More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2721 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_2721  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 
212 aa  409  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0286436  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4577  lysine exporter protein LysE/YggA  76.64 
 
 
215 aa  282  3.0000000000000004e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.499948  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2393  lysine exporter protein LysE/YggA  77.14 
 
 
210 aa  267  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2770  lysine exporter protein LysE/YggA  63.68 
 
 
233 aa  247  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3589  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  64.95 
 
 
211 aa  241  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0368885 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3288  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  65.42 
 
 
211 aa  241  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0403  lysine exporter protein LysE/YggA  62.74 
 
 
211 aa  231  6e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5023  lysine exporter protein LysE/YggA  64.32 
 
 
210 aa  226  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.904579 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3117  lysine exporter protein LysE/YggA  62.26 
 
 
210 aa  225  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5250  lysine exporter protein LysE/YggA  62.26 
 
 
210 aa  225  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4610  lysine exporter protein LysE/YggA  64.15 
 
 
210 aa  219  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5514  lysine exporter protein LysE/YggA  50.94 
 
 
209 aa  191  9e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  45.75 
 
 
212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.01 
 
 
212 aa  161  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  42.99 
 
 
213 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  42.58 
 
 
213 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.888062 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  39.52 
 
 
208 aa  135  6.0000000000000005e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0113  lysine exporter protein LysE/YggA  40.96 
 
 
207 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.894147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  40.96 
 
 
207 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00934187 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  40.43 
 
 
207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.161757 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0122  amino acid transporter LysE  38.5 
 
 
207 aa  129  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0123  lysine exporter protein LysE/YggA  37.56 
 
 
207 aa  128  6e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0122  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.5 
 
 
207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  37.74 
 
 
212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  38.5 
 
 
207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.5 
 
 
213 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4236  lysine exporter protein LysE/YggA  37.97 
 
 
207 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2512  LysE family efflux protein  38.68 
 
 
209 aa  124  9e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.77155  normal  0.629376 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2108  lysine exporter protein LysE/YggA  43.06 
 
 
213 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.451447 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3625  amino acid transporter LysE  42.58 
 
 
213 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.277347  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.03 
 
 
213 aa  121  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0119  lysine exporter protein LysE/YggA  37.5 
 
 
207 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3751  lysine exporter protein LysE/YggA  38.04 
 
 
207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00540648 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.49 
 
 
208 aa  119  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  35.68 
 
 
213 aa  117  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4165  amino acid transporter LysE  37.81 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0891  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.5 
 
 
209 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  38.68 
 
 
211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00531331  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.7 
 
 
211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0308  lysine exporter protein LysE/YggA  38.68 
 
 
211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000182648  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4157  lysine exporter protein LysE/YggA  36.63 
 
 
208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  37.93 
 
 
209 aa  115  5e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  36.28 
 
 
211 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0679  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.7 
 
 
207 aa  114  7.999999999999999e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000948495 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2870  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.89 
 
 
211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.75176  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  36.32 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  38.58 
 
 
211 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.24 
 
 
208 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  38.6 
 
 
208 aa  112  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  35.85 
 
 
212 aa  112  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.24 
 
 
208 aa  112  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3290  lysine exporter protein LysE/YggA  34.58 
 
 
206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76234  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3501  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.14 
 
 
207 aa  112  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648819  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.75 
 
 
206 aa  112  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4441  lysine exporter protein (LysE/YggA)  38.05 
 
 
208 aa  112  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.568773  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  35.38 
 
 
211 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06368  putative threonine efflux protein  35.05 
 
 
207 aa  111  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3121  amino acid transporter LysE  33.03 
 
 
218 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201026  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  35.07 
 
 
211 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.86 
 
 
211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00299  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.84 
 
 
204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3206  lysine exporter protein LysE/YggA  38.21 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.84476  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0287  lysine exporter protein LysE/YggA  40.31 
 
 
214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167258  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1597  lysine exporter protein LysE/YggA  37.44 
 
 
207 aa  109  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.296852 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3462  lysine exporter protein LysE/YggA  35.81 
 
 
209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  34.6 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3861  LysE family translocator protein  33.63 
 
 
222 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0165555  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0195  homoserine/homoserine lactone efflux protein  36.98 
 
 
206 aa  109  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476612  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3800  LysE family translocator protein  33.63 
 
 
222 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00135005  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3565  amino acid transporter LysE  38.78 
 
 
203 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0303  lysine exporter protein LysE/YggA  40.48 
 
 
205 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.85144e-16  normal  0.0852573 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2209  lysine exporter protein LysE/YggA  38.78 
 
 
203 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6784  LysE family amino acid efflux protein  33.5 
 
 
206 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0400664 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0029  amino acid transporter LysE  33.63 
 
 
222 aa  108  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0393564  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1166  lysine exporter protein LysE/YggA  33.64 
 
 
211 aa  108  6e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5067  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.56 
 
 
210 aa  108  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4152  homoserine/homoserine lactone efflux protein  38.85 
 
 
206 aa  107  9.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000943916  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0266  lysine exporter protein LysE/YggA  34.2 
 
 
210 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2944  lysine exporter protein LysE/YggA  32.16 
 
 
203 aa  107  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  32.38 
 
 
205 aa  107  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0092  lysine exporter protein LysE/YggA  38.31 
 
 
211 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0220  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.51 
 
 
206 aa  106  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2356  lysine exporter protein LysE/YggA  37.56 
 
 
203 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139066  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1489  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.87 
 
 
230 aa  105  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2480  lysine exporter protein LysE/YggA  37.24 
 
 
203 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3996  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.51 
 
 
206 aa  105  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.26 
 
 
205 aa  105  6e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0557  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.51 
 
 
206 aa  105  6e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4795  lysine exporter protein LysE/YggA  31.75 
 
 
206 aa  104  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5476  lysine exporter protein LysE/YggA  31.92 
 
 
210 aa  105  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3105  lysine exporter protein LysE/YggA  36.84 
 
 
207 aa  104  8e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0815  lysine exporter protein LysE/YggA  35.89 
 
 
204 aa  103  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4137  lysine exporter protein LysE/YggA  35 
 
 
205 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0577  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.5 
 
 
219 aa  104  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2660  lysine exporter protein LysE/YggA  36.73 
 
 
217 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0329872  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  36.18 
 
 
206 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7453  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.09 
 
 
207 aa  102  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353642  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.44 
 
 
204 aa  102  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3980  lysine exporter protein LysE/YggA  35 
 
 
205 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  32.66 
 
 
209 aa  102  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000194499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>