More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2358 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2358  putative lysine exporter protein  100 
 
 		 215 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3206  lysine exporter protein LysE/YggA  71.29 
 
 		 208 aa  280  1e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.84476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  54.76 
 
 		 208 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  54.33 
 
 		 206 aa  198  5e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2107  lysine exporter protein LysE/YggA  53.11 
 
 		 210 aa  192  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.314049 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  56.1 
 
 		 204 aa  184  9e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2456  lysine exporter protein LysE/YggA  54.07 
 
 		 205 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010294  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  53.81 
 
 		 211 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2870  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  52.38 
 
 		 211 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.75176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1394  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  50.46 
 
 		 207 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5434  lysine exporter protein LysE/YggA  51.92 
 
 		 240 aa  156  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1078  lysine exporter protein LysE/YggA  40.19 
 
 		 204 aa  154  7e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1345  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  48.33 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123136  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3201  LysE family protein  52.07 
 
 		 207 aa  148  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3965  LysE family translocator protein  50.3 
 
 		 207 aa  145  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0104  LysE family protein  50.3 
 
 		 207 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.063661  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1618  lysine exporter protein LysE/YggA  40.48 
 
 		 209 aa  144  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0088  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  49.76 
 
 		 215 aa  142  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1657  LysE family protein  49.7 
 
 		 207 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2886  LysE family protein  49.7 
 
 		 207 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3462  LysE family translocator protein  49.7 
 
 		 207 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.531352  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3088  LysE family translocator protein  49.7 
 
 		 207 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.706703  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0080  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.73 
 
 		 215 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1754  lysine exporter protein LysE/YggA  41.18 
 
 		 211 aa  137  7.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.335434  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0231  putative (homoserine/homoserine lactone) efflux transmembrane protein  53.71 
 
 		 211 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.61981 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  39.71 
 
 		 208 aa  129  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3883  LysE family translocator protein  49.11 
 
 		 207 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0119  lysine exporter protein LysE/YggA  40.2 
 
 		 207 aa  125  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0122  amino acid transporter LysE  38.69 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  37.44 
 
 		 213 aa  122  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.51 
 
 		 213 aa  122  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0113  lysine exporter protein LysE/YggA  36.68 
 
 		 207 aa  121  6e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.894147 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  37.69 
 
 		 207 aa  121  9e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0123  lysine exporter protein LysE/YggA  37.69 
 
 		 207 aa  121  9e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0122  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.69 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  36.06 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  36.68 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934187 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  36.68 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.161757 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00299  homoserine/homoserine lactone efflux protein  36.84 
 
 		 204 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.51 
 
 		 213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4236  lysine exporter protein LysE/YggA  37.19 
 
 		 207 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  37.2 
 
 		 213 aa  118  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888062 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0092  lysine exporter protein LysE/YggA  37.69 
 
 		 211 aa  118  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  39.44 
 
 		 207 aa  118  6e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8095  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.96 
 
 		 225 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0582  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.76 
 
 		 211 aa  115  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0426675 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6784  LysE family amino acid efflux protein  39.71 
 
 		 206 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400664 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0202  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.9 
 
 		 159 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0322  lysine exporter protein LysE/YggA  43.75 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279488  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.41 
 
 		 205 aa  111  7.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5030  lysine exporter protein LysE/YggA  38.19 
 
 		 242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778866  normal  0.678911 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2944  lysine exporter protein LysE/YggA  34.6 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3589  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.24 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0368885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3040  lysine exporter protein LysE/YggA  43.48 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.408857  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5326  lysine exporter protein LysE/YggA  43.48 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.692371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3121  amino acid transporter LysE  36.92 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201026  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4520  lysine exporter protein LysE/YggA  40.19 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4942  lysine exporter protein LysE/YggA  43.48 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.20679 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3751  lysine exporter protein LysE/YggA  37.32 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540648 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6008  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.11 
 
 		 208 aa  109  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.435355 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  37.68 
 
 		 208 aa  109  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2194  leucine export protein LeuE  37.9 
 
 		 223 aa  109  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.250499  normal  0.121922 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.36 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7453  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.19 
 
 		 207 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353642  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.44 
 
 		 212 aa  108  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3288  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.12 
 
 		 211 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  36.62 
 
 		 212 aa  108  5e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  34.62 
 
 		 212 aa  108  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1277  lysine exporter protein LysE/YggA  39.9 
 
 		 212 aa  108  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.56 
 
 		 208 aa  108  6e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0403  lysine exporter protein LysE/YggA  39.9 
 
 		 211 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4137  lysine exporter protein LysE/YggA  38.05 
 
 		 205 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3861  LysE family translocator protein  34.4 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0165555  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1470  lysine exporter protein LysE/YggA  34.78 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1558  hypothetical protein  38.5 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3800  LysE family translocator protein  34.4 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00135005  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0029  amino acid transporter LysE  34.4 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0393564  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.27 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  38.42 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  35.07 
 
 		 211 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1476  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.49 
 
 		 205 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.779186  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0266  lysine exporter protein LysE/YggA  34.29 
 
 		 210 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.37 
 
 		 209 aa  105  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0038  lysine exporter protein LysE/YggA  34.93 
 
 		 211 aa  105  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  35.89 
 
 		 211 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  35.41 
 
 		 211 aa  105  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2108  lysine exporter protein LysE/YggA  37.2 
 
 		 213 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.451447 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1714  lysine exporter protein LysE/YggA  36.67 
 
 		 238 aa  105  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  33.67 
 
 		 208 aa  105  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.272931  normal  0.707068 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5023  lysine exporter protein LysE/YggA  39.18 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.904579 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3625  amino acid transporter LysE  37.2 
 
 		 213 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.277347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.96 
 
 		 211 aa  105  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3591  lysine exporter protein LysE/YggA  37.81 
 
 		 209 aa  105  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5436  lysine exporter protein LysE/YggA  37.81 
 
 		 209 aa  105  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4247  putative homoserine/threonine efflux protein  33.17 
 
 		 208 aa  105  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000239469 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  34.8 
 
 		 211 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0100  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.19 
 
 		 234 aa  103  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3704  lysine exporter protein LysE/YggA  37.5 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.326067  normal  0.173855 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  34.8 
 
 		 211 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4610  lysine exporter protein LysE/YggA  40.21 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>