More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A2129 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA3293  threonine efflux protein, putative  100 
 
 
217 aa  427  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0428  LysE type translocator  100 
 
 
217 aa  427  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0377494  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2129  putative threonine efflux protein  100 
 
 
217 aa  427  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3387  putative threonine efflux protein  100 
 
 
217 aa  427  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2959  putative threonine efflux protein  100 
 
 
217 aa  427  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0246  LysE family translocator protein  100 
 
 
217 aa  427  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6400  lysine exporter protein LysE/YggA  78.8 
 
 
215 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.436888 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3097  lysine exporter protein LysE/YggA  77.88 
 
 
215 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0234  LysE type translocator  79.72 
 
 
173 aa  321  4e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0377259  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2963  lysine exporter protein LysE/YggA  76.96 
 
 
215 aa  317  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0100  lysine exporter protein LysE/YggA  63.01 
 
 
213 aa  263  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0212  threonine efflux protein, putative  94.9 
 
 
99 aa  170  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2347  lysine exporter protein LysE/YggA  45 
 
 
207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4978  lysine exporter protein LysE/YggA  45.45 
 
 
207 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2239  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.15 
 
 
204 aa  137  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.678713  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2958  threonine efflux protein  36.62 
 
 
214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10248  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2743  lysine exporter protein LysE/YggA  35.68 
 
 
214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0265185  normal  0.024176 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03702  threonine efflux system  31.51 
 
 
206 aa  122  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0194  threonine efflux system  33.95 
 
 
208 aa  122  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.331917  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03651  hypothetical protein  31.51 
 
 
206 aa  122  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4190  threonine efflux system  31.51 
 
 
206 aa  122  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587316 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4156  homoserine/threonine efflux pump  31.51 
 
 
206 aa  122  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4185  threonine efflux system  31.51 
 
 
206 aa  122  5e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5142  lysine exporter protein LysE/YggA  36.82 
 
 
204 aa  122  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4290  threonine efflux system  31.51 
 
 
206 aa  122  5e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3973  threonine efflux system  32.09 
 
 
206 aa  121  8e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0556  threonine efflux system  33.33 
 
 
206 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5264  threonine efflux system  31.48 
 
 
204 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.613043 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0219  threonine efflux system  33.33 
 
 
206 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4047  threonine efflux system  31.48 
 
 
204 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3997  threonine efflux system  32 
 
 
206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5115  lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.64 
 
 
203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.127177  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4239  threonine efflux system  31.82 
 
 
206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.588967  normal  0.890135 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4286  threonine efflux system  31.82 
 
 
206 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.492935 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  30.7 
 
 
206 aa  119  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4346  threonine efflux system  31.82 
 
 
206 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.459932  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4167  threonine efflux system  31.82 
 
 
206 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4344  threonine efflux system  31.02 
 
 
204 aa  119  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4188  threonine efflux system  31.36 
 
 
206 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1227  lysine exporter protein LysE/YggA  38.69 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003257  threonine efflux protein  31.9 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0721  amino acid efflux pump, RhtB family protein  33.99 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.914234  normal  0.346615 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0194  threonine efflux system  30.23 
 
 
207 aa  113  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2617  lysine exporter protein LysE/YggA  32.34 
 
 
204 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.635296 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0989  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 
210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1147  transporter, LysE family  33.65 
 
 
210 aa  108  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3450  lysine exporter protein LysE/YggA  34.24 
 
 
204 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.270784  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3712  lysine exporter protein LysE/YggA  32.86 
 
 
211 aa  106  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3663  lysine exporter protein LysE/YggA  33.65 
 
 
209 aa  106  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5270  lysine exporter protein LysE/YggA  34.24 
 
 
204 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27713  normal  0.342162 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4153  threonine efflux system  32.73 
 
 
207 aa  105  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000179823  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4710  lysine exporter protein LysE/YggA  31.73 
 
 
209 aa  105  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3963  threonine efflux system  32.73 
 
 
207 aa  105  7e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245678  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6693  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.5 
 
 
190 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6764  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.4 
 
 
211 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406386  normal  0.273065 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5054  lysine exporter protein LysE/YggA  32.84 
 
 
212 aa  102  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199833  normal  0.295211 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2779  amino acid efflux pump, RhtB family protein  31.31 
 
 
211 aa  101  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000004006  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1641  lysine exporter protein LysE/YggA  29.19 
 
 
212 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.950543  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1476  lysine exporter protein LysE/YggA  31.94 
 
 
212 aa  100  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3537  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.81 
 
 
208 aa  99  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.575737  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0289  RhtB family transporter  33.5 
 
 
209 aa  99  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7469  lysine exporter protein LysE/YggA  31.92 
 
 
205 aa  98.6  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4718  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.08 
 
 
206 aa  98.2  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.721084 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3976  lysine exporter protein LysE/YggA  32.08 
 
 
205 aa  98.2  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3113  lysine exporter protein LysE/YggA  35.03 
 
 
209 aa  98.2  8e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.050755  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2431  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.46 
 
 
209 aa  97.8  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2542  lysine exporter protein LysE/YggA  30.19 
 
 
206 aa  97.1  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.671872  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7118  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.71 
 
 
205 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7385  putative threonine efflux protein  32.69 
 
 
216 aa  94.7  9e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0325259  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0936  lysine exporter protein LysE/YggA  25.81 
 
 
212 aa  94.7  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.950459  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1920  amino acid transporter LysE  25.46 
 
 
212 aa  93.2  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1849  amino acid transporter LysE  25.46 
 
 
212 aa  93.2  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.402974  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.4 
 
 
212 aa  93.6  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3556  lysine exporter protein LysE/YggA  30.26 
 
 
212 aa  92.8  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.384892 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5396  lysine exporter protein LysE/YggA  30.26 
 
 
212 aa  93.2  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2939  lysine exporter protein LysE/YggA  26.27 
 
 
214 aa  92.4  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419308  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0912  lysine exporter protein LysE/YggA  35.26 
 
 
213 aa  92  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2572  hypothetical protein  26.44 
 
 
222 aa  91.7  7e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3869  lysine exporter protein LysE/YggA  31.79 
 
 
212 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.61339 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4711  lysine exporter protein LysE/YggA  31.79 
 
 
212 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1218  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3652  lysine exporter protein LysE/YggA  31.79 
 
 
212 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5524  lysine exporter protein LysE/YggA  30.65 
 
 
212 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0728137  normal  0.0390592 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4118  RhtB family transporter  25.46 
 
 
213 aa  88.2  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2461  lysine exporter protein LysE/YggA  30.54 
 
 
210 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283309  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0468  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 
215 aa  87.8  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.521562  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5915  LysE family transporter  31.78 
 
 
204 aa  87.8  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.723016 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6528  lysine exporter protein LysE/YggA  30 
 
 
205 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1814  lysine exporter protein LysE/YggA  29.81 
 
 
205 aa  87  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000397951  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4189  lysine exporter protein LysE/YggA  26.24 
 
 
212 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0531  lysine exporter protein LysE/YggA  28.3 
 
 
203 aa  87  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2460  lysine exporter protein LysE/YggA  30.77 
 
 
212 aa  86.3  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5694  lysine exporter protein LysE/YggA  29.05 
 
 
205 aa  86.3  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43570  hypothetical protein  34.8 
 
 
213 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.443465  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0233  RhtB family transporter  29.27 
 
 
209 aa  85.1  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0078  amino acid efflux protein  24.64 
 
 
205 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00347  threonine efflux system  28.17 
 
 
234 aa  84.3  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0530  amino acid transporter LysE  26.89 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3336  hypothetical protein  36.36 
 
 
164 aa  83.2  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3488  lysine exporter protein LysE/YggA  27.41 
 
 
223 aa  84  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2482  lysine exporter protein LysE/YggA  22.64 
 
 
224 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>