More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2798 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 207 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.071463  normal  0.0626704 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2656  lysine exporter protein LysE/YggA  95.85 
 
 		 207 aa  350  1e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2722  lysine exporter protein LysE/YggA  94.76 
 
 		 207 aa  344  6e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.299821  normal  0.0652266 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2902  lysine exporter protein LysE/YggA  59.9 
 
 		 206 aa  236  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3023  amino acid efflux protein, putative  93.55 
 
 		 144 aa  235  4e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0879148 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4795  lysine exporter protein LysE/YggA  59.9 
 
 		 206 aa  231  6e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000642  transporter LysE family  56.52 
 
 		 204 aa  217  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4701  lysine exporter protein LysE/YggA  55.07 
 
 		 207 aa  217  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0229835 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3025  amino acid transporter LysE  57 
 
 		 206 aa  215  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0495687 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2160  lysine exporter protein LysE/YggA  62.32 
 
 		 206 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17805  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6011  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  52.17 
 
 		 206 aa  203  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.513568 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1221  transporter, LysE family  53.85 
 
 		 209 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360927  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16960  amino acid transporter LysE  63.93 
 
 		 207 aa  193  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0385936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1474  hypothetical protein  63.93 
 
 		 207 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2246  amino acid efflux pump, RhtB family protein  50 
 
 		 222 aa  189  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.747875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5067  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  50.48 
 
 		 210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1323  lysine exporter protein LysE/YggA  36.74 
 
 		 211 aa  125  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.848324 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0891  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.76 
 
 		 209 aa  125  5e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3068  hypothetical protein  98.41 
 
 		 63 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0855599  normal  0.387406 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  37.98 
 
 		 209 aa  121  9e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0328  lysine exporter protein LysE/YggA  38.05 
 
 		 210 aa  112  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.872355  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  33.64 
 
 		 212 aa  111  7.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.86 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  37.02 
 
 		 212 aa  108  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  35.27 
 
 		 211 aa  105  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.01 
 
 		 211 aa  102  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1618  lysine exporter protein LysE/YggA  39.8 
 
 		 209 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.6 
 
 		 208 aa  102  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  34.01 
 
 		 211 aa  102  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  33 
 
 		 211 aa  99.8  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  32.5 
 
 		 211 aa  99.4  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3565  amino acid transporter LysE  33.99 
 
 		 203 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0905  hypothetical protein  35.45 
 
 		 208 aa  99  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.772442  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2209  lysine exporter protein LysE/YggA  33.99 
 
 		 203 aa  99  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  32.18 
 
 		 212 aa  98.6  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  33.66 
 
 		 213 aa  98.6  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2356  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 203 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1739  lysine exporter protein LysE/YggA  32.84 
 
 		 208 aa  96.7  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0365796  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  34.5 
 
 		 211 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4576  lysine exporter protein LysE/YggA  35.27 
 
 		 203 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 		 208 aa  94.7  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0048  lysine exporter protein LysE/YggA  35.41 
 
 		 208 aa  94  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075881  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3121  amino acid transporter LysE  30.95 
 
 		 218 aa  93.6  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201026  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5023  lysine exporter protein LysE/YggA  35.68 
 
 		 210 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.904579 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5514  lysine exporter protein LysE/YggA  35.53 
 
 		 209 aa  93.2  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5250  lysine exporter protein LysE/YggA  35.68 
 
 		 210 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3861  LysE family translocator protein  30.66 
 
 		 222 aa  92.8  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0165555  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3800  LysE family translocator protein  30.66 
 
 		 222 aa  92.8  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00135005  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3117  lysine exporter protein LysE/YggA  35.68 
 
 		 210 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0029  amino acid transporter LysE  30.19 
 
 		 222 aa  92.4  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0393564  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2025  lysine exporter protein LysE/YggA  33.51 
 
 		 208 aa  92  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.464731  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3288  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.41 
 
 		 211 aa  91.7  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  33.66 
 
 		 211 aa  91.7  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00531331  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0308  lysine exporter protein LysE/YggA  33.66 
 
 		 211 aa  91.7  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000182648  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3589  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.91 
 
 		 211 aa  91.3  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0368885 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2300  lysine exporter protein LysE/YggA  32.69 
 
 		 208 aa  90.9  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.735083  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2313  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.69 
 
 		 208 aa  90.9  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00564099  hitchhiker  0.00590082 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.48 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  30.19 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69310  LysE family efflux protein  33.01 
 
 		 209 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  31.6 
 
 		 213 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888062 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5994  hypothetical protein  33.01 
 
 		 209 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  29.25 
 
 		 208 aa  89.7  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3909  lysine exporter protein LysE/YggA  35.55 
 
 		 210 aa  89  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.806528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0403  lysine exporter protein LysE/YggA  35.11 
 
 		 211 aa  89  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0815  lysine exporter protein LysE/YggA  32.21 
 
 		 204 aa  89.4  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1401  lysine exporter protein LysE/YggA  29.61 
 
 		 204 aa  88.6  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.582865  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2073  lysine exporter protein LysE/YggA  33.51 
 
 		 208 aa  88.6  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106619  normal  0.299626 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2480  lysine exporter protein LysE/YggA  32.08 
 
 		 203 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  33.82 
 
 		 203 aa  87.8  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2878  lysine exporter protein LysE/YggA  34.54 
 
 		 237 aa  87  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1476  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.29 
 
 		 205 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.779186  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003307  putative threonine efflux protein  32.21 
 
 		 208 aa  86.7  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0367  lysine exporter protein LysE/YggA  34.04 
 
 		 211 aa  86.7  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1710  lysine exporter protein LysE/YggA  38.27 
 
 		 209 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0974274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.05 
 
 		 208 aa  86.3  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.05 
 
 		 208 aa  85.9  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6784  LysE family amino acid efflux protein  33.33 
 
 		 206 aa  85.5  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400664 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1489  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.27 
 
 		 230 aa  85.1  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2876  lysine exporter protein LysE/YggA  29.9 
 
 		 218 aa  85.5  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000054165  unclonable  0.00000000000000325534 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  32.23 
 
 		 206 aa  85.1  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3276  lysine exporter protein LysE/YggA  28.92 
 
 		 206 aa  84.7  9e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.667965  normal  0.54958 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1147  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.5 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  35.89 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5476  lysine exporter protein LysE/YggA  30.61 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4452  lysine exporter protein LysE/YggA  27.23 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000383536 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0577  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2108  lysine exporter protein LysE/YggA  32.08 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.451447 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4402  lysine exporter protein LysE/YggA  29.77 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.649358  normal  0.816137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4165  amino acid transporter LysE  29.56 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2870  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.7 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.75176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3290  lysine exporter protein LysE/YggA  27.1 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76234  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2444  lysine exporter protein LysE/YggA  29.5 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3625  amino acid transporter LysE  31.6 
 
 		 213 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.277347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0023  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 		 209 aa  81.3  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2183  lysine exporter protein LysE/YggA  27.45 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.358199 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0867  lysine exporter protein LysE/YggA  32.69 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.627781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1528  hypothetical protein  29.41 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0172  lysine exporter protein LysE/YggA  32.74 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.253668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  36.54 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>