More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2075 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2075  amino acid efflux pump, RhtB family protein  100 
 
 		 212 aa  413  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.400632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5879  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  90.57 
 
 		 212 aa  350  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3132  lysine exporter protein LysE/YggA  59.43 
 
 		 212 aa  231  5e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3407  lysine exporter protein LysE/YggA  57.82 
 
 		 210 aa  230  9e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5239  lysine exporter protein LysE/YggA  57.35 
 
 		 210 aa  228  7e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2697  lysine exporter protein LysE/YggA  56.87 
 
 		 210 aa  224  7e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4060  lysine exporter protein LysE/YggA  56.87 
 
 		 210 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3461  lysine exporter protein LysE/YggA  56.87 
 
 		 210 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4166  lysine exporter protein LysE/YggA  48.06 
 
 		 212 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77037  normal  0.273019 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6091  lysine exporter protein LysE/YggA  46.34 
 
 		 209 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0972486  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1986  lysine exporter protein LysE/YggA  46.34 
 
 		 209 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3295  lysine exporter protein LysE/YggA  43.9 
 
 		 213 aa  179  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4336  RhtB family transporter  49.3 
 
 		 212 aa  177  9e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5077  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.38 
 
 		 208 aa  175  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128072  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2794  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.04 
 
 		 204 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.940238  normal  0.870805 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0418  lysine exporter protein LysE/YggA  40.29 
 
 		 213 aa  152  4e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0912  lysine exporter protein LysE/YggA  40.1 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0857  lysine exporter protein LysE/YggA  35.68 
 
 		 213 aa  105  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.154499  normal  0.0418461 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2845  hypothetical protein  34.47 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.85185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3973  threonine efflux system  34 
 
 		 206 aa  97.4  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03702  threonine efflux system  32.65 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03651  hypothetical protein  32.65 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4190  threonine efflux system  32.65 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587316 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4344  threonine efflux system  31.28 
 
 		 204 aa  94  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4156  homoserine/threonine efflux pump  32.65 
 
 		 206 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4290  threonine efflux system  32.65 
 
 		 206 aa  93.2  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4047  threonine efflux system  32.65 
 
 		 204 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4185  threonine efflux system  32.65 
 
 		 206 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5264  threonine efflux system  32.65 
 
 		 204 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.613043 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  39.04 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4346  threonine efflux system  30.77 
 
 		 206 aa  88.6  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.459932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4286  threonine efflux system  30.77 
 
 		 206 aa  88.6  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.492935 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4188  threonine efflux system  30.77 
 
 		 206 aa  88.2  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4167  threonine efflux system  30.77 
 
 		 206 aa  88.6  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4239  threonine efflux system  31.16 
 
 		 206 aa  86.3  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.588967  normal  0.890135 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  29.74 
 
 		 206 aa  85.1  6e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2958  threonine efflux protein  33.85 
 
 		 214 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10248  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.47 
 
 		 218 aa  84.7  9e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  31.67 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  31.67 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.9 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0194  threonine efflux system  30.35 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6400  lysine exporter protein LysE/YggA  36.84 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.436888 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3099  LysE family protein  30.81 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2743  lysine exporter protein LysE/YggA  32.81 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0265185  normal  0.024176 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4996  lysine exporter protein LysE/YggA  34.24 
 
 		 243 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.53634 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2950  LysE family protein  30.81 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1522  LysE family protein  30.81 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0068  LysE family protein  30.81 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0856  lysine exporter protein LysE/YggA  30.29 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.985682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3097  lysine exporter protein LysE/YggA  37.37 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  31.11 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.43 
 
 		 218 aa  81.3  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  30.56 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0194  threonine efflux system  29.95 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.331917  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5270  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.52 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.912842 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4153  threonine efflux system  31.63 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000179823  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0976  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.65 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1350  amino acid efflux pump, RhtB family protein  30.98 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641415  normal  0.0201928 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3963  threonine efflux system  31.63 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245678  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.89 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0556  threonine efflux system  29.56 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0219  threonine efflux system  29.56 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0721  amino acid efflux pump, RhtB family protein  29.17 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.914234  normal  0.346615 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3997  threonine efflux system  29.56 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4548  lysine exporter protein LysE/YggA  35.14 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0827  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.61 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.282435 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  31.25 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  32.02 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1886  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.04 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.259351  normal  0.142425 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003257  threonine efflux protein  28.8 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6435  lysine exporter protein LysE/YggA  29.17 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0757  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.61 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal  0.0580671 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1798  amino acid transport protein, LysE type  27.7 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.77 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  33.08 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1369  lysine exporter protein LysE/YggA  30.98 
 
 		 194 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459986  normal  0.11161 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  37.3 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4718  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.72 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.721084 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2959  putative threonine efflux protein  34.39 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3293  threonine efflux protein, putative  34.39 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0428  LysE type translocator  34.39 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0377494  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0246  LysE family translocator protein  34.39 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2129  putative threonine efflux protein  34.39 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3387  putative threonine efflux protein  34.39 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6503  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.51 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2701  lysine exporter protein LysE/YggA  32.33 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.224581 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  31.46 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2843  lysine exporter protein LysE/YggA  32.33 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0814  hypothetical protein  30.17 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.81 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0043  lysine exporter protein LysE/YggA  29.3 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.822659  normal  0.173523 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0100  lysine exporter protein LysE/YggA  32.61 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4074  RhtB family transporter  30.65 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.472652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  28 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  28 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  28 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  33.08 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  28 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  28 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>