More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2164 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2164  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 225 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2328  lysine exporter protein LysE/YggA  79.11 
 
 		 205 aa  348  6e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.49697  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4719  amino acid transporter LysE  72.77 
 
 		 205 aa  329  2e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1931  lysine exporter protein LysE/YggA  72.44 
 
 		 205 aa  329  2e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0747907 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2688  lysine exporter protein (LysE/YggA)  71.56 
 
 		 205 aa  324  6e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.666763 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1954  amino acid transporter LysE  71.88 
 
 		 207 aa  320  8e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2295  lysine exporter protein LysE/YggA  72.25 
 
 		 207 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.536806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1669  lysine exporter protein LysE/YggA  72.25 
 
 		 207 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2367  lysine exporter protein LysE/YggA  71.81 
 
 		 207 aa  318  3e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.01403  normal  0.272564 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2618  lysine exporter protein LysE/YggA  71.37 
 
 		 229 aa  318  6e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2731  lysine exporter protein LysE/YggA  70.93 
 
 		 229 aa  318  6e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.979652  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2656  lysine exporter protein LysE/YggA  71.37 
 
 		 207 aa  318  6e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0662609  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1729  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  71.37 
 
 		 207 aa  317  7.999999999999999e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.339884  hitchhiker  0.00812067 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2485  lysine exporter protein LysE/YggA  71.81 
 
 		 207 aa  317  1e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.74737 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2156  lysine exporter protein LysE/YggA  72 
 
 		 205 aa  294  8e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.823885 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1869  lysine exporter protein LysE/YggA  68.89 
 
 		 206 aa  288  3e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.051717  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2289  lysine exporter protein LysE/YggA  64.73 
 
 		 204 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1567  amino acid transporter LysE  64.44 
 
 		 206 aa  256  2e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3276  lysine exporter protein LysE/YggA  58.3 
 
 		 206 aa  255  5e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.667965  normal  0.54958 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05364  putative threonine efflux protein  58.3 
 
 		 206 aa  247  8e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2183  lysine exporter protein LysE/YggA  54.95 
 
 		 206 aa  238  4e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.358199 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1537  lysine exporter protein LysE/YggA  56 
 
 		 207 aa  236  3e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.798481  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1528  hypothetical protein  56.82 
 
 		 206 aa  234  8e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0883  amino acid transport protein, LysE type  57.85 
 
 		 206 aa  222  4.9999999999999996e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.325897  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000521  putative threonine efflux protein  56.65 
 
 		 183 aa  217  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1266  homogentisate export protein  30.05 
 
 		 198 aa  120  9.999999999999999e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.733193  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 213 aa  108  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1023  LysE family translocator protein  27.57 
 
 		 204 aa  104  9e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000160759  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  31.94 
 
 		 211 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3800  LysE family translocator protein  30.88 
 
 		 222 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00135005  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3861  LysE family translocator protein  30.88 
 
 		 222 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0165555  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0048  lysine exporter protein LysE/YggA  31.78 
 
 		 208 aa  101  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075881  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0032  LysE family translocator protein  27.05 
 
 		 199 aa  101  1e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.787498  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0029  amino acid transporter LysE  30.88 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0393564  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0287  lysine exporter protein LysE/YggA  30.54 
 
 		 214 aa  99.4  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167258  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1022  homogentisate export protein  31.55 
 
 		 199 aa  99.4  4e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000262161  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1363  LysE family translocator protein  26.17 
 
 		 195 aa  99.4  4e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00372502  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  30.09 
 
 		 211 aa  98.6  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1767  homoserine/homoserine lactone efflux pump  29.87 
 
 		 249 aa  98.2  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1876  lysine exporter protein LysE/YggA  30.2 
 
 		 224 aa  97.4  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  30.56 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00531331  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  30.56 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0308  lysine exporter protein LysE/YggA  30.56 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000182648  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2048  lysine exporter protein LysE/YggA  31.17 
 
 		 249 aa  95.5  5e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.675394 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  29.63 
 
 		 212 aa  95.9  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3121  amino acid transporter LysE  31.36 
 
 		 218 aa  95.1  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201026  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3909  lysine exporter protein LysE/YggA  28.77 
 
 		 210 aa  94.7  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.806528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0236  lysine exporter protein LysE/YggA  30.05 
 
 		 214 aa  94.7  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5514  lysine exporter protein LysE/YggA  32.04 
 
 		 209 aa  91.7  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2876  lysine exporter protein LysE/YggA  27.85 
 
 		 218 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000054165  unclonable  0.00000000000000325534 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.56 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2660  lysine exporter protein LysE/YggA  31.86 
 
 		 217 aa  91.3  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0329872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0403  lysine exporter protein LysE/YggA  31.84 
 
 		 211 aa  89.7  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  30.09 
 
 		 211 aa  89.7  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4577  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 215 aa  89  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.499948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1667  lysine exporter protein LysE/YggA  27.78 
 
 		 209 aa  88.6  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.931902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1739  lysine exporter protein LysE/YggA  29.72 
 
 		 208 aa  87  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0365796  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2512  LysE family efflux protein  31.8 
 
 		 209 aa  87.4  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.77155  normal  0.629376 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1489  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.53 
 
 		 230 aa  86.7  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3117  lysine exporter protein LysE/YggA  30.65 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5250  lysine exporter protein LysE/YggA  30.65 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  28 
 
 		 213 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4610  lysine exporter protein LysE/YggA  30.15 
 
 		 210 aa  86.3  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4165  amino acid transporter LysE  31.48 
 
 		 203 aa  85.9  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0679  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.36 
 
 		 207 aa  85.1  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000948495 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4795  lysine exporter protein LysE/YggA  28.17 
 
 		 206 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5023  lysine exporter protein LysE/YggA  30.15 
 
 		 210 aa  84.7  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.904579 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3565  amino acid transporter LysE  30.14 
 
 		 203 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2209  lysine exporter protein LysE/YggA  29.67 
 
 		 203 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.92 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2356  lysine exporter protein LysE/YggA  29.19 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0918  lysine exporter protein LysE/YggA  27.15 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  29.19 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.957378  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.76 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.65 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3915  lysine exporter protein LysE/YggA  31 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652927 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  27.83 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0612  RhtB family transporter  28.51 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  27.78 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000194499  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0891  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.23 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888062 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  30.87 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  30.18 
 
 		 211 aa  78.2  0.00000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  30.39 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1401  lysine exporter protein LysE/YggA  30.09 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.582865  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1470  lysine exporter protein LysE/YggA  29.33 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  29.68 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2480  lysine exporter protein LysE/YggA  28.71 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.64 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2444  lysine exporter protein LysE/YggA  28.5 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3633  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.79 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  29.68 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3751  lysine exporter protein LysE/YggA  26.13 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540648 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0122  amino acid transporter LysE  26.79 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3544  lysine exporter protein LysE/YggA  30 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0116705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2393  lysine exporter protein LysE/YggA  31.44 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  26.76 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4441  lysine exporter protein (LysE/YggA)  28.23 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.568773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2789  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.96 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.376522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2867  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>