More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1876 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1876  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 224 aa  442  1e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1767  homoserine/homoserine lactone efflux pump  59.67 
 
 		 249 aa  257  1e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2048  lysine exporter protein LysE/YggA  60.91 
 
 		 249 aa  254  8e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.675394 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  35.89 
 
 		 213 aa  135  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3909  lysine exporter protein LysE/YggA  37.5 
 
 		 210 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.806528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  35.89 
 
 		 212 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3800  LysE family translocator protein  37.26 
 
 		 222 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00135005  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3861  LysE family translocator protein  37.26 
 
 		 222 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0165555  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0029  amino acid transporter LysE  37.38 
 
 		 222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0393564  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  36.57 
 
 		 211 aa  126  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  34.93 
 
 		 211 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  35.89 
 
 		 211 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  35.41 
 
 		 211 aa  124  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.45 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3121  amino acid transporter LysE  36.15 
 
 		 218 aa  123  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201026  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2876  lysine exporter protein LysE/YggA  32.54 
 
 		 218 aa  122  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000054165  unclonable  0.00000000000000325534 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  33.01 
 
 		 211 aa  119  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  35.41 
 
 		 211 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00531331  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0308  lysine exporter protein LysE/YggA  35.41 
 
 		 211 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000182648  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0048  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075881  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4402  lysine exporter protein LysE/YggA  37.04 
 
 		 212 aa  112  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.649358  normal  0.816137 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1739  lysine exporter protein LysE/YggA  33.83 
 
 		 208 aa  112  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0365796  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  34.55 
 
 		 208 aa  112  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2183  lysine exporter protein LysE/YggA  34.74 
 
 		 206 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.358199 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4576  lysine exporter protein LysE/YggA  34.42 
 
 		 203 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1931  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0747907 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05364  putative threonine efflux protein  35.1 
 
 		 206 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2688  lysine exporter protein (LysE/YggA)  31.25 
 
 		 205 aa  106  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.666763 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.37 
 
 		 212 aa  106  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0679  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.8 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000948495 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2356  lysine exporter protein LysE/YggA  32.09 
 
 		 203 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.94 
 
 		 208 aa  103  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2209  lysine exporter protein LysE/YggA  31.63 
 
 		 203 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4165  amino acid transporter LysE  31.94 
 
 		 203 aa  101  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2246  amino acid efflux pump, RhtB family protein  32.68 
 
 		 222 aa  102  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.747875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2480  lysine exporter protein LysE/YggA  31.16 
 
 		 203 aa  101  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.8 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3565  amino acid transporter LysE  31.16 
 
 		 203 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.58 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2164  lysine exporter protein LysE/YggA  30.7 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6011  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.71 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.513568 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.06 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4719  amino acid transporter LysE  30.95 
 
 		 205 aa  99.8  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1669  lysine exporter protein LysE/YggA  31.88 
 
 		 207 aa  99.8  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2295  lysine exporter protein LysE/YggA  32.37 
 
 		 207 aa  99.8  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.536806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2367  lysine exporter protein LysE/YggA  32.37 
 
 		 207 aa  99.8  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.01403  normal  0.272564 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2328  lysine exporter protein LysE/YggA  32.54 
 
 		 205 aa  99.8  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.49697  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0287  lysine exporter protein LysE/YggA  30.88 
 
 		 214 aa  99.4  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167258  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.72 
 
 		 208 aa  99.4  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4701  lysine exporter protein LysE/YggA  31.71 
 
 		 207 aa  99.4  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0229835 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2485  lysine exporter protein LysE/YggA  32.37 
 
 		 207 aa  99.4  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.74737 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  31.63 
 
 		 212 aa  99.4  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2618  lysine exporter protein LysE/YggA  31.88 
 
 		 229 aa  99  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0122  amino acid transporter LysE  30.09 
 
 		 207 aa  98.6  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  32.66 
 
 		 213 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1729  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.88 
 
 		 207 aa  99  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.339884  hitchhiker  0.00812067 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2731  lysine exporter protein LysE/YggA  31.88 
 
 		 229 aa  98.6  6e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.979652  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0815  lysine exporter protein LysE/YggA  32.56 
 
 		 204 aa  98.6  7e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2656  lysine exporter protein LysE/YggA  31.4 
 
 		 207 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0662609  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1954  amino acid transporter LysE  31.88 
 
 		 207 aa  98.2  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2660  lysine exporter protein LysE/YggA  27.19 
 
 		 217 aa  96.7  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0329872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  29.17 
 
 		 207 aa  97.4  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.161757 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0403  lysine exporter protein LysE/YggA  33.01 
 
 		 211 aa  95.9  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  29.17 
 
 		 207 aa  95.9  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934187 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.94 
 
 		 208 aa  95.5  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1528  hypothetical protein  32.68 
 
 		 206 aa  95.5  6e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  32 
 
 		 213 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888062 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0303  lysine exporter protein LysE/YggA  31.05 
 
 		 205 aa  95.1  9e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.85144e-16  normal  0.0852573 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4441  lysine exporter protein (LysE/YggA)  29.09 
 
 		 208 aa  94.7  9e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.568773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0113  lysine exporter protein LysE/YggA  28.44 
 
 		 207 aa  94.7  9e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.894147 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3276  lysine exporter protein LysE/YggA  30.62 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.667965  normal  0.54958 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5023  lysine exporter protein LysE/YggA  32.2 
 
 		 210 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.904579 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2789  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.94 
 
 		 213 aa  93.6  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.376522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  29.22 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3625  amino acid transporter LysE  33 
 
 		 213 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.277347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2289  lysine exporter protein LysE/YggA  29.72 
 
 		 204 aa  91.7  8e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0119  lysine exporter protein LysE/YggA  31.22 
 
 		 207 aa  91.7  8e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1265  lysine exporter protein LysE/YggA  31.28 
 
 		 208 aa  91.7  9e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3501  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.62 
 
 		 207 aa  91.3  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648819  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3972  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.95 
 
 		 206 aa  91.3  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.422052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0122  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.77 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0123  lysine exporter protein LysE/YggA  28.77 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2992  lysine exporter protein LysE/YggA  29.41 
 
 		 207 aa  91.3  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3381  lysine exporter protein LysE/YggA  29.67 
 
 		 209 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.599576  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2108  lysine exporter protein LysE/YggA  32 
 
 		 213 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.451447 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4236  lysine exporter protein LysE/YggA  28.77 
 
 		 207 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  35.14 
 
 		 207 aa  90.5  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.957378  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4986  lysine exporter protein LysE/YggA  29.67 
 
 		 209 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0538724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4191  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.03 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349541 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4577  lysine exporter protein LysE/YggA  30.23 
 
 		 215 aa  89.7  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.499948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3290  lysine exporter protein LysE/YggA  30.7 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76234  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000521  putative threonine efflux protein  32.97 
 
 		 183 aa  89.4  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1567  amino acid transporter LysE  34 
 
 		 206 aa  89.7  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4345  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.49 
 
 		 206 aa  89  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  35.4 
 
 		 208 aa  89  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03703  neutral amino-acid efflux system  29.03 
 
 		 206 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4155  homoserine/threonine efflux pump  29.03 
 
 		 206 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2156  lysine exporter protein LysE/YggA  31.43 
 
 		 205 aa  89  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.823885 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4048  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.03 
 
 		 206 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4184  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.03 
 
 		 206 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.340963 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>