More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3010 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3010  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 211 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.346756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3056  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 211 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3025  lysine exporter protein LysE/YggA  98.58 
 
 		 211 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0913763 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0029  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.32 
 
 		 214 aa  137  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2381  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40 
 
 		 210 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000868866  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8095  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.44 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6863  efflux protein  39.45 
 
 		 218 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1798  amino acid transport protein, LysE type  30.65 
 
 		 213 aa  102  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02476  hypothetical protein  34.13 
 
 		 211 aa  99.8  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.98 
 
 		 212 aa  96.7  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2043  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.39 
 
 		 208 aa  95.9  4e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000125036  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1731  lysine exporter protein LysE/YggA  28.5 
 
 		 209 aa  94.7  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.820642  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4075  LysE family efflux protein  36.56 
 
 		 221 aa  94  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2162  lysine exporter protein LysE/YggA  28.36 
 
 		 209 aa  93.2  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727412  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.13 
 
 		 213 aa  92.8  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.295219  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1031  hypothetical protein  34.31 
 
 		 212 aa  92  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.332162  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003627  putative threonine efflux protein  31.43 
 
 		 231 aa  91.7  8e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2786  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.54 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  28 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  28.08 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1728  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.27 
 
 		 208 aa  90.1  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000259292  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.74 
 
 		 218 aa  90.5  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2660  lysine exporter protein LysE/YggA  31.71 
 
 		 217 aa  89.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0329872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2456  putative homoserine/threonine efflux protein  27.5 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.506268  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  28.08 
 
 		 210 aa  89  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  28.08 
 
 		 210 aa  89  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0286  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 		 211 aa  89.4  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3003  putative homoserine/threonine efflux protein  28.57 
 
 		 210 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.86 
 
 		 218 aa  89.4  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  27.59 
 
 		 210 aa  89  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  27.59 
 
 		 210 aa  89  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1667  lysine exporter protein LysE/YggA  34 
 
 		 209 aa  88.6  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.931902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.7 
 
 		 204 aa  88.6  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  34.76 
 
 		 215 aa  87  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.01 
 
 		 213 aa  85.9  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1730  amino acid transporter LysE  26.37 
 
 		 208 aa  85.1  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000126843  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1701  amino acid transporter LysE  27.86 
 
 		 208 aa  84.7  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0912104  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1925  putative homoserine/threonine efflux protein  27.86 
 
 		 208 aa  84.7  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82308e-38 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1333  lysine exporter protein LysE/YggA  30.37 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.52 
 
 		 213 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  31.28 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2383  homoserine/threonine efflux protein, putative  26.98 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  31.28 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  31.28 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  31.28 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.28 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1343  LysE family translocator protein  42.27 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.478822 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4247  putative homoserine/threonine efflux protein  26.87 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000239469 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3063  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.5 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  31.28 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  31.28 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2562  lysine exporter protein LysE/YggA  31.55 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  28.64 
 
 		 217 aa  81.6  0.000000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  28.72 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  32.83 
 
 		 208 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2500  lysine exporter protein LysE/YggA  32.35 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106725  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1752  homoserine/threonine efflux protein  27.86 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000289008  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0100  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.4 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1890  homoserine/threonine efflux protein  27.86 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.131548  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  31.22 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888062 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3591  lysine exporter protein LysE/YggA  31.98 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0048  lysine exporter protein LysE/YggA  31.28 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075881  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4520  lysine exporter protein LysE/YggA  35.38 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5436  lysine exporter protein LysE/YggA  31.98 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0088  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2108  lysine exporter protein LysE/YggA  31.4 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.451447 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  31.75 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2405  lysine exporter protein LysE/YggA  31.63 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2870  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.11 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.75176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4180  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.95 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1265  lysine exporter protein LysE/YggA  32.69 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3097  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.67 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000000179524  hitchhiker  0.00000160159 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  32.37 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3625  amino acid transporter LysE  30.43 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.277347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6008  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.6 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.435355 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4659  lysine exporter protein LysE/YggA  31.12 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.80151  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0367  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3704  lysine exporter protein LysE/YggA  31.12 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.326067  normal  0.173855 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2107  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.314049 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  29.47 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.05 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  28.28 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3909  lysine exporter protein LysE/YggA  30.3 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.806528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6476  lysine exporter protein LysE/YggA  32.68 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.772782 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4465  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.99 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1483  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0349  lysine exporter protein LysE/YggA  34.63 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1744  lysine exporter protein LysE/YggA  26.87 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0257251  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5030  lysine exporter protein LysE/YggA  31.12 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778866  normal  0.678911 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.68 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0092  lysine exporter protein LysE/YggA  31.34 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4164  RhtB family transporter  37.06 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29500  putative threonine efflux protein  29.65 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.585854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6040  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.69 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  30.61 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0893485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0037  lysine exporter protein LysE/YggA  31.88 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1238  lysine exporter protein LysE/YggA  35.21 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0801686  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2925  amino acid transporter LysE  27.64 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0920317  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0412  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.2 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>