More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0048 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0048  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 208 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075881  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1739  lysine exporter protein LysE/YggA  50.98 
 
 		 208 aa  209  3e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0365796  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  53.27 
 
 		 211 aa  208  5e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  51.43 
 
 		 211 aa  207  7e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  51.42 
 
 		 212 aa  206  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2789  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  57.08 
 
 		 213 aa  205  3e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.376522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  50.95 
 
 		 211 aa  204  8e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  52.13 
 
 		 211 aa  201  6e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3121  amino acid transporter LysE  48 
 
 		 218 aa  201  9e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201026  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  50.23 
 
 		 213 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  53.08 
 
 		 211 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  50.95 
 
 		 211 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00531331  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0308  lysine exporter protein LysE/YggA  50.95 
 
 		 211 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000182648  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3861  LysE family translocator protein  48.21 
 
 		 222 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0165555  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3800  LysE family translocator protein  48.21 
 
 		 222 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00135005  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0029  amino acid transporter LysE  47.77 
 
 		 222 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0393564  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0679  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  48.04 
 
 		 207 aa  186  3e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000948495 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2876  lysine exporter protein LysE/YggA  44.04 
 
 		 218 aa  181  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000054165  unclonable  0.00000000000000325534 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3909  lysine exporter protein LysE/YggA  46.63 
 
 		 210 aa  174  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.806528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  38.42 
 
 		 207 aa  141  5e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  39.61 
 
 		 208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.25 
 
 		 208 aa  134  7.000000000000001e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.27 
 
 		 208 aa  131  6.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.71 
 
 		 208 aa  129  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4452  lysine exporter protein LysE/YggA  36.71 
 
 		 205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000383536 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0119  lysine exporter protein LysE/YggA  36.76 
 
 		 207 aa  125  7e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  35.53 
 
 		 207 aa  124  7e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934187 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0092  lysine exporter protein LysE/YggA  35.44 
 
 		 211 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  35.53 
 
 		 207 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.161757 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0122  amino acid transporter LysE  36.04 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6011  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.71 
 
 		 206 aa  123  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.513568 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4701  lysine exporter protein LysE/YggA  37.68 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0229835 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0113  lysine exporter protein LysE/YggA  35.53 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.894147 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4402  lysine exporter protein LysE/YggA  35.71 
 
 		 212 aa  122  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.649358  normal  0.816137 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0123  lysine exporter protein LysE/YggA  34.8 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  34.8 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0122  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.8 
 
 		 207 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4236  lysine exporter protein LysE/YggA  34.31 
 
 		 207 aa  118  6e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  34.93 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2246  amino acid efflux pump, RhtB family protein  36.82 
 
 		 222 aa  116  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.747875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4795  lysine exporter protein LysE/YggA  38.28 
 
 		 206 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1166  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 		 211 aa  115  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  34.29 
 
 		 212 aa  114  7.999999999999999e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3751  lysine exporter protein LysE/YggA  35.78 
 
 		 207 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540648 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3381  lysine exporter protein LysE/YggA  36.54 
 
 		 209 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.599576  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4986  lysine exporter protein LysE/YggA  36.54 
 
 		 209 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0538724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1710  lysine exporter protein LysE/YggA  40.41 
 
 		 209 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0974274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1876  lysine exporter protein LysE/YggA  33.83 
 
 		 224 aa  111  7.000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5301  lysine exporter protein LysE/YggA  36.54 
 
 		 209 aa  111  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0303  lysine exporter protein LysE/YggA  35.47 
 
 		 205 aa  111  9e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.85144e-16  normal  0.0852573 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  34.03 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.74 
 
 		 209 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  36.08 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888062 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3565  amino acid transporter LysE  35.92 
 
 		 203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0692  lysine exporter protein LysE/YggA  36.23 
 
 		 209 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  30.43 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000194499  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2209  lysine exporter protein LysE/YggA  36.71 
 
 		 203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.34 
 
 		 212 aa  108  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4576  lysine exporter protein LysE/YggA  39.9 
 
 		 203 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5476  lysine exporter protein LysE/YggA  34.85 
 
 		 210 aa  108  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1265  lysine exporter protein LysE/YggA  37.32 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2356  lysine exporter protein LysE/YggA  35.44 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  36.32 
 
 		 209 aa  106  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3206  lysine exporter protein LysE/YggA  37.31 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.84476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2444  lysine exporter protein LysE/YggA  31.53 
 
 		 205 aa  106  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4318  lysine exporter protein LysE/YggA  35.82 
 
 		 203 aa  106  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0592644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0815  lysine exporter protein LysE/YggA  34.48 
 
 		 204 aa  106  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4157  lysine exporter protein LysE/YggA  35.44 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  38.05 
 
 		 211 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2480  lysine exporter protein LysE/YggA  36.41 
 
 		 203 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1528  hypothetical protein  32.99 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2108  lysine exporter protein LysE/YggA  35.57 
 
 		 213 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.451447 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3003  putative homoserine/threonine efflux protein  32.35 
 
 		 210 aa  105  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1767  homoserine/homoserine lactone efflux pump  32.92 
 
 		 249 aa  105  5e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3501  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.98 
 
 		 207 aa  105  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648819  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2944  lysine exporter protein LysE/YggA  31.34 
 
 		 203 aa  105  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  31.37 
 
 		 210 aa  105  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0891  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.29 
 
 		 209 aa  104  7e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4441  lysine exporter protein (LysE/YggA)  35.53 
 
 		 208 aa  105  7e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.568773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  31.37 
 
 		 210 aa  105  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  37.98 
 
 		 211 aa  104  8e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  37.98 
 
 		 211 aa  104  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  37.98 
 
 		 211 aa  104  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  37.98 
 
 		 211 aa  104  8e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05364  putative threonine efflux protein  33.33 
 
 		 206 aa  104  8e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0266  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 210 aa  104  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  37.98 
 
 		 211 aa  104  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  37.98 
 
 		 211 aa  104  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3625  amino acid transporter LysE  35.05 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.277347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  30.88 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  30.88 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4345  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.43 
 
 		 206 aa  103  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.44 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4165  amino acid transporter LysE  33.5 
 
 		 203 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3922  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.325521  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0286  lysine exporter protein LysE/YggA  35 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3276  lysine exporter protein LysE/YggA  34.87 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.667965  normal  0.54958 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1078  lysine exporter protein LysE/YggA  31.84 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  30.88 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2048  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.675394 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>