporter protein LysE/YggA  37.21 
 
 
203 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3961  lysine exporter protein LysE/YggA  37.21 
 
 
203 aa  138  6e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3778  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.21 
 
 
203 aa  138  6e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4189  lysine exporter protein LysE/YggA  35.65 
 
 
212 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.65 
 
 
205 aa  132  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1435  amino acid transporter LysE  33.03 
 
 
210 aa  132  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.410501  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3488  lysine exporter protein LysE/YggA  37.31 
 
 
223 aa  132  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1641  lysine exporter protein LysE/YggA  34.27 
 
 
212 aa  131  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.950543  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  36.79 
 
 
209 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0732  lysine exporter protein LysE/YggA  36.84 
 
 
204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.824462  normal  0.397861 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2977  amino acid transporter LysE  34.25 
 
 
228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1219  hypothetical protein  38.28 
 
 
219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2059  lysine exporter protein LysE/YggA  36.82 
 
 
211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1213  hypothetical protein  38.83 
 
 
219 aa  128  7.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02071  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.16 
 
 
208 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0424528  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0009  lysine exporter protein LysE/YggA  31.17 
 
 
245 aa  122  6e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0108149 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1110  RhtB family transporter  34.3 
 
 
209 aa  120  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0078  amino acid efflux protein  32.69 
 
 
205 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3404  lysine exporter protein LysE/YggA  32.84 
 
 
211 aa  119  4.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325379  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0100  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.02 
 
 
234 aa  115  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0717  lysine exporter protein LysE/YggA  32.06 
 
 
204 aa  115  6.9999999999999995e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.34 
 
 
204 aa  115  7.999999999999999e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3675  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.88 
 
 
212 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3644  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.92 
 
 
204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0596  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.86 
 
 
230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.43 
 
 
204 aa  113  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3142  amino acid transporter LysE  30.14 
 
 
218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142315  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0782  LysE family translocator protein  31.79 
 
 
204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.492943  normal  0.203666 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2482  lysine exporter protein LysE/YggA  29.21 
 
 
224 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3581  lysine exporter protein LysE/YggA  31.28 
 
 
222 aa  108  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3987  hypothetical protein  33.33 
 
 
204 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3452  LysE family translocator protein  31.28 
 
 
204 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1060  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.79 
 
 
209 aa  107  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.741251  normal  0.078929 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0765  threonine efflux protein, putative  28.57 
 
 
234 aa  104  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2796  lysine exporter protein LysE/YggA  30.99 
 
 
214 aa  101  9e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0921  putative threonine efflux protein  29.86 
 
 
205 aa  100  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29100  hypothetical protein  30.53 
 
 
204 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136638 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0587  lysine exporter protein LysE/YggA  30 
 
 
236 aa  99.8  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.58 
 
 
212 aa  99.4  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3991  lysine exporter protein LysE/YggA  31.75 
 
 
204 aa  99.4  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.1147  normal  0.39027 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1238  lysine exporter protein LysE/YggA  33.48 
 
 
212 aa  98.6  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0801686  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3366  lysine exporter protein LysE/YggA  29.96 
 
 
234 aa  98.2  8e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2431  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.51 
 
 
209 aa  98.2  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2743  lysine exporter protein LysE/YggA  32.67 
 
 
214 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0265185  normal  0.024176 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2069  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35 
 
 
213 aa  98.2  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2363  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 
249 aa  97.8  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4239  threonine efflux system  27.23 
 
 
206 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.588967  normal  0.890135 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1800  threonine efflux protein, putative  29.47 
 
 
212 aa  97.1  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4188  threonine efflux system  27.23 
 
 
206 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4286  threonine efflux system  27.23 
 
 
206 aa  96.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.492935 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4346  threonine efflux system  27.23 
 
 
206 aa  96.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.459932  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4167  threonine efflux system  27.23 
 
 
206 aa  96.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0194  threonine efflux system  27.01 
 
 
207 aa  96.3  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0194  threonine efflux system  29.38 
 
 
208 aa  96.7  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.331917  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43570  hypothetical protein  31.19 
 
 
213 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.443465  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3653  hypothetical protein  30.39 
 
 
213 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3973  threonine efflux system  27.49 
 
 
206 aa  95.9  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4344  threonine efflux system  27.01 
 
 
204 aa  95.9  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2958  threonine efflux protein  32.18 
 
 
214 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10248  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03702  threonine efflux system  27.49 
 
 
206 aa  95.1  7e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03651  hypothetical protein  27.49 
 
 
206 aa  95.1  7e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4190  threonine efflux system  27.49 
 
 
206 aa  95.1  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587316 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5264  threonine efflux system  27.49 
 
 
204 aa  95.1  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.613043 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4156  homoserine/threonine efflux pump  27.49 
 
 
206 aa  95.1  8e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4047  threonine efflux system  27.49 
 
 
204 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2572  hypothetical protein  31.72 
 
 
222 aa  94.7  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3328  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.54 
 
 
204 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.740014  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  27.49 
 
 
206 aa  94.4  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4185  threonine efflux system  27.49 
 
 
206 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.485697 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>