More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1814 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1814  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 205 aa  396  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000397951  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3976  lysine exporter protein LysE/YggA  66.83 
 
 		 205 aa  263  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7469  lysine exporter protein LysE/YggA  69.95 
 
 		 205 aa  263  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6528  lysine exporter protein LysE/YggA  68.32 
 
 		 205 aa  261  6e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5694  lysine exporter protein LysE/YggA  67.33 
 
 		 205 aa  260  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5674  lysine exporter protein LysE/YggA  69.31 
 
 		 205 aa  254  8e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6038  lysine exporter protein LysE/YggA  69.31 
 
 		 205 aa  254  8e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5352  lysine exporter protein LysE/YggA  61.95 
 
 		 204 aa  226  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26160  hypothetical protein  60.8 
 
 		 204 aa  224  6e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.519724  normal  0.19854 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3142  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  56.8 
 
 		 208 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0269907  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2230  hypothetical protein  59.3 
 
 		 204 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  50.49 
 
 		 205 aa  193  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5915  LysE family transporter  49.75 
 
 		 204 aa  191  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.723016 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1256  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  48.31 
 
 		 205 aa  185  4e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0699  amino acid transporter LysE  49.27 
 
 		 204 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0691811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3663  lysine exporter protein LysE/YggA  46.6 
 
 		 209 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  45.75 
 
 		 203 aa  177  7e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.955446 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0732  lysine exporter protein LysE/YggA  48.78 
 
 		 204 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831174 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3488  lysine exporter protein LysE/YggA  47.62 
 
 		 223 aa  174  6e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0989  lysine exporter protein LysE/YggA  45.15 
 
 		 210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1147  transporter, LysE family  44.17 
 
 		 210 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4710  lysine exporter protein LysE/YggA  45.77 
 
 		 209 aa  169  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0732  lysine exporter protein LysE/YggA  49.27 
 
 		 204 aa  168  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.824462  normal  0.397861 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1435  amino acid transporter LysE  44.04 
 
 		 210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.410501  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06605  putative threonine efflux protein  41 
 
 		 203 aa  164  5.9999999999999996e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4189  lysine exporter protein LysE/YggA  41.18 
 
 		 212 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2768  lysine exporter protein LysE/YggA  41.31 
 
 		 221 aa  159  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2939  lysine exporter protein LysE/YggA  41.95 
 
 		 214 aa  158  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3404  lysine exporter protein LysE/YggA  43.9 
 
 		 211 aa  157  9e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0531  lysine exporter protein LysE/YggA  43.72 
 
 		 203 aa  155  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0936  lysine exporter protein LysE/YggA  42.08 
 
 		 212 aa  154  7e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.950459  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0530  amino acid transporter LysE  42.21 
 
 		 203 aa  151  8e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4118  RhtB family transporter  38.61 
 
 		 213 aa  149  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0111  hypothetical protein  35.82 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1920  amino acid transporter LysE  40.3 
 
 		 212 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3961  lysine exporter protein LysE/YggA  40.7 
 
 		 203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0490  lysine exporter protein LysE/YggA  40.7 
 
 		 203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1849  amino acid transporter LysE  40.3 
 
 		 212 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.402974  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3778  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.7 
 
 		 203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1110  RhtB family transporter  39.13 
 
 		 209 aa  144  7.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1641  lysine exporter protein LysE/YggA  39.29 
 
 		 212 aa  143  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.950543  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0078  amino acid efflux protein  40.82 
 
 		 205 aa  142  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0618  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.92 
 
 		 211 aa  141  6e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3675  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.96 
 
 		 212 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2059  lysine exporter protein LysE/YggA  35.6 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.39 
 
 		 204 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02071  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.22 
 
 		 208 aa  132  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0424528  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0921  putative threonine efflux protein  33.66 
 
 		 205 aa  131  6.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3644  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.73 
 
 		 204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.71 
 
 		 204 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0717  lysine exporter protein LysE/YggA  37.06 
 
 		 204 aa  125  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  35.75 
 
 		 209 aa  124  7e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0596  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.03 
 
 		 230 aa  124  8.000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1219  hypothetical protein  38.58 
 
 		 219 aa  124  9e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2977  amino acid transporter LysE  32.23 
 
 		 228 aa  122  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1213  hypothetical protein  38.07 
 
 		 219 aa  122  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0009  lysine exporter protein LysE/YggA  31.58 
 
 		 245 aa  119  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0108149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.19 
 
 		 212 aa  115  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3581  lysine exporter protein LysE/YggA  34.25 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0782  LysE family translocator protein  34.25 
 
 		 204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.492943  normal  0.203666 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2958  threonine efflux protein  34.16 
 
 		 214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10248  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3452  LysE family translocator protein  33.7 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2743  lysine exporter protein LysE/YggA  34.57 
 
 		 214 aa  109  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0265185  normal  0.024176 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2482  lysine exporter protein LysE/YggA  31.6 
 
 		 224 aa  108  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2796  lysine exporter protein LysE/YggA  32.99 
 
 		 214 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1060  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.05 
 
 		 209 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.741251  normal  0.078929 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3653  hypothetical protein  35.53 
 
 		 213 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0100  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.63 
 
 		 234 aa  107  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3987  hypothetical protein  34.59 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29100  hypothetical protein  35.14 
 
 		 204 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136638 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2239  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.05 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.678713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4239  threonine efflux system  34.17 
 
 		 206 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.588967  normal  0.890135 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2572  hypothetical protein  28.92 
 
 		 222 aa  102  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4188  threonine efflux system  33.66 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4167  threonine efflux system  34.17 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4286  threonine efflux system  34.17 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.492935 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4346  threonine efflux system  34.17 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.459932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4344  threonine efflux system  34.8 
 
 		 204 aa  101  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2347  lysine exporter protein LysE/YggA  36.27 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0194  threonine efflux system  34.17 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.331917  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4978  lysine exporter protein LysE/YggA  34.92 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4047  threonine efflux system  34.31 
 
 		 204 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43570  hypothetical protein  33.5 
 
 		 213 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.443465  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03702  threonine efflux system  34.31 
 
 		 206 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4156  homoserine/threonine efflux pump  34.31 
 
 		 206 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5264  threonine efflux system  34.31 
 
 		 204 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.613043 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03651  hypothetical protein  34.31 
 
 		 206 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4185  threonine efflux system  34.31 
 
 		 206 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4290  threonine efflux system  34.31 
 
 		 206 aa  99.4  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4190  threonine efflux system  34.31 
 
 		 206 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587316 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3097  lysine exporter protein LysE/YggA  30.58 
 
 		 215 aa  98.6  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1757  lysine exporter protein LysE/YggA  31.55 
 
 		 214 aa  98.6  6e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.290271  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3142  amino acid transporter LysE  33.69 
 
 		 218 aa  98.2  8e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142315  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  32.34 
 
 		 206 aa  97.1  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0194  threonine efflux system  34.48 
 
 		 207 aa  97.1  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1388  amino acid transporter LysE  34.72 
 
 		 228 aa  96.7  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0501572  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02476  hypothetical protein  40.28 
 
 		 211 aa  96.7  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1798  amino acid transport protein, LysE type  35.57 
 
 		 213 aa  97.1  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1841  lysine exporter protein LysE/YggA  32.67 
 
 		 216 aa  95.9  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000006365 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0246  LysE family translocator protein  29.81 
 
 		 217 aa  95.5  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>