More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1597 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1597  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
207 aa  401  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.296852 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0741  lysine exporter protein LysE/YggA  48.21 
 
 
209 aa  177  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.664239  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2444  lysine exporter protein LysE/YggA  44.44 
 
 
205 aa  172  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1470  lysine exporter protein LysE/YggA  46.08 
 
 
207 aa  162  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0122  amino acid transporter LysE  38.46 
 
 
207 aa  125  6e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0113  lysine exporter protein LysE/YggA  37.98 
 
 
207 aa  123  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.894147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  37.98 
 
 
207 aa  122  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00934187 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  37.98 
 
 
207 aa  122  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.161757 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4236  lysine exporter protein LysE/YggA  37.02 
 
 
207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  36.23 
 
 
208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  37.02 
 
 
207 aa  115  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0122  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.02 
 
 
207 aa  115  6e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0123  lysine exporter protein LysE/YggA  36.54 
 
 
207 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0119  lysine exporter protein LysE/YggA  37.32 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.14 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  32.68 
 
 
209 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000194499  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4165  amino acid transporter LysE  35.75 
 
 
203 aa  108  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3751  lysine exporter protein LysE/YggA  36.7 
 
 
207 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00540648 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0403  lysine exporter protein LysE/YggA  35.06 
 
 
211 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2480  lysine exporter protein LysE/YggA  36.73 
 
 
203 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.31 
 
 
208 aa  105  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4577  lysine exporter protein LysE/YggA  38.71 
 
 
215 aa  104  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.499948  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4157  lysine exporter protein LysE/YggA  37.02 
 
 
208 aa  103  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5023  lysine exporter protein LysE/YggA  34.68 
 
 
210 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.904579 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.82 
 
 
208 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5250  lysine exporter protein LysE/YggA  34.1 
 
 
210 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3117  lysine exporter protein LysE/YggA  34.1 
 
 
210 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5514  lysine exporter protein LysE/YggA  34.69 
 
 
209 aa  102  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.18 
 
 
207 aa  100  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2721  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.45 
 
 
212 aa  99.4  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0286436  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3288  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.5 
 
 
211 aa  99.4  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  35.75 
 
 
212 aa  99  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0891  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.11 
 
 
209 aa  98.6  6e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3565  amino acid transporter LysE  35.53 
 
 
203 aa  98.2  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2356  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 
203 aa  98.2  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139066  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4610  lysine exporter protein LysE/YggA  35.75 
 
 
210 aa  98.2  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6784  LysE family amino acid efflux protein  34.83 
 
 
206 aa  98.2  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0400664 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7453  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.18 
 
 
207 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353642  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3589  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 
211 aa  95.9  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0368885 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0328  lysine exporter protein LysE/YggA  35.05 
 
 
210 aa  95.5  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.872355  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3290  lysine exporter protein LysE/YggA  33.97 
 
 
206 aa  95.5  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76234  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4576  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
203 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  34.57 
 
 
209 aa  95.1  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00299  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.03 
 
 
204 aa  95.1  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4441  lysine exporter protein (LysE/YggA)  33.65 
 
 
208 aa  95.1  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.568773  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2209  lysine exporter protein LysE/YggA  35.03 
 
 
203 aa  94.7  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.39 
 
 
205 aa  94.4  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2870  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.46 
 
 
211 aa  93.2  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.75176  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  30.54 
 
 
205 aa  92.8  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.46 
 
 
211 aa  92.8  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1476  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 
205 aa  92  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.779186  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2512  LysE family efflux protein  32.52 
 
 
209 aa  92  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.77155  normal  0.629376 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2770  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
233 aa  91.7  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  34.43 
 
 
211 aa  91.7  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  33.68 
 
 
213 aa  91.3  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4191  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.55 
 
 
206 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349541 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  32.28 
 
 
212 aa  90.1  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  34.59 
 
 
211 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00531331  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0308  lysine exporter protein LysE/YggA  34.59 
 
 
211 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000182648  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2082  lysine exporter protein LysE/YggA  36.26 
 
 
205 aa  89  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.295879  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6011  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31 
 
 
206 aa  89  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.513568 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0815  lysine exporter protein LysE/YggA  32.14 
 
 
204 aa  88.6  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2393  lysine exporter protein LysE/YggA  33.51 
 
 
210 aa  88.2  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  35.38 
 
 
211 aa  88.2  8e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  35.38 
 
 
211 aa  88.2  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  35.38 
 
 
211 aa  88.2  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  35.38 
 
 
211 aa  88.2  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.78 
 
 
218 aa  88.2  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.77 
 
 
218 aa  88.2  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.38 
 
 
211 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  35.38 
 
 
211 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0195  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.88 
 
 
206 aa  87.4  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476612  normal  0.152884 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03703  neutral amino-acid efflux system  31.07 
 
 
206 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4155  homoserine/threonine efflux pump  31.07 
 
 
206 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5265  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.07 
 
 
206 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.624144 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0557  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.68 
 
 
206 aa  87  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  34.24 
 
 
211 aa  86.7  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5994  hypothetical protein  34.24 
 
 
209 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0220  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.68 
 
 
206 aa  87  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3996  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.68 
 
 
206 aa  87  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4291  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.07 
 
 
206 aa  86.7  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4240  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.8 
 
 
206 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.119305  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  31.84 
 
 
211 aa  87  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4184  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.07 
 
 
206 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.340963 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.34 
 
 
211 aa  87  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03652  hypothetical protein  31.07 
 
 
206 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4048  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.07 
 
 
206 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32 
 
 
208 aa  86.7  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.01 
 
 
206 aa  86.3  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3121  amino acid transporter LysE  31.63 
 
 
218 aa  86.7  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201026  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4137  lysine exporter protein LysE/YggA  32 
 
 
205 aa  86.3  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3980  lysine exporter protein LysE/YggA  32.5 
 
 
205 aa  86.3  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  32.99 
 
 
207 aa  85.9  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.957378  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3800  LysE family translocator protein  30.69 
 
 
222 aa  85.9  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00135005  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4719  amino acid transporter LysE  32.8 
 
 
205 aa  85.9  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0029  amino acid transporter LysE  30.69 
 
 
222 aa  85.9  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0393564  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3861  LysE family translocator protein  30.69 
 
 
222 aa  85.9  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0165555  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3633  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.44 
 
 
207 aa  85.9  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4347  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.26 
 
 
206 aa  85.9  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.499409  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 
211 aa  85.9  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>