More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1489 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1489  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 		 230 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2876  lysine exporter protein LysE/YggA  40.72 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000054165  unclonable  0.00000000000000325534 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  40 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  36.77 
 
 		 207 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  41.63 
 
 		 211 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  40.64 
 
 		 211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  40.18 
 
 		 211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  39.65 
 
 		 212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  40.18 
 
 		 211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3861  LysE family translocator protein  41.82 
 
 		 222 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0165555  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3800  LysE family translocator protein  41.82 
 
 		 222 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00135005  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0029  amino acid transporter LysE  41.82 
 
 		 222 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0393564  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3121  amino acid transporter LysE  42.01 
 
 		 218 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201026  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.82 
 
 		 211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  42.47 
 
 		 211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00531331  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0308  lysine exporter protein LysE/YggA  42.47 
 
 		 211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000182648  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0123  lysine exporter protein LysE/YggA  32.71 
 
 		 207 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37 
 
 		 208 aa  122  5e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0122  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.24 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  32.24 
 
 		 207 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4577  lysine exporter protein LysE/YggA  41.07 
 
 		 215 aa  119  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.499948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4236  lysine exporter protein LysE/YggA  31.78 
 
 		 207 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.91 
 
 		 208 aa  118  7e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  34.08 
 
 		 208 aa  118  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.05 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  31.7 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934187 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0122  amino acid transporter LysE  32.59 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0113  lysine exporter protein LysE/YggA  31.25 
 
 		 207 aa  116  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.894147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  37.1 
 
 		 213 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888062 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  31.25 
 
 		 207 aa  115  6e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.161757 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0119  lysine exporter protein LysE/YggA  31.78 
 
 		 207 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  33.48 
 
 		 213 aa  113  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3501  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.81 
 
 		 207 aa  112  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648819  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4441  lysine exporter protein (LysE/YggA)  35.29 
 
 		 208 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.568773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  36.67 
 
 		 212 aa  108  8.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3751  lysine exporter protein LysE/YggA  33.02 
 
 		 207 aa  108  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540648 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4452  lysine exporter protein LysE/YggA  32.6 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000383536 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4157  lysine exporter protein LysE/YggA  30.45 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3625  amino acid transporter LysE  36.07 
 
 		 213 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.277347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2108  lysine exporter protein LysE/YggA  36.07 
 
 		 213 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.451447 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0891  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.91 
 
 		 209 aa  104  9e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0303  lysine exporter protein LysE/YggA  36.36 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.85144e-16  normal  0.0852573 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5067  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.9 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  34.38 
 
 		 212 aa  102  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3288  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.1 
 
 		 211 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  34.43 
 
 		 209 aa  101  9e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2770  lysine exporter protein LysE/YggA  36.67 
 
 		 233 aa  101  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2721  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.84 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0286436  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0092  lysine exporter protein LysE/YggA  31.02 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2393  lysine exporter protein LysE/YggA  37.56 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.67 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3589  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.68 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0368885 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0287  lysine exporter protein LysE/YggA  33.19 
 
 		 214 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167258  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4402  lysine exporter protein LysE/YggA  35.29 
 
 		 212 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.649358  normal  0.816137 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5514  lysine exporter protein LysE/YggA  35.05 
 
 		 209 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2660  lysine exporter protein LysE/YggA  34.23 
 
 		 217 aa  100  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0329872  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4719  amino acid transporter LysE  31.08 
 
 		 205 aa  99.8  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2944  lysine exporter protein LysE/YggA  30.22 
 
 		 203 aa  99.4  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6011  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.9 
 
 		 206 aa  99  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.513568 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0048  lysine exporter protein LysE/YggA  32.72 
 
 		 208 aa  97.4  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075881  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  33.18 
 
 		 211 aa  97.8  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5023  lysine exporter protein LysE/YggA  39.05 
 
 		 210 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.904579 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3117  lysine exporter protein LysE/YggA  38.57 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5250  lysine exporter protein LysE/YggA  38.57 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1470  lysine exporter protein LysE/YggA  33.49 
 
 		 207 aa  97.4  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4610  lysine exporter protein LysE/YggA  38.1 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3631  amino acid transporter LysE  33.96 
 
 		 207 aa  96.3  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1931  lysine exporter protein LysE/YggA  32.29 
 
 		 205 aa  96.3  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0747907 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1166  lysine exporter protein LysE/YggA  28.26 
 
 		 211 aa  96.3  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0403  lysine exporter protein LysE/YggA  38.1 
 
 		 211 aa  95.9  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1474  hypothetical protein  36.15 
 
 		 207 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.5 
 
 		 204 aa  95.1  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.67 
 
 		 213 aa  95.1  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4833  lysine exporter protein LysE/YggA  30.94 
 
 		 208 aa  95.1  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  30.77 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4701  lysine exporter protein LysE/YggA  32.84 
 
 		 207 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0229835 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1669  lysine exporter protein LysE/YggA  30.63 
 
 		 207 aa  94.7  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.63 
 
 		 209 aa  94.4  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2356  lysine exporter protein LysE/YggA  32.88 
 
 		 203 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2295  lysine exporter protein LysE/YggA  31.53 
 
 		 207 aa  94.4  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.536806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2367  lysine exporter protein LysE/YggA  31.53 
 
 		 207 aa  94.4  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.01403  normal  0.272564 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2731  lysine exporter protein LysE/YggA  31.08 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.979652  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2618  lysine exporter protein LysE/YggA  30.63 
 
 		 229 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06368  putative threonine efflux protein  28.26 
 
 		 207 aa  94  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4795  lysine exporter protein LysE/YggA  32.89 
 
 		 206 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2656  lysine exporter protein LysE/YggA  30.63 
 
 		 207 aa  93.6  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0662609  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2164  lysine exporter protein LysE/YggA  30.53 
 
 		 225 aa  93.6  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1729  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.63 
 
 		 207 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.339884  hitchhiker  0.00812067 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3565  amino acid transporter LysE  32.39 
 
 		 203 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  34.96 
 
 		 215 aa  92.4  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2246  amino acid efflux pump, RhtB family protein  31.19 
 
 		 222 aa  92  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.747875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.51 
 
 		 211 aa  92  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2485  lysine exporter protein LysE/YggA  31.53 
 
 		 207 aa  92  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.74737 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2688  lysine exporter protein (LysE/YggA)  29.86 
 
 		 205 aa  91.7  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.666763 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2870  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.51 
 
 		 211 aa  92  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.75176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  31.42 
 
 		 208 aa  91.7  8e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.272931  normal  0.707068 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2495  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.05 
 
 		 211 aa  91.7  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000331121  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4191  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.4 
 
 		 206 aa  91.7  9e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349541 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4155  homoserine/threonine efflux pump  30.4 
 
 		 206 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1954  amino acid transporter LysE  31.25 
 
 		 207 aa  91.7  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>