More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000550 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000550  putative threonine efflux protein  100 
 
 		 204 aa  401  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05339  putative threonine efflux protein  95.4 
 
 		 187 aa  332  2e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0391  hypothetical protein  77.94 
 
 		 204 aa  325  2.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3991  lysine exporter protein LysE/YggA  59.31 
 
 		 204 aa  254  7e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.1147  normal  0.39027 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3224  lysine exporter protein LysE/YggA  57.35 
 
 		 204 aa  244  4e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0632575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0890  lysine exporter protein LysE/YggA  57.35 
 
 		 204 aa  244  4e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3132  lysine exporter protein LysE/YggA  57.35 
 
 		 204 aa  244  4e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0792555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3076  lysine exporter protein LysE/YggA  55.88 
 
 		 204 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1064  lysine exporter protein LysE/YggA  56.86 
 
 		 204 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150207  normal  0.873963 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3328  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  56.86 
 
 		 204 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.740014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0962  lysine exporter protein LysE/YggA  56.86 
 
 		 204 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.55802  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1031  lysine exporter protein LysE/YggA  56.86 
 
 		 204 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0778058  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3657  amino acid transporter LysE  56.37 
 
 		 229 aa  241  3.9999999999999997e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2930  lysine exporter protein LysE/YggA  54.95 
 
 		 205 aa  241  3.9999999999999997e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000123984  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3094  lysine exporter protein LysE/YggA  55.39 
 
 		 205 aa  238  4e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3318  lysine exporter protein LysE/YggA  57.84 
 
 		 204 aa  236  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.3253  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3692  lysine exporter protein (LysE/YggA)  52.75 
 
 		 218 aa  235  4e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0974  lysine exporter protein LysE/YggA  54.41 
 
 		 204 aa  234  5.0000000000000005e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.253527  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2833  amino acid transporter LysE  53.43 
 
 		 208 aa  234  5.0000000000000005e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.318432  normal  0.661514 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3935  lysine exporter protein LysE/YggA  50.74 
 
 		 203 aa  208  5e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2828  lysine exporter protein LysE/YggA  44.83 
 
 		 202 aa  174  6e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192947  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1150  amino acid transporter LysE  41.67 
 
 		 204 aa  170  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2922  lysine exporter protein LysE/YggA  40.98 
 
 		 206 aa  156  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0372  lysine exporter protein LysE/YggA  39.13 
 
 		 217 aa  128  5.0000000000000004e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.83228  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  36.41 
 
 		 209 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0078  amino acid efflux protein  32 
 
 		 205 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0732  lysine exporter protein LysE/YggA  35.29 
 
 		 204 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831174 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0699  amino acid transporter LysE  34.48 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0691811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1060  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.16 
 
 		 209 aa  105  6e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.741251  normal  0.078929 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1435  amino acid transporter LysE  32.14 
 
 		 210 aa  102  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.410501  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5694  lysine exporter protein LysE/YggA  34.33 
 
 		 205 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6528  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 		 205 aa  101  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.57 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6038  lysine exporter protein LysE/YggA  32.64 
 
 		 205 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5674  lysine exporter protein LysE/YggA  32.64 
 
 		 205 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1256  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.11 
 
 		 205 aa  99.4  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2482  lysine exporter protein LysE/YggA  29.77 
 
 		 224 aa  99.4  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.45 
 
 		 212 aa  99.4  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.19 
 
 		 211 aa  99.4  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3644  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.95 
 
 		 204 aa  98.6  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31 
 
 		 204 aa  98.2  7e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.77 
 
 		 211 aa  97.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2796  lysine exporter protein LysE/YggA  29.33 
 
 		 214 aa  97.1  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3976  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  34.31 
 
 		 203 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.955446 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1757  lysine exporter protein LysE/YggA  29.95 
 
 		 214 aa  95.5  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.290271  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1800  threonine efflux protein, putative  29.81 
 
 		 212 aa  95.1  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0717  lysine exporter protein LysE/YggA  28.8 
 
 		 204 aa  94.7  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0732  lysine exporter protein LysE/YggA  34.48 
 
 		 204 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.824462  normal  0.397861 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4189  lysine exporter protein LysE/YggA  29.56 
 
 		 212 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7469  lysine exporter protein LysE/YggA  32.07 
 
 		 205 aa  93.2  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3404  lysine exporter protein LysE/YggA  29.21 
 
 		 211 aa  93.2  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02476  hypothetical protein  30 
 
 		 211 aa  93.2  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3488  lysine exporter protein LysE/YggA  31.22 
 
 		 223 aa  92.4  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.84 
 
 		 204 aa  92.4  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0596  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29 
 
 		 230 aa  92  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003627  putative threonine efflux protein  29.47 
 
 		 231 aa  91.7  8e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2771  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.25 
 
 		 203 aa  91.7  8e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2461  lysine exporter protein LysE/YggA  32.34 
 
 		 210 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283309  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1219  hypothetical protein  29.9 
 
 		 219 aa  91.3  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1476  lysine exporter protein LysE/YggA  33.85 
 
 		 212 aa  90.5  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3003  putative homoserine/threonine efflux protein  29.1 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1213  hypothetical protein  28.95 
 
 		 219 aa  90.1  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1798  amino acid transport protein, LysE type  30.92 
 
 		 213 aa  89.7  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02071  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33 
 
 		 208 aa  90.1  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0424528  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0921  putative threonine efflux protein  30.6 
 
 		 205 aa  89.4  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6764  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.85 
 
 		 211 aa  89  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406386  normal  0.273065 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2833  hypothetical protein  33.33 
 
 		 212 aa  89.4  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3653  hypothetical protein  30.54 
 
 		 213 aa  89  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5352  lysine exporter protein LysE/YggA  31.77 
 
 		 204 aa  88.6  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3581  lysine exporter protein LysE/YggA  27.57 
 
 		 222 aa  88.2  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0765  threonine efflux protein, putative  28.51 
 
 		 234 aa  88.2  7e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2768  lysine exporter protein LysE/YggA  28.02 
 
 		 221 aa  88.2  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3452  LysE family translocator protein  27.03 
 
 		 204 aa  87.4  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0782  LysE family translocator protein  27.57 
 
 		 204 aa  87.4  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.492943  normal  0.203666 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3987  hypothetical protein  30.73 
 
 		 204 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1343  LysE family translocator protein  36.6 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.478822 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2456  putative homoserine/threonine efflux protein  29.84 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.506268  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1731  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 		 209 aa  87  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.820642  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43570  hypothetical protein  30.15 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.443465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4164  RhtB family transporter  30.25 
 
 		 213 aa  85.5  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  28.8 
 
 		 210 aa  85.9  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  28.27 
 
 		 210 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  28.8 
 
 		 210 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3063  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.19 
 
 		 210 aa  85.5  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  28.27 
 
 		 210 aa  85.1  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1333  lysine exporter protein LysE/YggA  28.65 
 
 		 212 aa  85.1  6e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4247  putative homoserine/threonine efflux protein  28.35 
 
 		 208 aa  85.5  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000239469 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  28.27 
 
 		 210 aa  85.1  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  31.55 
 
 		 210 aa  85.1  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002089  threonine efflux protein  29.95 
 
 		 223 aa  84.7  9e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2383  homoserine/threonine efflux protein, putative  30.22 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1031  hypothetical protein  28.95 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.332162  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2495  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.58 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000331121  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1641  lysine exporter protein LysE/YggA  28.64 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.950543  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1728  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.12 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000259292  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  26.98 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0286  lysine exporter protein LysE/YggA  29.9 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2059  lysine exporter protein LysE/YggA  30.16 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  30.85 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>