More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3097 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3097  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 		 206 aa  387  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000000179524  hitchhiker  0.00000160159 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1177  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.43 
 
 		 204 aa  128  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19390  putative threonine efflux protein  42.79 
 
 		 205 aa  104  9e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.018608  normal  0.131617 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.38 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2786  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.13 
 
 		 206 aa  97.8  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  37.26 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  36.59 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  36.59 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.78 
 
 		 208 aa  95.9  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  36.32 
 
 		 210 aa  94  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  35.85 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0836  lysine exporter protein LysE/YggA  37.42 
 
 		 207 aa  93.2  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003627  putative threonine efflux protein  33.51 
 
 		 231 aa  92.4  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4824  lysine exporter protein LysE/YggA  35.06 
 
 		 210 aa  92.4  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.322328  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  36.32 
 
 		 210 aa  92  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0867  lysine exporter protein LysE/YggA  37.42 
 
 		 207 aa  91.3  9e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.627781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4264  lysine exporter protein LysE/YggA  34.3 
 
 		 210 aa  91.3  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269909  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02483  hypothetical protein  32.54 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4133  lysine exporter protein LysE/YggA  34.3 
 
 		 210 aa  91.3  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02476  hypothetical protein  33.85 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2300  lysine exporter protein LysE/YggA  34.97 
 
 		 208 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.735083  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2073  lysine exporter protein LysE/YggA  34.97 
 
 		 208 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106619  normal  0.299626 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2313  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.97 
 
 		 208 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00564099  hitchhiker  0.00590082 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3105  lysine exporter protein LysE/YggA  37.42 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1798  amino acid transport protein, LysE type  29.69 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2025  lysine exporter protein LysE/YggA  34.97 
 
 		 208 aa  89  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.464731  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  33.5 
 
 		 211 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  33.5 
 
 		 211 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1467  lysine exporter protein LysE/YggA  33.82 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  33.5 
 
 		 211 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  33.5 
 
 		 211 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1611  lysine exporter protein LysE/YggA  30.46 
 
 		 207 aa  86.7  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0311017  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0024  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.82 
 
 		 208 aa  86.3  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1363  LysE family translocator protein  33.72 
 
 		 213 aa  86.3  3e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.640513  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1147  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.51 
 
 		 208 aa  86.3  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4180  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.53 
 
 		 207 aa  86.7  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  32.99 
 
 		 211 aa  85.1  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1333  lysine exporter protein LysE/YggA  33.84 
 
 		 212 aa  85.5  6e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.99 
 
 		 211 aa  85.1  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  32.99 
 
 		 211 aa  85.1  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4465  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.61 
 
 		 207 aa  84.7  8e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.26 
 
 		 208 aa  84.7  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  36.08 
 
 		 206 aa  84.7  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  38.34 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5273  lysine exporter protein LysE/YggA  32.54 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2459  lysine exporter protein LysE/YggA  27.91 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.593208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4686  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.96 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0823  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.66 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000549104  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0577  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.5 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4996  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.53634 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1031  hypothetical protein  32.32 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.332162  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4164  RhtB family transporter  35.48 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6503  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2255  lysine exporter protein LysE/YggA  31.22 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674089 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  38.1 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  34.69 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  34.71 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  26.96 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0043  lysine exporter protein LysE/YggA  32.58 
 
 		 210 aa  81.3  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.822659  normal  0.173523 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003307  putative threonine efflux protein  33.33 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2078  lysine exporter protein LysE/YggA  31.5 
 
 		 213 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2589  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.51 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  35.48 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3652  amino acid transporter LysE  30.73 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0913574 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  29.9 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888062 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0038  lysine exporter protein LysE/YggA  31.31 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4659  lysine exporter protein LysE/YggA  34.18 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.80151  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.12 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3704  lysine exporter protein LysE/YggA  34.18 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.326067  normal  0.173855 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6435  lysine exporter protein LysE/YggA  33.96 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5030  lysine exporter protein LysE/YggA  33.67 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778866  normal  0.678911 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0914  amino acid efflux protein, putative  37.76 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2572  hypothetical protein  28.71 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4402  lysine exporter protein LysE/YggA  32.38 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.649358  normal  0.816137 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.51 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0029  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.92 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0905  hypothetical protein  33.13 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.772442  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2381  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.1 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000868866  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2465  lysine exporter protein LysE/YggA  34.95 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.19798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14510  putative threonine efflux protein  34.78 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.93793  normal  0.0749541 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2500  lysine exporter protein LysE/YggA  32.99 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106725  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3921  lysine exporter protein LysE/YggA  33.01 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2432  RhtB family transporter  31.4 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.274649  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  24.75 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0349  lysine exporter protein LysE/YggA  34.33 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  24.75 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2043  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.9 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000125036  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4075  LysE family efflux protein  33.18 
 
 		 221 aa  78.6  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1350  amino acid efflux pump, RhtB family protein  33.54 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641415  normal  0.0201928 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.51 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1558  hypothetical protein  38.41 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  24.75 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  24.75 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  24.75 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5819  lysine exporter protein LysE/YggA  33.01 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  24.24 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3003  putative homoserine/threonine efflux protein  23.74 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4405  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.8 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0814  hypothetical protein  32.04 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.31 
 
 		 209 aa  77.8  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>