More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2789 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2789  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 		 213 aa  412  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.376522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0048  lysine exporter protein LysE/YggA  57.08 
 
 		 208 aa  228  5e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075881  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1739  lysine exporter protein LysE/YggA  49.28 
 
 		 208 aa  184  8e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0365796  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2876  lysine exporter protein LysE/YggA  46.08 
 
 		 218 aa  176  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000054165  unclonable  0.00000000000000325534 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  46.92 
 
 		 211 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  45.5 
 
 		 212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  46.45 
 
 		 211 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  46.45 
 
 		 211 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3909  lysine exporter protein LysE/YggA  46.01 
 
 		 210 aa  172  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.806528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  47.42 
 
 		 211 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0679  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.58 
 
 		 207 aa  168  5e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000948495 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.95 
 
 		 211 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  45.79 
 
 		 213 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3121  amino acid transporter LysE  43.78 
 
 		 218 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201026  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3800  LysE family translocator protein  42.53 
 
 		 222 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00135005  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3861  LysE family translocator protein  42.53 
 
 		 222 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0165555  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0029  amino acid transporter LysE  42.99 
 
 		 222 aa  158  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0393564  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  45.5 
 
 		 211 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00531331  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0308  lysine exporter protein LysE/YggA  45.5 
 
 		 211 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000182648  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.78 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3565  amino acid transporter LysE  40.58 
 
 		 203 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4165  amino acid transporter LysE  38.16 
 
 		 203 aa  123  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2209  lysine exporter protein LysE/YggA  40.58 
 
 		 203 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2356  lysine exporter protein LysE/YggA  40.1 
 
 		 203 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4701  lysine exporter protein LysE/YggA  35.07 
 
 		 207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0229835 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.67 
 
 		 206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.83 
 
 		 208 aa  115  5e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0172  lysine exporter protein LysE/YggA  35.53 
 
 		 203 aa  114  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.253668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  35.15 
 
 		 212 aa  114  8.999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4795  lysine exporter protein LysE/YggA  36.49 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4576  lysine exporter protein LysE/YggA  39.61 
 
 		 203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  35.21 
 
 		 211 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2480  lysine exporter protein LysE/YggA  37.2 
 
 		 203 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6011  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.02 
 
 		 206 aa  111  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.513568 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4452  lysine exporter protein LysE/YggA  32.02 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000383536 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  35.85 
 
 		 212 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0092  lysine exporter protein LysE/YggA  35.35 
 
 		 211 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.46 
 
 		 212 aa  109  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0195  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.17 
 
 		 206 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0042632  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  38 
 
 		 208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.17 
 
 		 208 aa  108  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.84 
 
 		 208 aa  107  9.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3206  lysine exporter protein LysE/YggA  36.1 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.84476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4191  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.35 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349541 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0815  lysine exporter protein LysE/YggA  36.5 
 
 		 204 aa  105  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3589  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.59 
 
 		 211 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0368885 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4345  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.85 
 
 		 206 aa  105  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0303  lysine exporter protein LysE/YggA  37.62 
 
 		 205 aa  104  9e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.85144e-16  normal  0.0852573 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03703  neutral amino-acid efflux system  29.85 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4155  homoserine/threonine efflux pump  29.85 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4291  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.85 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3922  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.18 
 
 		 204 aa  103  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.325521  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4048  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.85 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5265  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.85 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.624144 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3972  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.96 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.422052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4184  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.85 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.340963 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03652  hypothetical protein  29.85 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3288  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.09 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.62 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0195  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.97 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476612  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.34 
 
 		 208 aa  102  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 		 213 aa  102  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.07 
 
 		 218 aa  102  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.63 
 
 		 209 aa  101  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2944  lysine exporter protein LysE/YggA  29.27 
 
 		 203 aa  101  9e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29500  putative threonine efflux protein  34.3 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.585854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  31.75 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.161757 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0113  lysine exporter protein LysE/YggA  32.23 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.894147 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  30.95 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4247  putative homoserine/threonine efflux protein  26.83 
 
 		 208 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000239469 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1730  amino acid transporter LysE  27.75 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000126843  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1701  amino acid transporter LysE  27.8 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0912104  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4152  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.87 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000943916  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2246  amino acid efflux pump, RhtB family protein  35.12 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.747875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  33.81 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2162  lysine exporter protein LysE/YggA  27.8 
 
 		 209 aa  99.8  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727412  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  32.38 
 
 		 204 aa  99.8  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.69 
 
 		 213 aa  99.8  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1078  lysine exporter protein LysE/YggA  28.36 
 
 		 204 aa  99.8  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  31.75 
 
 		 207 aa  99.8  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934187 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7098  RhtB family transporter  31.63 
 
 		 199 aa  99  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3996  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.32 
 
 		 206 aa  99  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0286  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 		 211 aa  99  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0557  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.32 
 
 		 206 aa  99  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3063  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.29 
 
 		 210 aa  99  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1925  putative homoserine/threonine efflux protein  27.8 
 
 		 208 aa  99  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82308e-38 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0122  amino acid transporter LysE  31.28 
 
 		 207 aa  98.6  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  31.9 
 
 		 204 aa  98.6  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2456  putative homoserine/threonine efflux protein  28.29 
 
 		 210 aa  98.2  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.506268  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.59 
 
 		 218 aa  98.2  8e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1998  amino acid efflux pump, RhtB family protein  37.31 
 
 		 213 aa  98.2  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457454  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1790  lysine exporter protein  33.83 
 
 		 202 aa  98.2  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.217291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3381  lysine exporter protein LysE/YggA  33.02 
 
 		 209 aa  98.2  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.599576  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.85 
 
 		 205 aa  97.8  9e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4986  lysine exporter protein LysE/YggA  33.02 
 
 		 209 aa  98.2  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0538724  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  35.75 
 
 		 211 aa  97.8  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3385  lysine exporter protein LysE/YggA  31.9 
 
 		 214 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201071 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  35.75 
 
 		 211 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0119  lysine exporter protein LysE/YggA  32.52 
 
 		 207 aa  97.8  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  35.75 
 
 		 211 aa  97.8  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>