More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0679 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0679  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 		 207 aa  407  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000948495 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0048  lysine exporter protein LysE/YggA  48.04 
 
 		 208 aa  186  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075881  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3909  lysine exporter protein LysE/YggA  50.97 
 
 		 210 aa  173  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.806528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  47.39 
 
 		 211 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  46.01 
 
 		 213 aa  171  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  47.39 
 
 		 211 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  46.92 
 
 		 211 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0029  amino acid transporter LysE  43.5 
 
 		 222 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0393564  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3121  amino acid transporter LysE  44.95 
 
 		 218 aa  170  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201026  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3861  LysE family translocator protein  43.05 
 
 		 222 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0165555  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3800  LysE family translocator protein  43.05 
 
 		 222 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00135005  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  45.58 
 
 		 211 aa  168  7e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00531331  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0308  lysine exporter protein LysE/YggA  45.58 
 
 		 211 aa  168  7e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000182648  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  46.26 
 
 		 212 aa  167  8e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1739  lysine exporter protein LysE/YggA  44.88 
 
 		 208 aa  161  8.000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0365796  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  44.34 
 
 		 211 aa  158  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.18 
 
 		 211 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2876  lysine exporter protein LysE/YggA  40.18 
 
 		 218 aa  151  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000054165  unclonable  0.00000000000000325534 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2789  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.58 
 
 		 213 aa  145  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.376522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.29 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  38.42 
 
 		 208 aa  117  9e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.24 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.95 
 
 		 208 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3288  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.37 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0119  lysine exporter protein LysE/YggA  37.86 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.8 
 
 		 212 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3589  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.89 
 
 		 211 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0368885 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  35.38 
 
 		 207 aa  105  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.161757 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0113  lysine exporter protein LysE/YggA  35.38 
 
 		 207 aa  104  9e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.894147 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0122  amino acid transporter LysE  35.89 
 
 		 207 aa  103  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  35.38 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934187 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0122  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.69 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4452  lysine exporter protein LysE/YggA  34.22 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000383536 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  36.63 
 
 		 207 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0123  lysine exporter protein LysE/YggA  36.63 
 
 		 207 aa  101  7e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0092  lysine exporter protein LysE/YggA  35.78 
 
 		 211 aa  101  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2770  lysine exporter protein LysE/YggA  37.36 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.49 
 
 		 207 aa  99.4  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6011  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.65 
 
 		 206 aa  99.4  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.513568 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4236  lysine exporter protein LysE/YggA  36.14 
 
 		 207 aa  99.4  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4701  lysine exporter protein LysE/YggA  34.29 
 
 		 207 aa  98.6  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0229835 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0403  lysine exporter protein LysE/YggA  36.55 
 
 		 211 aa  99  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3501  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.2 
 
 		 207 aa  98.6  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648819  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4157  lysine exporter protein LysE/YggA  36.27 
 
 		 208 aa  97.8  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0303  lysine exporter protein LysE/YggA  39 
 
 		 205 aa  97.1  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.85144e-16  normal  0.0852573 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1931  lysine exporter protein LysE/YggA  30.61 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0747907 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2688  lysine exporter protein (LysE/YggA)  31.63 
 
 		 205 aa  96.3  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.666763 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2444  lysine exporter protein LysE/YggA  32.49 
 
 		 205 aa  96.3  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2246  amino acid efflux pump, RhtB family protein  35.05 
 
 		 222 aa  95.9  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.747875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5023  lysine exporter protein LysE/YggA  35.98 
 
 		 210 aa  95.5  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.904579 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0100  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.02 
 
 		 234 aa  95.1  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1166  lysine exporter protein LysE/YggA  30.56 
 
 		 211 aa  94.7  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1876  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 224 aa  94.4  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0266  lysine exporter protein LysE/YggA  32.66 
 
 		 210 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3117  lysine exporter protein LysE/YggA  35.2 
 
 		 210 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5250  lysine exporter protein LysE/YggA  35.2 
 
 		 210 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4345  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.82 
 
 		 206 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0050  lysine exporter protein LysE/YggA  35.44 
 
 		 210 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4191  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.82 
 
 		 206 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349541 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2328  lysine exporter protein LysE/YggA  31.63 
 
 		 205 aa  92.8  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.49697  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03703  neutral amino-acid efflux system  31.82 
 
 		 206 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4155  homoserine/threonine efflux pump  31.82 
 
 		 206 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4048  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.82 
 
 		 206 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03652  hypothetical protein  31.82 
 
 		 206 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4291  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.82 
 
 		 206 aa  92.4  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4184  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.82 
 
 		 206 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.340963 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5265  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.82 
 
 		 206 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.624144 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4441  lysine exporter protein (LysE/YggA)  36.87 
 
 		 208 aa  92  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.568773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2367  lysine exporter protein LysE/YggA  33.68 
 
 		 207 aa  92  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.01403  normal  0.272564 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1344  putative threonine efflux protein  31.72 
 
 		 205 aa  91.7  6e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.115554  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5476  lysine exporter protein LysE/YggA  32.16 
 
 		 210 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2295  lysine exporter protein LysE/YggA  33.68 
 
 		 207 aa  91.7  7e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.536806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2209  lysine exporter protein LysE/YggA  34.13 
 
 		 203 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2731  lysine exporter protein LysE/YggA  33.68 
 
 		 229 aa  91.3  8e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.979652  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2485  lysine exporter protein LysE/YggA  33.68 
 
 		 207 aa  91.7  8e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.74737 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3565  amino acid transporter LysE  34.62 
 
 		 203 aa  91.3  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4577  lysine exporter protein LysE/YggA  40.51 
 
 		 215 aa  91.3  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.499948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.82 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0815  lysine exporter protein LysE/YggA  33.66 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  32.86 
 
 		 212 aa  90.5  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2656  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0662609  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.85 
 
 		 204 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0195  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.34 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0042632  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4719  amino acid transporter LysE  30.37 
 
 		 205 aa  90.1  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2618  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3206  lysine exporter protein LysE/YggA  36.53 
 
 		 208 aa  90.1  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.84476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2183  lysine exporter protein LysE/YggA  32.5 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.358199 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1729  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.16 
 
 		 207 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.339884  hitchhiker  0.00812067 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2356  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 203 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3972  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.18 
 
 		 206 aa  89.4  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.422052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0891  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.17 
 
 		 209 aa  89.4  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2721  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.7 
 
 		 212 aa  89.7  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0286436  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1669  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 		 207 aa  89.7  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  32.68 
 
 		 209 aa  89  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1954  amino acid transporter LysE  32.12 
 
 		 207 aa  89.4  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3276  lysine exporter protein LysE/YggA  31.91 
 
 		 206 aa  89  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.667965  normal  0.54958 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5514  lysine exporter protein LysE/YggA  35.16 
 
 		 209 aa  89  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1767  homoserine/homoserine lactone efflux pump  32.92 
 
 		 249 aa  88.6  5e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4610  lysine exporter protein LysE/YggA  35.98 
 
 		 210 aa  89  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1470  lysine exporter protein LysE/YggA  32.65 
 
 		 207 aa  88.6  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>