More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1363 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1363  LysE family translocator protein  100 
 
 
195 aa  376  1e-104  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00372502  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0032  LysE family translocator protein  44.85 
 
 
199 aa  173  9.999999999999999e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.787498  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1022  homogentisate export protein  44.02 
 
 
199 aa  151  5e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000262161  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1266  homogentisate export protein  38.34 
 
 
198 aa  141  6e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.733193  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1528  hypothetical protein  35.71 
 
 
206 aa  136  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05364  putative threonine efflux protein  33.17 
 
 
206 aa  125  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3276  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 
206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.667965  normal  0.54958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2295  lysine exporter protein LysE/YggA  31.16 
 
 
207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.536806  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2367  lysine exporter protein LysE/YggA  31.16 
 
 
207 aa  115  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.01403  normal  0.272564 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2731  lysine exporter protein LysE/YggA  31.63 
 
 
229 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.979652  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2485  lysine exporter protein LysE/YggA  31.16 
 
 
207 aa  115  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.74737 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4719  amino acid transporter LysE  30.46 
 
 
205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2656  lysine exporter protein LysE/YggA  31.12 
 
 
207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0662609  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1669  lysine exporter protein LysE/YggA  31.12 
 
 
207 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1954  amino acid transporter LysE  29.85 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2618  lysine exporter protein LysE/YggA  30.61 
 
 
229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000521  putative threonine efflux protein  31.69 
 
 
183 aa  112  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1729  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.1 
 
 
207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.339884  hitchhiker  0.00812067 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2328  lysine exporter protein LysE/YggA  28.35 
 
 
205 aa  112  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.49697  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1567  amino acid transporter LysE  32.99 
 
 
206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0883  amino acid transport protein, LysE type  31.98 
 
 
206 aa  109  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.325897  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1931  lysine exporter protein LysE/YggA  29.38 
 
 
205 aa  107  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0747907 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1537  lysine exporter protein LysE/YggA  33.67 
 
 
207 aa  107  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.798481  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2289  lysine exporter protein LysE/YggA  29.53 
 
 
204 aa  107  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2183  lysine exporter protein LysE/YggA  29.35 
 
 
206 aa  106  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.358199 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2688  lysine exporter protein (LysE/YggA)  27.84 
 
 
205 aa  105  6e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.666763 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2164  lysine exporter protein LysE/YggA  26.17 
 
 
225 aa  99.4  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1869  lysine exporter protein LysE/YggA  29.44 
 
 
206 aa  95.5  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.051717  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2156  lysine exporter protein LysE/YggA  30.93 
 
 
205 aa  93.2  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.823885 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1023  LysE family translocator protein  28.06 
 
 
204 aa  92.8  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000160759  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  33.94 
 
 
211 aa  85.5  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  34.55 
 
 
211 aa  85.9  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  33.55 
 
 
208 aa  84  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
211 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  33.14 
 
 
213 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1876  lysine exporter protein LysE/YggA  32.07 
 
 
224 aa  81.3  0.000000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
211 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00531331  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0308  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
211 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000182648  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  32.34 
 
 
212 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  31.52 
 
 
211 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3290  lysine exporter protein LysE/YggA  32.32 
 
 
206 aa  78.2  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76234  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0815  lysine exporter protein LysE/YggA  36.5 
 
 
204 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.6 
 
 
213 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.6 
 
 
213 aa  75.5  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.62 
 
 
211 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.05 
 
 
205 aa  75.1  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3751  lysine exporter protein LysE/YggA  29.67 
 
 
207 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00540648 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4165  amino acid transporter LysE  37.78 
 
 
203 aa  74.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  33.1 
 
 
205 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.6 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1166  lysine exporter protein LysE/YggA  35.04 
 
 
211 aa  73.9  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2876  lysine exporter protein LysE/YggA  29.71 
 
 
218 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000054165  unclonable  0.00000000000000325534 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00299  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.46 
 
 
204 aa  73.2  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4345  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.11 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03703  neutral amino-acid efflux system  29.11 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4155  homoserine/threonine efflux pump  29.11 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4048  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.11 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3915  lysine exporter protein LysE/YggA  33.12 
 
 
212 aa  72.8  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.652927 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5265  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.11 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.624144 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4184  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.11 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.340963 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03652  hypothetical protein  29.11 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4291  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.11 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.14 
 
 
208 aa  72.8  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3800  LysE family translocator protein  28.64 
 
 
222 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00135005  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3861  LysE family translocator protein  28.64 
 
 
222 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0165555  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4191  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.11 
 
 
206 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349541 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0195  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.62 
 
 
206 aa  72  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0042632  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2660  lysine exporter protein LysE/YggA  30.06 
 
 
217 aa  71.6  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0329872  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3501  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.7 
 
 
207 aa  71.2  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648819  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0029  amino acid transporter LysE  28.64 
 
 
222 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0393564  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0195  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.61 
 
 
206 aa  70.9  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476612  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3121  amino acid transporter LysE  29.23 
 
 
218 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201026  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0891  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.63 
 
 
209 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3544  lysine exporter protein LysE/YggA  29.14 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0116705  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2775  lysine exporter protein LysE/YggA  32 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.7 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2867  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.14 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7111  RhtB family transporter  30 
 
 
215 aa  68.9  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1739  lysine exporter protein LysE/YggA  29.55 
 
 
208 aa  69.3  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0365796  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3909  lysine exporter protein LysE/YggA  33.52 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.806528  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  26.57 
 
 
209 aa  68.9  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2299  lysine exporter protein LysE/YggA  30.71 
 
 
206 aa  68.9  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.691997  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0048  lysine exporter protein LysE/YggA  31.17 
 
 
208 aa  68.6  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075881  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2356  lysine exporter protein LysE/YggA  34.33 
 
 
203 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139066  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2209  lysine exporter protein LysE/YggA  33.58 
 
 
203 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3565  amino acid transporter LysE  34.33 
 
 
203 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4152  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.61 
 
 
206 aa  67.8  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000943916  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.35 
 
 
208 aa  67.4  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0092  lysine exporter protein LysE/YggA  30.6 
 
 
211 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4157  lysine exporter protein LysE/YggA  30.67 
 
 
208 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  30.71 
 
 
211 aa  67.4  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  29.38 
 
 
212 aa  67.4  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1559  LysE family protein  26.74 
 
 
640 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0403  lysine exporter protein LysE/YggA  33.07 
 
 
211 aa  67  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3972  homoserine/homoserine lactone efflux protein  28.48 
 
 
206 aa  66.6  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.422052  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1767  homoserine/homoserine lactone efflux pump  32.04 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5023  lysine exporter protein LysE/YggA  31.25 
 
 
210 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.904579 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0679  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.19 
 
 
207 aa  65.9  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000948495 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  27.13 
 
 
207 aa  66.2  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.957378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>