More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2289 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2289  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 204 aa  407  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4719  amino acid transporter LysE  68.97 
 
 		 205 aa  293  1e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2485  lysine exporter protein LysE/YggA  70.87 
 
 		 207 aa  291  3e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.74737 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2295  lysine exporter protein LysE/YggA  70.87 
 
 		 207 aa  292  3e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.536806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2367  lysine exporter protein LysE/YggA  70.87 
 
 		 207 aa  291  3e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.01403  normal  0.272564 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2688  lysine exporter protein (LysE/YggA)  69.95 
 
 		 205 aa  291  4e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.666763 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1931  lysine exporter protein LysE/YggA  69.95 
 
 		 205 aa  291  4e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0747907 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2731  lysine exporter protein LysE/YggA  70.39 
 
 		 229 aa  291  4e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.979652  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1669  lysine exporter protein LysE/YggA  69.9 
 
 		 207 aa  291  5e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2618  lysine exporter protein LysE/YggA  69.9 
 
 		 229 aa  290  7e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2656  lysine exporter protein LysE/YggA  69.9 
 
 		 207 aa  290  1e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0662609  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1729  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  69.9 
 
 		 207 aa  289  2e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.339884  hitchhiker  0.00812067 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1954  amino acid transporter LysE  68.78 
 
 		 207 aa  288  4e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2328  lysine exporter protein LysE/YggA  70.1 
 
 		 205 aa  285  5e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.49697  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2164  lysine exporter protein LysE/YggA  64.73 
 
 		 225 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1869  lysine exporter protein LysE/YggA  67.16 
 
 		 206 aa  254  6e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.051717  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2156  lysine exporter protein LysE/YggA  66.5 
 
 		 205 aa  251  7e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.823885 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3276  lysine exporter protein LysE/YggA  60.59 
 
 		 206 aa  250  9.000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.667965  normal  0.54958 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05364  putative threonine efflux protein  58.91 
 
 		 206 aa  239  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1567  amino acid transporter LysE  61.27 
 
 		 206 aa  231  6e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1528  hypothetical protein  59.8 
 
 		 206 aa  227  8e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1537  lysine exporter protein LysE/YggA  57.49 
 
 		 207 aa  222  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.798481  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2183  lysine exporter protein LysE/YggA  51.98 
 
 		 206 aa  214  5e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.358199 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0883  amino acid transport protein, LysE type  56.93 
 
 		 206 aa  211  5.999999999999999e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.325897  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000521  putative threonine efflux protein  57.22 
 
 		 183 aa  207  6e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1266  homogentisate export protein  33.7 
 
 		 198 aa  127  9.000000000000001e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.733193  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1022  homogentisate export protein  35.88 
 
 		 199 aa  115  6e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000262161  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0032  LysE family translocator protein  31.22 
 
 		 199 aa  108  7.000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.787498  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1363  LysE family translocator protein  29.53 
 
 		 195 aa  107  1e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00372502  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1023  LysE family translocator protein  28.79 
 
 		 204 aa  101  7e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000160759  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  31.88 
 
 		 213 aa  97.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  32.18 
 
 		 211 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00531331  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0308  lysine exporter protein LysE/YggA  32.18 
 
 		 211 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000182648  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  31.68 
 
 		 211 aa  92.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1667  lysine exporter protein LysE/YggA  32.29 
 
 		 209 aa  90.5  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.931902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  28.11 
 
 		 213 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2660  lysine exporter protein LysE/YggA  32.82 
 
 		 217 aa  90.5  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0329872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  32.18 
 
 		 211 aa  90.5  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0287  lysine exporter protein LysE/YggA  32.82 
 
 		 214 aa  89  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167258  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  31.53 
 
 		 212 aa  89  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.9 
 
 		 208 aa  88.2  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1876  lysine exporter protein LysE/YggA  30.3 
 
 		 224 aa  87.8  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.02 
 
 		 211 aa  87.4  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  30.69 
 
 		 211 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3633  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.27 
 
 		 207 aa  86.7  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4577  lysine exporter protein LysE/YggA  31.75 
 
 		 215 aa  86.7  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.499948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  30.69 
 
 		 211 aa  86.7  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  27.59 
 
 		 207 aa  85.9  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0123  lysine exporter protein LysE/YggA  27.66 
 
 		 207 aa  85.5  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3861  LysE family translocator protein  29.91 
 
 		 222 aa  85.5  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0165555  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3800  LysE family translocator protein  29.91 
 
 		 222 aa  85.5  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00135005  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4795  lysine exporter protein LysE/YggA  29.69 
 
 		 206 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0236  lysine exporter protein LysE/YggA  29.38 
 
 		 214 aa  85.1  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2356  lysine exporter protein LysE/YggA  33.7 
 
 		 203 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0122  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.09 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1489  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.45 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0122  amino acid transporter LysE  27.66 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0029  amino acid transporter LysE  29.44 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0393564  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4236  lysine exporter protein LysE/YggA  27.09 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0048  lysine exporter protein LysE/YggA  29.02 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075881  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2444  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5023  lysine exporter protein LysE/YggA  32.04 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.904579 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3915  lysine exporter protein LysE/YggA  35.11 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652927 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  27.13 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.161757 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2512  LysE family efflux protein  30.46 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.77155  normal  0.629376 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3121  amino acid transporter LysE  30.66 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201026  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.77 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3565  amino acid transporter LysE  32.07 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2876  lysine exporter protein LysE/YggA  27.75 
 
 		 218 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000054165  unclonable  0.00000000000000325534 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0403  lysine exporter protein LysE/YggA  31.87 
 
 		 211 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2878  lysine exporter protein LysE/YggA  29.02 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0119  lysine exporter protein LysE/YggA  26.9 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3117  lysine exporter protein LysE/YggA  32.6 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0113  lysine exporter protein LysE/YggA  26.6 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.894147 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3544  lysine exporter protein LysE/YggA  31.47 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0116705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5250  lysine exporter protein LysE/YggA  32.6 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  26.6 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934187 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2867  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.47 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2209  lysine exporter protein LysE/YggA  32.07 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.9 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1767  homoserine/homoserine lactone efflux pump  27.47 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04744  putative threonine efflux protein  29.1 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  27.46 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1739  lysine exporter protein LysE/YggA  29.02 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0365796  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3206  lysine exporter protein LysE/YggA  29.44 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.84476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  26.24 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000194499  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0891  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.5 
 
 		 209 aa  77.8  0.00000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4610  lysine exporter protein LysE/YggA  31.18 
 
 		 210 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1078  lysine exporter protein LysE/YggA  28.33 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2048  lysine exporter protein LysE/YggA  27.47 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.675394 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0577  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.91 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1323  lysine exporter protein LysE/YggA  25.51 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.848324 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2480  lysine exporter protein LysE/YggA  31.72 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4165  amino acid transporter LysE  31.41 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  29.02 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.957378  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  27.42 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4345  homoserine/homoserine lactone efflux protein  27.98 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2025  lysine exporter protein LysE/YggA  29.61 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.464731  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  24.88 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  25.41 
 
 		 213 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888062 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>