More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1150 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1150  amino acid transporter LysE  100 
 
 		 204 aa  402  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0391  hypothetical protein  45.05 
 
 		 204 aa  186  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000550  putative threonine efflux protein  43.14 
 
 		 204 aa  184  6e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1031  lysine exporter protein LysE/YggA  43.56 
 
 		 204 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0778058  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1064  lysine exporter protein LysE/YggA  43.56 
 
 		 204 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150207  normal  0.873963 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0962  lysine exporter protein LysE/YggA  43.56 
 
 		 204 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.55802  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2930  lysine exporter protein LysE/YggA  43.63 
 
 		 205 aa  171  5e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000123984  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2828  lysine exporter protein LysE/YggA  44.39 
 
 		 202 aa  171  5e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192947  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3224  lysine exporter protein LysE/YggA  43.07 
 
 		 204 aa  171  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0632575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0890  lysine exporter protein LysE/YggA  43.07 
 
 		 204 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3132  lysine exporter protein LysE/YggA  43.07 
 
 		 204 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0792555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3991  lysine exporter protein LysE/YggA  42.65 
 
 		 204 aa  170  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.1147  normal  0.39027 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3076  lysine exporter protein LysE/YggA  43.63 
 
 		 204 aa  170  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3328  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.07 
 
 		 204 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.740014  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3657  amino acid transporter LysE  42.08 
 
 		 229 aa  168  4e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3318  lysine exporter protein LysE/YggA  43.14 
 
 		 204 aa  165  4e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.3253  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3692  lysine exporter protein (LysE/YggA)  42.4 
 
 		 218 aa  165  5e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0974  lysine exporter protein LysE/YggA  42.57 
 
 		 204 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.253527  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2833  amino acid transporter LysE  41.09 
 
 		 208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.318432  normal  0.661514 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3094  lysine exporter protein LysE/YggA  40.59 
 
 		 205 aa  160  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3935  lysine exporter protein LysE/YggA  39.71 
 
 		 203 aa  154  6e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05339  putative threonine efflux protein  41.14 
 
 		 187 aa  152  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2922  lysine exporter protein LysE/YggA  37.25 
 
 		 206 aa  142  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0372  lysine exporter protein LysE/YggA  38.57 
 
 		 217 aa  132  3e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.83228  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.95 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0078  amino acid efflux protein  29.85 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.67 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0717  lysine exporter protein LysE/YggA  32.02 
 
 		 204 aa  109  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0596  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.02 
 
 		 230 aa  109  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3644  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.18 
 
 		 204 aa  108  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  28.23 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3961  lysine exporter protein LysE/YggA  33.51 
 
 		 203 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3778  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.51 
 
 		 203 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0921  putative threonine efflux protein  33.51 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3987  hypothetical protein  32.2 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0490  lysine exporter protein LysE/YggA  32.99 
 
 		 203 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1219  hypothetical protein  29.02 
 
 		 219 aa  101  8e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29100  hypothetical protein  32.02 
 
 		 204 aa  101  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136638 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1213  hypothetical protein  30.16 
 
 		 219 aa  100  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4247  putative homoserine/threonine efflux protein  29.76 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000239469 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3404  lysine exporter protein LysE/YggA  30.39 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3976  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3663  lysine exporter protein LysE/YggA  28.5 
 
 		 209 aa  99  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4710  lysine exporter protein LysE/YggA  29.85 
 
 		 209 aa  99  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1031  hypothetical protein  31 
 
 		 212 aa  98.2  7e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.332162  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003627  putative threonine efflux protein  34.2 
 
 		 231 aa  97.4  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1256  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.8 
 
 		 205 aa  97.1  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6038  lysine exporter protein LysE/YggA  31.16 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0782  LysE family translocator protein  29.26 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.492943  normal  0.203666 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3581  lysine exporter protein LysE/YggA  29.26 
 
 		 222 aa  96.7  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5674  lysine exporter protein LysE/YggA  31.16 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1435  amino acid transporter LysE  29.32 
 
 		 210 aa  95.9  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.410501  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2162  lysine exporter protein LysE/YggA  29.06 
 
 		 209 aa  96.3  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727412  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.8 
 
 		 205 aa  96.3  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3003  putative homoserine/threonine efflux protein  29.06 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1744  lysine exporter protein LysE/YggA  34.95 
 
 		 208 aa  96.3  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0257251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1701  amino acid transporter LysE  33.5 
 
 		 208 aa  95.5  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0912104  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1925  putative homoserine/threonine efflux protein  33.5 
 
 		 208 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82308e-38 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3452  LysE family translocator protein  29.79 
 
 		 204 aa  95.5  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  28.08 
 
 		 210 aa  94.7  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2796  lysine exporter protein LysE/YggA  30.62 
 
 		 214 aa  94.7  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  28.57 
 
 		 210 aa  94.4  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  28.57 
 
 		 210 aa  94.4  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  28.08 
 
 		 210 aa  94  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  28.08 
 
 		 210 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1731  lysine exporter protein LysE/YggA  29.06 
 
 		 209 aa  94  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.820642  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  28.08 
 
 		 210 aa  94  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43570  hypothetical protein  29.61 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.443465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6528  lysine exporter protein LysE/YggA  31 
 
 		 205 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02476  hypothetical protein  31.68 
 
 		 211 aa  93.6  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1849  amino acid transporter LysE  29.56 
 
 		 212 aa  92.8  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.402974  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1920  amino acid transporter LysE  29.56 
 
 		 212 aa  92.8  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2456  putative homoserine/threonine efflux protein  27.94 
 
 		 210 aa  92  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.506268  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1752  homoserine/threonine efflux protein  33.98 
 
 		 208 aa  91.3  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000289008  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1890  homoserine/threonine efflux protein  33.98 
 
 		 208 aa  91.3  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.131548  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3653  hypothetical protein  28.92 
 
 		 213 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1730  amino acid transporter LysE  31.58 
 
 		 208 aa  91.3  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000126843  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1757  lysine exporter protein LysE/YggA  29.25 
 
 		 214 aa  90.9  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.290271  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2383  homoserine/threonine efflux protein, putative  29.95 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0531  lysine exporter protein LysE/YggA  32.5 
 
 		 203 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3063  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.46 
 
 		 210 aa  89.4  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0936  lysine exporter protein LysE/YggA  28.36 
 
 		 212 aa  89.7  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.950459  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.37 
 
 		 208 aa  89.7  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1800  threonine efflux protein, putative  28.37 
 
 		 212 aa  89.7  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0530  amino acid transporter LysE  31.55 
 
 		 203 aa  89.4  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2043  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.44 
 
 		 208 aa  89  4e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000125036  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.99 
 
 		 211 aa  89.4  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1333  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 		 212 aa  89  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0111  hypothetical protein  28 
 
 		 215 aa  89  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3488  lysine exporter protein LysE/YggA  29.1 
 
 		 223 aa  88.6  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0699  amino acid transporter LysE  28.71 
 
 		 204 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0691811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2572  hypothetical protein  28.26 
 
 		 222 aa  88.2  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1060  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.19 
 
 		 209 aa  88.6  7e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.741251  normal  0.078929 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.92 
 
 		 212 aa  88.2  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2059  lysine exporter protein LysE/YggA  29.5 
 
 		 211 aa  88.2  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.41 
 
 		 207 aa  88.2  8e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5694  lysine exporter protein LysE/YggA  30.37 
 
 		 205 aa  88.2  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3142  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.72 
 
 		 208 aa  87.8  9e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0269907  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2461  lysine exporter protein LysE/YggA  29.8 
 
 		 210 aa  87.8  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4118  RhtB family transporter  26.37 
 
 		 213 aa  87.8  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>