More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1710 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1710  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 209 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0974274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.3 
 
 		 208 aa  143  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.3 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  39.71 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  39.44 
 
 		 212 aa  138  4.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.76 
 
 		 208 aa  138  7.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0048  lysine exporter protein LysE/YggA  40.98 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075881  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0122  amino acid transporter LysE  39.59 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.57 
 
 		 211 aa  136  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  39.09 
 
 		 207 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934187 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  41.04 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0123  lysine exporter protein LysE/YggA  40.1 
 
 		 207 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0113  lysine exporter protein LysE/YggA  38.58 
 
 		 207 aa  132  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.894147 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  40.1 
 
 		 207 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0122  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.1 
 
 		 207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  38.58 
 
 		 207 aa  132  5e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.161757 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  38.71 
 
 		 212 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  38.79 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4236  lysine exporter protein LysE/YggA  39.59 
 
 		 207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  37.74 
 
 		 211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  36.79 
 
 		 211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0891  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.69 
 
 		 209 aa  125  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  38.73 
 
 		 206 aa  125  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  37.26 
 
 		 211 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3121  amino acid transporter LysE  37.9 
 
 		 218 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201026  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0029  amino acid transporter LysE  36.94 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0393564  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  38.69 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0119  lysine exporter protein LysE/YggA  37.56 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4157  lysine exporter protein LysE/YggA  38.58 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2876  lysine exporter protein LysE/YggA  35.78 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000054165  unclonable  0.00000000000000325534 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3800  LysE family translocator protein  36.49 
 
 		 222 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00135005  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3861  LysE family translocator protein  36.49 
 
 		 222 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0165555  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2870  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.32 
 
 		 211 aa  122  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.75176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  36.7 
 
 		 211 aa  121  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00531331  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0308  lysine exporter protein LysE/YggA  36.7 
 
 		 211 aa  121  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000182648  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.68 
 
 		 213 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.83 
 
 		 211 aa  119  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.2 
 
 		 213 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1739  lysine exporter protein LysE/YggA  36.84 
 
 		 208 aa  119  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0365796  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  36.68 
 
 		 211 aa  119  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.78 
 
 		 212 aa  118  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  36.55 
 
 		 212 aa  118  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3751  lysine exporter protein LysE/YggA  38.07 
 
 		 207 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540648 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  37.31 
 
 		 208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3206  lysine exporter protein LysE/YggA  37.31 
 
 		 208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.84476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4452  lysine exporter protein LysE/YggA  35.5 
 
 		 205 aa  115  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000383536 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1394  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.24 
 
 		 207 aa  115  6e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0403  lysine exporter protein LysE/YggA  37.17 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1470  lysine exporter protein LysE/YggA  33.85 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.5 
 
 		 204 aa  112  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2444  lysine exporter protein LysE/YggA  35.2 
 
 		 205 aa  112  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1754  lysine exporter protein LysE/YggA  34.16 
 
 		 211 aa  111  9e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.335434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0266  lysine exporter protein LysE/YggA  36.06 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3915  lysine exporter protein LysE/YggA  38.61 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652927 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3909  lysine exporter protein LysE/YggA  34.5 
 
 		 210 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.806528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2456  lysine exporter protein LysE/YggA  34.65 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010294  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2770  lysine exporter protein LysE/YggA  35.42 
 
 		 233 aa  109  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0092  lysine exporter protein LysE/YggA  36.82 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0080  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.05 
 
 		 215 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4441  lysine exporter protein (LysE/YggA)  36.55 
 
 		 208 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.568773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3117  lysine exporter protein LysE/YggA  38.02 
 
 		 210 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5250  lysine exporter protein LysE/YggA  38.02 
 
 		 210 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  35.92 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2107  lysine exporter protein LysE/YggA  35.32 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.314049 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5023  lysine exporter protein LysE/YggA  37.17 
 
 		 210 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.904579 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2660  lysine exporter protein LysE/YggA  32.68 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0329872  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3625  amino acid transporter LysE  38.35 
 
 		 213 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.277347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3501  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.36 
 
 		 207 aa  106  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648819  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5476  lysine exporter protein LysE/YggA  37.56 
 
 		 210 aa  106  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0679  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.03 
 
 		 207 aa  105  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000948495 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0222  lysine exporter protein LysE/YggA  37.02 
 
 		 210 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6011  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.5 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.513568 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3544  lysine exporter protein LysE/YggA  34.01 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0116705  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0088  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.57 
 
 		 215 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5994  hypothetical protein  38.28 
 
 		 209 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4701  lysine exporter protein LysE/YggA  34.95 
 
 		 207 aa  105  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0229835 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2108  lysine exporter protein LysE/YggA  37.86 
 
 		 213 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.451447 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  37.38 
 
 		 213 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888062 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2867  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.01 
 
 		 212 aa  105  7e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4833  lysine exporter protein LysE/YggA  37.06 
 
 		 208 aa  103  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2902  lysine exporter protein LysE/YggA  34.45 
 
 		 206 aa  103  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  34.63 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4795  lysine exporter protein LysE/YggA  34.62 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2358  putative lysine exporter protein  39.87 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1166  lysine exporter protein LysE/YggA  31.75 
 
 		 211 aa  102  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5514  lysine exporter protein LysE/YggA  35.35 
 
 		 209 aa  102  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2512  LysE family efflux protein  35.15 
 
 		 209 aa  102  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.77155  normal  0.629376 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69310  LysE family efflux protein  37.8 
 
 		 209 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1667  lysine exporter protein LysE/YggA  31.84 
 
 		 209 aa  102  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.931902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3631  amino acid transporter LysE  41.41 
 
 		 207 aa  101  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0219  lysine exporter protein LysE/YggA  38.76 
 
 		 210 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.581325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3381  lysine exporter protein LysE/YggA  34.83 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.599576  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4986  lysine exporter protein LysE/YggA  34.83 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0538724  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3025  amino acid transporter LysE  34.16 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0495687 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3589  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.23 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0368885 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3965  LysE family translocator protein  35.88 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0104  LysE family protein  35.88 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.063661  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3288  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.57 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0198  amino acid transporter LysE  38.28 
 
 		 210 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2356  lysine exporter protein LysE/YggA  34.31 
 
 		 203 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139066  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>