More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0858 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0858  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 211 aa  408  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.74992  normal  0.0747821 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2845  hypothetical protein  49.51 
 
 		 209 aa  201  8e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.85185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0857  lysine exporter protein LysE/YggA  43 
 
 		 213 aa  139  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.154499  normal  0.0418461 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0418  lysine exporter protein LysE/YggA  37.2 
 
 		 213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3295  lysine exporter protein LysE/YggA  35.38 
 
 		 213 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4166  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 		 212 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77037  normal  0.273019 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4336  RhtB family transporter  36.59 
 
 		 212 aa  105  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5077  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.32 
 
 		 208 aa  96.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3132  lysine exporter protein LysE/YggA  34.76 
 
 		 212 aa  95.9  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2794  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.17 
 
 		 204 aa  94.7  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.940238  normal  0.870805 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6091  lysine exporter protein LysE/YggA  31.82 
 
 		 209 aa  94.7  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0972486  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1986  lysine exporter protein LysE/YggA  31.82 
 
 		 209 aa  94.7  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4118  RhtB family transporter  30.99 
 
 		 213 aa  86.7  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5239  lysine exporter protein LysE/YggA  33.84 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3407  lysine exporter protein LysE/YggA  32.83 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2939  lysine exporter protein LysE/YggA  30.7 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0936  lysine exporter protein LysE/YggA  30.66 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.950459  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3976  lysine exporter protein LysE/YggA  32.83 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0289  RhtB family transporter  31.58 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3404  lysine exporter protein LysE/YggA  30.3 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4189  lysine exporter protein LysE/YggA  31.05 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5879  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2697  lysine exporter protein LysE/YggA  32.32 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1849  amino acid transporter LysE  30.37 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.402974  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1920  amino acid transporter LysE  30.37 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2347  lysine exporter protein LysE/YggA  30.61 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4978  lysine exporter protein LysE/YggA  31.12 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2075  amino acid efflux pump, RhtB family protein  30.29 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.400632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0399  putative homoserine/threonine efflux protein  25.37 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5694  lysine exporter protein LysE/YggA  32.51 
 
 		 205 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.666323 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00283  neutral amino-acid efflux system  25.37 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0394  putative homoserine/threonine efflux protein  25.37 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3278  homoserine/threonine efflux pump  25.37 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3296  homoserine/threonine efflux pump  25.37 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00287  hypothetical protein  25.37 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0352  putative homoserine/threonine efflux protein  25.37 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0359  putative homoserine/threonine efflux protein  25.63 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.672304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0396  putative transport protein  27.32 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979225  hitchhiker  0.00000000000454708 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0417  putative transport protein  27.32 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0459  putative transport protein  27.32 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321828 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1213  hypothetical protein  28.49 
 
 		 219 aa  75.1  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2743  lysine exporter protein LysE/YggA  31.98 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0265185  normal  0.024176 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0399  putative transport protein  27.32 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0405  putative transport protein  27.32 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000145475 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4060  lysine exporter protein LysE/YggA  30.96 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1219  hypothetical protein  27.96 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3461  lysine exporter protein LysE/YggA  30.96 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0912  lysine exporter protein LysE/YggA  29.21 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1641  lysine exporter protein LysE/YggA  30.3 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.950543  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7469  lysine exporter protein LysE/YggA  31.82 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  31.75 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2059  lysine exporter protein LysE/YggA  31.68 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.75 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2958  threonine efflux protein  31.11 
 
 		 214 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10248  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2239  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.04 
 
 		 204 aa  72  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.678713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6528  lysine exporter protein LysE/YggA  32.18 
 
 		 205 aa  72  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  37.78 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0493  lysine exporter protein LysE/YggA  28.93 
 
 		 219 aa  71.2  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0233  RhtB family transporter  27.93 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3488  lysine exporter protein LysE/YggA  28.42 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06605  putative threonine efflux protein  33.06 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  35.29 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  28.23 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  28.23 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  29.23 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  28.23 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  28.23 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3385  lysine exporter protein LysE/YggA  32.56 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201071 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1814  lysine exporter protein LysE/YggA  32.45 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000397951  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3663  lysine exporter protein LysE/YggA  30.65 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3450  lysine exporter protein LysE/YggA  37.09 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.270784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  28.23 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3214  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.34 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  28.23 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6400  lysine exporter protein LysE/YggA  27.03 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.436888 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5115  lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.07 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.127177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  28.3 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0699  amino acid transporter LysE  31.52 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0691811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5270  lysine exporter protein LysE/YggA  36.42 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27713  normal  0.342162 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1147  transporter, LysE family  32.67 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6038  lysine exporter protein LysE/YggA  28.8 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6476  lysine exporter protein LysE/YggA  27.78 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.772782 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2572  hypothetical protein  28.21 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5674  lysine exporter protein LysE/YggA  28.8 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0587  lysine exporter protein LysE/YggA  27.23 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3961  lysine exporter protein LysE/YggA  30.91 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0111  hypothetical protein  27.32 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3778  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.91 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0490  lysine exporter protein LysE/YggA  30.91 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  29.19 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4710  lysine exporter protein LysE/YggA  29.26 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0519  lysine exporter protein LysE/YggA  37.37 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3973  threonine efflux system  27.94 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3097  lysine exporter protein LysE/YggA  26.13 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3366  lysine exporter protein LysE/YggA  26.07 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2482  lysine exporter protein LysE/YggA  27.4 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.13 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6435  lysine exporter protein LysE/YggA  27.8 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2617  lysine exporter protein LysE/YggA  31.43 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.635296 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>