More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_14510 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_14510  putative threonine efflux protein  100 
 
 		 211 aa  402  1e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.93793  normal  0.0749541 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0286  lysine exporter protein LysE/YggA  37.66 
 
 		 211 aa  99.8  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.74 
 
 		 208 aa  99.4  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.95 
 
 		 209 aa  98.6  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  32.66 
 
 		 208 aa  97.8  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2572  hypothetical protein  30.67 
 
 		 222 aa  97.1  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.33 
 
 		 209 aa  95.5  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  35.05 
 
 		 217 aa  95.5  5e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2459  lysine exporter protein LysE/YggA  32.54 
 
 		 215 aa  94.7  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.593208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02483  hypothetical protein  33.18 
 
 		 209 aa  94.4  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.82 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4152  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.5 
 
 		 206 aa  92.4  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000943916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1730  amino acid transporter LysE  31.16 
 
 		 208 aa  92  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000126843  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3118  lysine exporter protein LysE/YggA  32.49 
 
 		 235 aa  92  6e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.159168  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2043  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.53 
 
 		 208 aa  91.7  7e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000125036  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  34.74 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  31.22 
 
 		 213 aa  90.9  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  32.35 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0850  lysine exporter protein LysE/YggA  33.86 
 
 		 211 aa  90.5  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0203758  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.84 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2925  amino acid transporter LysE  33.51 
 
 		 209 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0920317  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6784  LysE family amino acid efflux protein  34.98 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400664 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0369  lysine exporter protein LysE/YggA  37.34 
 
 		 208 aa  90.1  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.177582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3860  lysine exporter protein LysE/YggA  33.68 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000283394 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29100  hypothetical protein  39.19 
 
 		 204 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136638 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1476  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.83 
 
 		 205 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.779186  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4987  lysine exporter protein LysE/YggA  37.58 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.98 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4254  lysine exporter protein LysE/YggA  32.67 
 
 		 214 aa  89.7  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3987  hypothetical protein  36.49 
 
 		 204 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0078  amino acid efflux protein  29.7 
 
 		 205 aa  89.4  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4224  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.07 
 
 		 211 aa  89.4  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.59284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  32.45 
 
 		 209 aa  89.4  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1798  amino acid transport protein, LysE type  29.35 
 
 		 213 aa  89  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.54 
 
 		 208 aa  89  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  38.73 
 
 		 211 aa  88.6  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  38.73 
 
 		 211 aa  88.6  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  38.73 
 
 		 211 aa  88.6  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  38.73 
 
 		 211 aa  88.6  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  38.73 
 
 		 211 aa  88.6  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  38.73 
 
 		 211 aa  88.6  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  38.73 
 
 		 211 aa  88.6  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4501  lysine exporter protein (LysE/YggA)  31.98 
 
 		 214 aa  88.6  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000135665 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3086  lysine exporter protein LysE/YggA  37.58 
 
 		 206 aa  88.6  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5281  lysine exporter protein LysE/YggA  37.58 
 
 		 206 aa  88.6  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.98662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.56 
 
 		 208 aa  88.6  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5636  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.19 
 
 		 211 aa  88.2  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0625165 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0029  amino acid transporter LysE  32.56 
 
 		 222 aa  88.6  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0393564  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3800  LysE family translocator protein  32.56 
 
 		 222 aa  88.2  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00135005  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3861  LysE family translocator protein  32.56 
 
 		 222 aa  88.2  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0165555  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3121  amino acid transporter LysE  34.12 
 
 		 218 aa  88.2  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201026  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  30.88 
 
 		 211 aa  88.2  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  30.88 
 
 		 211 aa  88.2  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  39.76 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  35.05 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  31.71 
 
 		 212 aa  87.8  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  31.53 
 
 		 211 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4240  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.12 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.119305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3439  lysine exporter protein LysE/YggA  36.94 
 
 		 207 aa  87.4  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.783726 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3996  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.97 
 
 		 206 aa  87.4  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  28.27 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  30.5 
 
 		 217 aa  86.7  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.47 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0220  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.97 
 
 		 206 aa  87  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3991  lysine exporter protein LysE/YggA  31.61 
 
 		 204 aa  87  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.1147  normal  0.39027 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4347  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.12 
 
 		 206 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.499409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  31.37 
 
 		 211 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00531331  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0557  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.97 
 
 		 206 aa  87.4  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2922  lysine exporter protein LysE/YggA  33.51 
 
 		 206 aa  86.7  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  27.75 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0308  lysine exporter protein LysE/YggA  31.37 
 
 		 211 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000182648  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4287  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.12 
 
 		 206 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.414866 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  35.29 
 
 		 211 aa  86.3  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  39.16 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3224  lysine exporter protein LysE/YggA  31.61 
 
 		 204 aa  86.7  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0632575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2194  leucine export protein LeuE  34.57 
 
 		 223 aa  86.3  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.250499  normal  0.121922 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0890  lysine exporter protein LysE/YggA  31.61 
 
 		 204 aa  86.7  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0867  lysine exporter protein LysE/YggA  35.94 
 
 		 207 aa  86.3  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.627781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3132  lysine exporter protein LysE/YggA  31.61 
 
 		 204 aa  86.7  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0792555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  38.92 
 
 		 210 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0782  LysE family translocator protein  39.55 
 
 		 204 aa  85.9  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.492943  normal  0.203666 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0962  lysine exporter protein LysE/YggA  31.44 
 
 		 204 aa  85.9  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.55802  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  28.27 
 
 		 210 aa  85.9  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  28.27 
 
 		 210 aa  85.9  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3003  putative homoserine/threonine efflux protein  28.27 
 
 		 210 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1031  lysine exporter protein LysE/YggA  31.44 
 
 		 204 aa  86.3  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0778058  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1064  lysine exporter protein LysE/YggA  31.44 
 
 		 204 aa  86.3  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150207  normal  0.873963 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2456  putative homoserine/threonine efflux protein  26.7 
 
 		 210 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.506268  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1925  putative homoserine/threonine efflux protein  30.65 
 
 		 208 aa  85.5  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82308e-38 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4189  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.1 
 
 		 206 aa  85.5  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  27.75 
 
 		 210 aa  85.5  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0322  lysine exporter protein LysE/YggA  39.57 
 
 		 209 aa  85.5  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279488  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4168  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.95 
 
 		 206 aa  85.5  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  27.75 
 
 		 210 aa  85.5  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4345  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.3 
 
 		 206 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3105  lysine exporter protein LysE/YggA  35.94 
 
 		 207 aa  85.5  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4247  putative homoserine/threonine efflux protein  30.15 
 
 		 208 aa  85.5  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000239469 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.16 
 
 		 218 aa  85.1  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3657  amino acid transporter LysE  31.09 
 
 		 229 aa  85.1  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5050  lysine exporter protein LysE/YggA  35.37 
 
 		 218 aa  85.1  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.637848 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>