More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1369 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1369  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
194 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459986  normal  0.11161 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5819  lysine exporter protein LysE/YggA  93.78 
 
 
215 aa  360  6e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3884  lysine exporter protein LysE/YggA  93.26 
 
 
215 aa  359  2e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  93.26 
 
 
215 aa  359  2e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3921  lysine exporter protein LysE/YggA  92.78 
 
 
210 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4385  lysine exporter protein LysE/YggA  91.75 
 
 
234 aa  353  1e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  0.231735 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4996  lysine exporter protein LysE/YggA  89.12 
 
 
243 aa  334  3.9999999999999995e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.53634 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5270  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  85.49 
 
 
210 aa  334  5e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.912842 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1350  amino acid efflux pump, RhtB family protein  84.97 
 
 
210 aa  333  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641415  normal  0.0201928 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2255  lysine exporter protein LysE/YggA  79.79 
 
 
210 aa  308  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.674089 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2078  lysine exporter protein LysE/YggA  79.27 
 
 
213 aa  307  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3652  amino acid transporter LysE  78.24 
 
 
210 aa  305  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0913574 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2818  lysine exporter protein LysE/YggA  78.24 
 
 
210 aa  301  3.0000000000000004e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2711  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  73.58 
 
 
210 aa  299  2e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.223328  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6503  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  78.76 
 
 
210 aa  295  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0208  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  75.77 
 
 
211 aa  294  6e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5273  lysine exporter protein LysE/YggA  74.61 
 
 
210 aa  293  9e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0757  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  70.62 
 
 
288 aa  288  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal  0.0580671 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0827  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  70.62 
 
 
210 aa  289  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.282435 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  72.54 
 
 
211 aa  285  4e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.889262  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3551  lysine exporter protein LysE/YggA  72.02 
 
 
210 aa  281  5.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6435  lysine exporter protein LysE/YggA  72.54 
 
 
212 aa  279  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0333  lysine exporter protein LysE/YggA  69.43 
 
 
210 aa  267  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.547717  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0976  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  69.95 
 
 
209 aa  266  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0412  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  68.39 
 
 
210 aa  263  8.999999999999999e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0043  lysine exporter protein LysE/YggA  68.91 
 
 
210 aa  262  3e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.822659  normal  0.173523 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0814  hypothetical protein  65.98 
 
 
210 aa  261  6e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0992  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  67.88 
 
 
232 aa  257  8e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0366  RhtB family transporter  69.43 
 
 
210 aa  252  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4548  lysine exporter protein LysE/YggA  62.69 
 
 
212 aa  247  8e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4074  RhtB family transporter  57.59 
 
 
215 aa  225  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.472652  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4244  lysine exporter protein LysE/YggA  55.67 
 
 
212 aa  224  4e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4405  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  58.64 
 
 
215 aa  222  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4224  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  49.23 
 
 
211 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.59284  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2465  lysine exporter protein LysE/YggA  58.64 
 
 
214 aa  215  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.19798  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6153  lysine exporter protein LysE/YggA  56.25 
 
 
215 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.757704  normal  0.682937 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3365  lysine exporter protein LysE/YggA  56.77 
 
 
211 aa  213  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5788  lysine exporter protein LysE/YggA  56.25 
 
 
215 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.51444  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6633  lysine exporter protein LysE/YggA  55.73 
 
 
215 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6036  lysine exporter protein LysE/YggA  55.21 
 
 
229 aa  205  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7707  lysine exporter protein LysE/YggA  54.69 
 
 
215 aa  205  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897812  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5806  lysine exporter protein LysE/YggA  54.69 
 
 
215 aa  202  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0739  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  57.22 
 
 
210 aa  196  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3214  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  56.02 
 
 
198 aa  192  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4218  L-lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  51.04 
 
 
212 aa  173  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  41.24 
 
 
210 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  41.36 
 
 
210 aa  148  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  40.53 
 
 
210 aa  144  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  39.18 
 
 
210 aa  143  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  38.86 
 
 
210 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  38.86 
 
 
210 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2416  RhtB family transporter  38.74 
 
 
210 aa  137  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3344  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.84 
 
 
210 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240621 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  40.41 
 
 
210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  38.46 
 
 
206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.42 
 
 
223 aa  125  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4686  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.69 
 
 
216 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.02 
 
 
208 aa  123  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.78 
 
 
209 aa  122  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.81 
 
 
218 aa  121  8e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  38.89 
 
 
215 aa  120  9e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0356  lysine exporter protein LysE/YggA  42.21 
 
 
203 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.404606 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0798  lysine exporter protein LysE/YggA  36.27 
 
 
206 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.51 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.81 
 
 
218 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.27 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5581  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.24 
 
 
212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0037  lysine exporter protein LysE/YggA  36.18 
 
 
214 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.86 
 
 
209 aa  110  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  30.26 
 
 
208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  34.69 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.67 
 
 
211 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  33.67 
 
 
211 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1238  lysine exporter protein LysE/YggA  38.58 
 
 
212 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0801686  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  33.67 
 
 
211 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  33.67 
 
 
211 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  33.67 
 
 
211 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  33.67 
 
 
211 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  33.67 
 
 
211 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1194  amino acid transporter LysE  32.98 
 
 
206 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00235397  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2862  lysine exporter protein LysE/YggA  34.55 
 
 
213 aa  108  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1147  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.16 
 
 
208 aa  107  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1998  amino acid efflux pump, RhtB family protein  33.68 
 
 
213 aa  105  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457454  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6476  lysine exporter protein LysE/YggA  35.5 
 
 
211 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.772782 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  34.18 
 
 
204 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  34.69 
 
 
217 aa  103  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3130  lysine exporter protein LysE/YggA  36.36 
 
 
215 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.376796 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0823  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.7 
 
 
208 aa  103  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000549104  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1886  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 
214 aa  103  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.259351  normal  0.142425 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3911  putative amino acid (threonine) efflux protein  37.44 
 
 
208 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.856049  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4987  lysine exporter protein LysE/YggA  33.67 
 
 
206 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1363  LysE family translocator protein  30.26 
 
 
213 aa  102  3e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.640513  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4414  amino acid efflux pump, RhtB family protein  35.68 
 
 
213 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.897061 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1421  lysine exporter protein LysE/YggA  34.01 
 
 
207 aa  102  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5636  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.08 
 
 
211 aa  102  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0625165 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4641  lysine exporter protein LysE/YggA  32.28 
 
 
207 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  32.65 
 
 
208 aa  101  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0452  lysine exporter protein LysE/YggA  40.26 
 
 
211 aa  101  7e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5170  lysine exporter protein LysE/YggA  32.28 
 
 
207 aa  101  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5281  lysine exporter protein LysE/YggA  33.67 
 
 
206 aa  101  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.98662  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>