More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3100 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3100  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
212 aa  399  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4540  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  49.74 
 
 
205 aa  166  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529468  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0365  RhtB family transporter  44.22 
 
 
205 aa  153  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4606  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.72 
 
 
242 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.118982 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4341  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.72 
 
 
205 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.791137 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0945  lysine exporter protein LysE/YggA  44.67 
 
 
203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1173  lysine exporter protein LysE/YggA  45.99 
 
 
206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.813849 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3434  lysine exporter protein LysE/YggA  43.68 
 
 
203 aa  137  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0005  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.28 
 
 
203 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.325089 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3016  lysine exporter protein LysE/YggA  42.08 
 
 
205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2754  lysine exporter protein LysE/YggA  48.65 
 
 
205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679259  normal  0.0643821 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4806  lysine exporter protein LysE/YggA  43.48 
 
 
203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135415  normal  0.130992 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0186  amino acid transporter LysE  41.4 
 
 
205 aa  128  5.0000000000000004e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0005  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.63 
 
 
203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.610199  normal  0.647138 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4677  lysine exporter protein LysE/YggA  45.11 
 
 
203 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.532936  normal  0.98744 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4152  lysine exporter protein LysE/YggA  44.57 
 
 
203 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3363  lysine exporter protein LysE/YggA  43.01 
 
 
203 aa  122  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0656798  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2130  lysine exporter protein LysE/YggA  38.97 
 
 
202 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00000391872  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3492  lysine exporter protein LysE/YggA  33.68 
 
 
206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.724976  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1208  LysE family translocator protein  44.62 
 
 
233 aa  104  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.905359  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1358  LysE family protein  44.62 
 
 
203 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2472  LysE family protein  44.62 
 
 
203 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.082911  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1281  LysE family translocator protein  44.62 
 
 
203 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.18583  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0342  LysE family protein  44.62 
 
 
203 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0949  LysE family protein  44.62 
 
 
203 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0621  LysE family protein  44.62 
 
 
217 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1305  lysine exporter protein LysE/YggA  32.14 
 
 
204 aa  101  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2151  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35 
 
 
230 aa  97.8  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  34.8 
 
 
206 aa  90.9  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  34.54 
 
 
211 aa  91.3  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.69 
 
 
213 aa  88.2  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.5 
 
 
213 aa  87  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0101  lysine exporter protein LysE/YggA  34.21 
 
 
205 aa  86.3  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.11084  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1618  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 
209 aa  85.5  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360682  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0010  lysine exporter protein LysE/YggA  34.29 
 
 
207 aa  85.5  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.803659 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2432  RhtB family transporter  30.54 
 
 
207 aa  85.1  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.274649  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  33.49 
 
 
208 aa  85.1  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0004  lysine exporter protein LysE/YggA  33.71 
 
 
206 aa  84.7  8e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.309415  normal  0.377015 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1394  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.5 
 
 
207 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  29.79 
 
 
205 aa  83.6  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 
204 aa  81.6  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00299  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.12 
 
 
204 aa  80.9  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3890  lysine exporter protein (LysE/YggA)  42.28 
 
 
137 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.503752  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1078  lysine exporter protein LysE/YggA  28.35 
 
 
204 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4604  lysine exporter protein LysE/YggA  34.83 
 
 
203 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  30.05 
 
 
212 aa  78.6  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4143  lysine exporter protein LysE/YggA  32.83 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218888  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1886  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.8 
 
 
214 aa  75.9  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.259351  normal  0.142425 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2456  lysine exporter protein LysE/YggA  35.33 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010294  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2944  lysine exporter protein LysE/YggA  28.96 
 
 
203 aa  75.9  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0092  lysine exporter protein LysE/YggA  31.35 
 
 
211 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.57 
 
 
208 aa  75.1  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1345  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.96 
 
 
208 aa  74.7  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123136  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1401  lysine exporter protein LysE/YggA  32.58 
 
 
204 aa  74.3  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.582865  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1303  amino acid transporter LysE  33.67 
 
 
201 aa  74.3  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.520276  normal  0.253886 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1248  amino acid transporter LysE  32.32 
 
 
255 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.483142 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.48 
 
 
211 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0236  lysine exporter protein LysE/YggA  35.98 
 
 
214 aa  73.9  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0356  lysine exporter protein LysE/YggA  34.1 
 
 
203 aa  72.8  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.404606 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0287  lysine exporter protein LysE/YggA  33 
 
 
214 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167258  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2107  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.314049 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2656  lysine exporter protein LysE/YggA  30.89 
 
 
207 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03703  neutral amino-acid efflux system  32.79 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5265  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.79 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.624144 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4155  homoserine/threonine efflux pump  32.79 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4048  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.79 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4191  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.97 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349541 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4291  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.79 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1277  lysine exporter protein LysE/YggA  31.82 
 
 
205 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.476992 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4184  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.79 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.340963 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03652  hypothetical protein  32.79 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  29.84 
 
 
212 aa  72  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2698  putative threonine efflux protein  34.64 
 
 
208 aa  72  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.575587  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0856  lysine exporter protein LysE/YggA  37.12 
 
 
200 aa  72  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.985682  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6784  LysE family amino acid efflux protein  33.15 
 
 
206 aa  72  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0400664 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2902  lysine exporter protein LysE/YggA  29.44 
 
 
206 aa  71.6  0.000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3206  lysine exporter protein LysE/YggA  32.82 
 
 
208 aa  71.6  0.000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.84476  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.93 
 
 
208 aa  71.6  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2722  lysine exporter protein LysE/YggA  31.38 
 
 
207 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.299821  normal  0.0652266 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  28.11 
 
 
205 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4345  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.24 
 
 
206 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2870  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.06 
 
 
211 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.75176  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6172  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.25 
 
 
211 aa  70.5  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  30.37 
 
 
207 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.071463  normal  0.0626704 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4287  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.61 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.414866 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69310  LysE family efflux protein  30.77 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4347  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.61 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.499409  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4152  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.98 
 
 
206 aa  69.7  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000943916  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0452  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4189  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.61 
 
 
206 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4168  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.61 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5994  hypothetical protein  30.77 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.9 
 
 
208 aa  68.9  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2660  lysine exporter protein LysE/YggA  29.8 
 
 
217 aa  68.9  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0329872  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0220  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.4 
 
 
206 aa  68.9  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3290  lysine exporter protein LysE/YggA  32 
 
 
206 aa  68.6  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76234  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.69 
 
 
212 aa  68.6  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2786  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.15 
 
 
206 aa  68.2  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.57 
 
 
206 aa  68.2  0.00000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>