More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6764 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6764  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 		 211 aa  413  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406386  normal  0.273065 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2779  amino acid efflux pump, RhtB family protein  95.73 
 
 		 211 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000004006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5054  lysine exporter protein LysE/YggA  75 
 
 		 212 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199833  normal  0.295211 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5396  lysine exporter protein LysE/YggA  77.32 
 
 		 212 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3556  lysine exporter protein LysE/YggA  76.8 
 
 		 212 aa  307  9e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.384892 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5524  lysine exporter protein LysE/YggA  75.94 
 
 		 212 aa  300  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0728137  normal  0.0390592 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3869  lysine exporter protein LysE/YggA  75.77 
 
 		 212 aa  281  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.61339 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4711  lysine exporter protein LysE/YggA  75.26 
 
 		 212 aa  280  9e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1218  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3652  lysine exporter protein LysE/YggA  75.26 
 
 		 212 aa  280  9e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2460  lysine exporter protein LysE/YggA  74.74 
 
 		 212 aa  277  6e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3712  lysine exporter protein LysE/YggA  56.04 
 
 		 211 aa  209  3e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1476  lysine exporter protein LysE/YggA  53.05 
 
 		 212 aa  199  3e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4194  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  56.1 
 
 		 210 aa  186  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4482  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  57 
 
 		 210 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3537  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  50.26 
 
 		 208 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.575737  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0468  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  53.73 
 
 		 215 aa  177  8e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.521562  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5706  lysine exporter protein LysE/YggA  54.9 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.128668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0289  RhtB family transporter  48.15 
 
 		 209 aa  162  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2542  lysine exporter protein LysE/YggA  41.71 
 
 		 206 aa  156  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.671872  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003257  threonine efflux protein  36.45 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2239  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.51 
 
 		 204 aa  119  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.678713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0100  lysine exporter protein LysE/YggA  34.15 
 
 		 213 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6400  lysine exporter protein LysE/YggA  32.24 
 
 		 215 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.436888 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3097  lysine exporter protein LysE/YggA  33.66 
 
 		 215 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2963  lysine exporter protein LysE/YggA  32.68 
 
 		 215 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.557805 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03702  threonine efflux system  33.99 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4344  threonine efflux system  33.99 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5264  threonine efflux system  33.99 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.613043 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03651  hypothetical protein  33.99 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4190  threonine efflux system  33.99 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587316 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4156  homoserine/threonine efflux pump  33.99 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4290  threonine efflux system  33.99 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4047  threonine efflux system  33.99 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4185  threonine efflux system  33.99 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  34.8 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4978  lysine exporter protein LysE/YggA  36.11 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7118  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.1 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4239  threonine efflux system  34.9 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.588967  normal  0.890135 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4286  threonine efflux system  34.9 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.492935 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4188  threonine efflux system  34.9 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7469  lysine exporter protein LysE/YggA  35.68 
 
 		 205 aa  106  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4346  threonine efflux system  34.9 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.459932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4167  threonine efflux system  34.9 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2347  lysine exporter protein LysE/YggA  34.64 
 
 		 207 aa  104  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0856  lysine exporter protein LysE/YggA  32.51 
 
 		 200 aa  104  8e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.985682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6693  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.91 
 
 		 190 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3976  lysine exporter protein LysE/YggA  36.84 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1050  lysine exporter protein LysE/YggA  35.83 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0194  threonine efflux system  33.66 
 
 		 207 aa  102  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5142  lysine exporter protein LysE/YggA  33.69 
 
 		 204 aa  102  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5694  lysine exporter protein LysE/YggA  32.65 
 
 		 205 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6528  lysine exporter protein LysE/YggA  32.18 
 
 		 205 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3997  threonine efflux system  32.64 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0556  threonine efflux system  32.64 
 
 		 206 aa  102  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0219  threonine efflux system  32.64 
 
 		 206 aa  102  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1792  putative LysE type translocator  40.31 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00860151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3387  putative threonine efflux protein  29.47 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3293  threonine efflux protein, putative  29.47 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0428  LysE type translocator  29.47 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0377494  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2959  putative threonine efflux protein  29.47 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3973  threonine efflux system  32.51 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0246  LysE family translocator protein  29.47 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0721  amino acid efflux pump, RhtB family protein  30.85 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.914234  normal  0.346615 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2129  putative threonine efflux protein  29.47 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2617  lysine exporter protein LysE/YggA  37.3 
 
 		 204 aa  99  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.635296 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3450  lysine exporter protein LysE/YggA  35.84 
 
 		 204 aa  98.2  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.270784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0233  RhtB family transporter  30.29 
 
 		 209 aa  98.2  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0194  threonine efflux system  31.68 
 
 		 208 aa  97.8  9e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.331917  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5270  lysine exporter protein LysE/YggA  35.84 
 
 		 204 aa  97.8  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27713  normal  0.342162 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5674  lysine exporter protein LysE/YggA  32.18 
 
 		 205 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6038  lysine exporter protein LysE/YggA  32.18 
 
 		 205 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2343  RhtB family threonine efflux protein  37.57 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1018  lysine exporter protein LysE/YggA  37.57 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0776742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3963  threonine efflux system  33.66 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245678  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4153  threonine efflux system  33.66 
 
 		 207 aa  93.2  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000179823  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2958  threonine efflux protein  28.3 
 
 		 214 aa  92  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10248  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2743  lysine exporter protein LysE/YggA  28.78 
 
 		 214 aa  91.3  9e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0265185  normal  0.024176 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4710  lysine exporter protein LysE/YggA  31.03 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0493  lysine exporter protein LysE/YggA  29 
 
 		 219 aa  90.9  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2922  lysine exporter protein LysE/YggA  30.88 
 
 		 206 aa  90.5  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5115  lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.34 
 
 		 203 aa  90.1  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.127177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1641  lysine exporter protein LysE/YggA  29.38 
 
 		 212 aa  89.7  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.950543  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000550  putative threonine efflux protein  30.85 
 
 		 204 aa  89  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1227  lysine exporter protein LysE/YggA  32.8 
 
 		 207 aa  89  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2768  lysine exporter protein LysE/YggA  29.63 
 
 		 221 aa  88.6  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  27.78 
 
 		 209 aa  89  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5352  lysine exporter protein LysE/YggA  35.79 
 
 		 204 aa  88.6  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5915  LysE family transporter  30.2 
 
 		 204 aa  87.4  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.723016 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4189  lysine exporter protein LysE/YggA  28.21 
 
 		 212 aa  87  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1071  putative RhtB protein  31.4 
 
 		 212 aa  86.7  2e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3488  lysine exporter protein LysE/YggA  31.41 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1147  transporter, LysE family  33.16 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0989  lysine exporter protein LysE/YggA  31.63 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00283  neutral amino-acid efflux system  29.35 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3278  homoserine/threonine efflux pump  29.35 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00287  hypothetical protein  29.35 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0394  putative homoserine/threonine efflux protein  29.35 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3296  homoserine/threonine efflux pump  29.35 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1814  lysine exporter protein LysE/YggA  31.75 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000397951  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0405  putative transport protein  27.59 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000145475 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>