More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2299 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2299  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
206 aa  408  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.691997  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  34.86 
 
 
211 aa  97.1  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2770  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 
233 aa  90.5  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  27.18 
 
 
213 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1954  amino acid transporter LysE  31.35 
 
 
207 aa  88.2  8e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0048  lysine exporter protein LysE/YggA  27.8 
 
 
208 aa  88.2  8e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075881  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4577  lysine exporter protein LysE/YggA  33.83 
 
 
215 aa  87.8  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.499948  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2944  lysine exporter protein LysE/YggA  28.5 
 
 
203 aa  87.4  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2485  lysine exporter protein LysE/YggA  30.98 
 
 
207 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.74737 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  29.74 
 
 
213 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.888062 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1669  lysine exporter protein LysE/YggA  30.56 
 
 
207 aa  86.7  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2295  lysine exporter protein LysE/YggA  30.98 
 
 
207 aa  86.7  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.536806  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2367  lysine exporter protein LysE/YggA  30.98 
 
 
207 aa  87  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.01403  normal  0.272564 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3625  amino acid transporter LysE  31.12 
 
 
213 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.277347  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2731  lysine exporter protein LysE/YggA  30.94 
 
 
229 aa  84.7  9e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.979652  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0403  lysine exporter protein LysE/YggA  29.32 
 
 
211 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2618  lysine exporter protein LysE/YggA  30.17 
 
 
229 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1729  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.17 
 
 
207 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.339884  hitchhiker  0.00812067 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2656  lysine exporter protein LysE/YggA  30.39 
 
 
207 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0662609  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4719  amino acid transporter LysE  28.18 
 
 
205 aa  84  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2393  lysine exporter protein LysE/YggA  32.45 
 
 
210 aa  83.6  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2328  lysine exporter protein LysE/YggA  30.22 
 
 
205 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.49697  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2108  lysine exporter protein LysE/YggA  30.1 
 
 
213 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.451447 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2688  lysine exporter protein (LysE/YggA)  28.81 
 
 
205 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.666763 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1931  lysine exporter protein LysE/YggA  28.81 
 
 
205 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0747907 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3105  lysine exporter protein LysE/YggA  32.12 
 
 
207 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2289  lysine exporter protein LysE/YggA  31.07 
 
 
204 aa  82  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2043  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.85 
 
 
208 aa  81.6  0.000000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000125036  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2356  lysine exporter protein LysE/YggA  27.78 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139066  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2172  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.38 
 
 
201 aa  80.9  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  28.65 
 
 
205 aa  80.9  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5023  lysine exporter protein LysE/YggA  29.47 
 
 
210 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.904579 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.7 
 
 
212 aa  79.7  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3565  amino acid transporter LysE  27.27 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4452  lysine exporter protein LysE/YggA  27.23 
 
 
205 aa  78.6  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000383536 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0836  lysine exporter protein LysE/YggA  31.18 
 
 
207 aa  79  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0122  amino acid transporter LysE  27.94 
 
 
207 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2164  lysine exporter protein LysE/YggA  28.86 
 
 
225 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0128  lysine exporter protein LysE/YggA  32.1 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2073  lysine exporter protein LysE/YggA  27.86 
 
 
208 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106619  normal  0.299626 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0101  lysine exporter protein LysE/YggA  30.3 
 
 
205 aa  78.2  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.11084  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  28.43 
 
 
207 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.161757 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0113  lysine exporter protein LysE/YggA  28.43 
 
 
207 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.894147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0867  lysine exporter protein LysE/YggA  31.52 
 
 
207 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.627781  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  28.43 
 
 
207 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00934187 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0038  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
211 aa  78.2  0.00000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3117  lysine exporter protein LysE/YggA  29.23 
 
 
210 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4610  lysine exporter protein LysE/YggA  32.21 
 
 
210 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5250  lysine exporter protein LysE/YggA  29.23 
 
 
210 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0287  lysine exporter protein LysE/YggA  28.29 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167258  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00299  homoserine/homoserine lactone efflux protein  28.12 
 
 
204 aa  77.4  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2313  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.23 
 
 
208 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00564099  hitchhiker  0.00590082 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2300  lysine exporter protein LysE/YggA  30.23 
 
 
208 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.735083  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2025  lysine exporter protein LysE/YggA  30.23 
 
 
208 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.464731  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003307  putative threonine efflux protein  31.97 
 
 
208 aa  77.8  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4402  lysine exporter protein LysE/YggA  26.47 
 
 
212 aa  77.4  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.649358  normal  0.816137 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3276  lysine exporter protein LysE/YggA  32.67 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.667965  normal  0.54958 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0905  hypothetical protein  34.27 
 
 
208 aa  77  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.772442  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  28.93 
 
 
210 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2721  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.58 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0286436  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.05 
 
 
209 aa  76.3  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  28.57 
 
 
210 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  28.93 
 
 
210 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02476  hypothetical protein  28.21 
 
 
211 aa  75.9  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2401  lysine exporter protein LysE/YggA  30.17 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00829988 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  28.93 
 
 
210 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2480  lysine exporter protein LysE/YggA  26.77 
 
 
203 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0976  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.17 
 
 
209 aa  75.9  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1790  lysine exporter protein  28.06 
 
 
202 aa  75.9  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.217291  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  28.93 
 
 
210 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  29.41 
 
 
203 aa  75.5  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  28.93 
 
 
210 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0815  lysine exporter protein LysE/YggA  30.16 
 
 
204 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4165  amino acid transporter LysE  27.87 
 
 
203 aa  75.1  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2183  lysine exporter protein LysE/YggA  27.18 
 
 
206 aa  75.5  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.358199 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1701  amino acid transporter LysE  28.57 
 
 
208 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0912104  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2209  lysine exporter protein LysE/YggA  26.77 
 
 
203 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3063  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.19 
 
 
210 aa  75.1  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.03 
 
 
207 aa  74.7  0.0000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.19 
 
 
213 aa  75.1  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.9 
 
 
208 aa  74.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1925  putative homoserine/threonine efflux protein  28.57 
 
 
208 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82308e-38 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0387  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.84 
 
 
203 aa  74.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.45744 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  28.49 
 
 
208 aa  74.7  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.272931  normal  0.707068 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2456  putative homoserine/threonine efflux protein  27.78 
 
 
210 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.506268  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0266  lysine exporter protein LysE/YggA  29.82 
 
 
210 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0092  lysine exporter protein LysE/YggA  27.66 
 
 
211 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2495  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.52 
 
 
211 aa  73.9  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000331121  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0119  lysine exporter protein LysE/YggA  27.05 
 
 
207 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1731  lysine exporter protein LysE/YggA  28.06 
 
 
209 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.820642  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3290  lysine exporter protein LysE/YggA  27.23 
 
 
206 aa  73.2  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76234  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3911  putative amino acid (threonine) efflux protein  33.15 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.856049  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2162  lysine exporter protein LysE/YggA  27.55 
 
 
209 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727412  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1470  lysine exporter protein LysE/YggA  29.7 
 
 
207 aa  73.2  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1752  homoserine/threonine efflux protein  30.27 
 
 
208 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000289008  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7111  RhtB family transporter  29.01 
 
 
215 aa  73.2  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.03 
 
 
208 aa  73.2  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3003  putative homoserine/threonine efflux protein  27.92 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  33.69 
 
 
208 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.19 
 
 
213 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>