More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2688 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2688  lysine exporter protein (LysE/YggA)  100 
 
 		 205 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.666763 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1931  lysine exporter protein LysE/YggA  87.8 
 
 		 205 aa  373  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0747907 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2367  lysine exporter protein LysE/YggA  77.67 
 
 		 207 aa  333  9e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.01403  normal  0.272564 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2295  lysine exporter protein LysE/YggA  77.67 
 
 		 207 aa  333  1e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.536806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2731  lysine exporter protein LysE/YggA  77.18 
 
 		 229 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.979652  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1954  amino acid transporter LysE  76.21 
 
 		 207 aa  332  3e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1729  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  76.7 
 
 		 207 aa  332  3e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.339884  hitchhiker  0.00812067 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2485  lysine exporter protein LysE/YggA  77.67 
 
 		 207 aa  332  3e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.74737 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2656  lysine exporter protein LysE/YggA  76.7 
 
 		 207 aa  331  4e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0662609  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2618  lysine exporter protein LysE/YggA  76.7 
 
 		 229 aa  331  5e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1669  lysine exporter protein LysE/YggA  75.73 
 
 		 207 aa  327  6e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4719  amino acid transporter LysE  75.49 
 
 		 205 aa  327  8e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2164  lysine exporter protein LysE/YggA  71.56 
 
 		 225 aa  324  5e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2328  lysine exporter protein LysE/YggA  77.56 
 
 		 205 aa  324  6e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.49697  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2156  lysine exporter protein LysE/YggA  80.49 
 
 		 205 aa  311  2.9999999999999996e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.823885 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1869  lysine exporter protein LysE/YggA  79.13 
 
 		 206 aa  307  5.9999999999999995e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.051717  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2289  lysine exporter protein LysE/YggA  69.95 
 
 		 204 aa  291  4e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05364  putative threonine efflux protein  64.85 
 
 		 206 aa  264  5.999999999999999e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1567  amino acid transporter LysE  66.83 
 
 		 206 aa  261  4.999999999999999e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3276  lysine exporter protein LysE/YggA  60.49 
 
 		 206 aa  259  2e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.667965  normal  0.54958 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2183  lysine exporter protein LysE/YggA  57.84 
 
 		 206 aa  248  4e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.358199 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1537  lysine exporter protein LysE/YggA  58.94 
 
 		 207 aa  241  3.9999999999999997e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.798481  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1528  hypothetical protein  59.9 
 
 		 206 aa  241  7e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000521  putative threonine efflux protein  64.29 
 
 		 183 aa  232  3e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0883  amino acid transport protein, LysE type  61.95 
 
 		 206 aa  232  3e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.325897  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1266  homogentisate export protein  33.33 
 
 		 198 aa  125  4.0000000000000003e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.733193  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1023  LysE family translocator protein  32.47 
 
 		 204 aa  119  3e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000160759  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1022  homogentisate export protein  34.73 
 
 		 199 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000262161  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0032  LysE family translocator protein  34.97 
 
 		 199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.787498  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2356  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 203 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  34.33 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3565  amino acid transporter LysE  32.8 
 
 		 203 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0918  lysine exporter protein LysE/YggA  29.7 
 
 		 209 aa  105  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1363  LysE family translocator protein  27.84 
 
 		 195 aa  105  7e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00372502  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2512  LysE family efflux protein  31.12 
 
 		 209 aa  103  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.77155  normal  0.629376 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  33.83 
 
 		 211 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  32.84 
 
 		 211 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00531331  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0308  lysine exporter protein LysE/YggA  32.84 
 
 		 211 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000182648  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1876  lysine exporter protein LysE/YggA  32.63 
 
 		 224 aa  102  4e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  33.83 
 
 		 211 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0287  lysine exporter protein LysE/YggA  30.32 
 
 		 214 aa  101  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167258  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4165  amino acid transporter LysE  33.67 
 
 		 203 aa  101  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2209  lysine exporter protein LysE/YggA  31.75 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 		 212 aa  99.4  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0029  amino acid transporter LysE  33.8 
 
 		 222 aa  99  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0393564  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  30.43 
 
 		 213 aa  99  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3800  LysE family translocator protein  33.8 
 
 		 222 aa  99  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00135005  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3861  LysE family translocator protein  33.8 
 
 		 222 aa  99  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0165555  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3121  amino acid transporter LysE  34.11 
 
 		 218 aa  99  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201026  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0236  lysine exporter protein LysE/YggA  29.79 
 
 		 214 aa  99  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3462  lysine exporter protein LysE/YggA  29.06 
 
 		 209 aa  99  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2480  lysine exporter protein LysE/YggA  32.8 
 
 		 203 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0048  lysine exporter protein LysE/YggA  31.79 
 
 		 208 aa  98.6  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075881  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1767  homoserine/homoserine lactone efflux pump  31.56 
 
 		 249 aa  97.4  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3909  lysine exporter protein LysE/YggA  30.93 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.806528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0679  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.63 
 
 		 207 aa  96.3  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000948495 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2876  lysine exporter protein LysE/YggA  31.25 
 
 		 218 aa  95.9  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000054165  unclonable  0.00000000000000325534 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5023  lysine exporter protein LysE/YggA  31.67 
 
 		 210 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.904579 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0403  lysine exporter protein LysE/YggA  30.94 
 
 		 211 aa  95.5  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  32.34 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2048  lysine exporter protein LysE/YggA  31.11 
 
 		 249 aa  94  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.675394 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3117  lysine exporter protein LysE/YggA  31.11 
 
 		 210 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5250  lysine exporter protein LysE/YggA  31.11 
 
 		 210 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4610  lysine exporter protein LysE/YggA  31.11 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4577  lysine exporter protein LysE/YggA  31.88 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.499948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.85 
 
 		 211 aa  92.4  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  29.35 
 
 		 213 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888062 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5994  hypothetical protein  28.34 
 
 		 209 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5514  lysine exporter protein LysE/YggA  33.51 
 
 		 209 aa  89.4  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2660  lysine exporter protein LysE/YggA  31.22 
 
 		 217 aa  89.4  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0329872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1667  lysine exporter protein LysE/YggA  27.87 
 
 		 209 aa  89  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.931902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  27.23 
 
 		 209 aa  89  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000194499  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2770  lysine exporter protein LysE/YggA  34.44 
 
 		 233 aa  88.6  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  30.32 
 
 		 211 aa  88.2  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.13 
 
 		 213 aa  87.8  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.66 
 
 		 213 aa  87.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1739  lysine exporter protein LysE/YggA  29.53 
 
 		 208 aa  87.4  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0365796  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  24.88 
 
 		 205 aa  85.9  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4795  lysine exporter protein LysE/YggA  27.98 
 
 		 206 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0891  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.4 
 
 		 209 aa  86.3  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1470  lysine exporter protein LysE/YggA  29.79 
 
 		 207 aa  85.9  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2393  lysine exporter protein LysE/YggA  31.25 
 
 		 210 aa  85.5  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3290  lysine exporter protein LysE/YggA  29.02 
 
 		 206 aa  85.5  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76234  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4576  lysine exporter protein LysE/YggA  30.85 
 
 		 203 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69310  LysE family efflux protein  27.27 
 
 		 209 aa  84.7  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1489  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.41 
 
 		 230 aa  85.1  7e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0266  lysine exporter protein LysE/YggA  26.9 
 
 		 210 aa  84.7  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4452  lysine exporter protein LysE/YggA  26.5 
 
 		 205 aa  84.7  9e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000383536 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5476  lysine exporter protein LysE/YggA  29.08 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2902  lysine exporter protein LysE/YggA  29.67 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3915  lysine exporter protein LysE/YggA  30.39 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652927 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6011  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.94 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.513568 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0815  lysine exporter protein LysE/YggA  29.51 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  26.34 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1401  lysine exporter protein LysE/YggA  28.92 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.582865  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000642  transporter LysE family  29.41 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  25.89 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  30.1 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3625  amino acid transporter LysE  29.89 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.277347  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>