15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3068 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2656  lysine exporter protein LysE/YggA  98.41 
 
 		 207 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  98.41 
 
 		 207 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.071463  normal  0.0626704 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3068  hypothetical protein  100 
 
 		 63 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0855599  normal  0.387406 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2722  lysine exporter protein LysE/YggA  91.49 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.299821  normal  0.0652266 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2902  lysine exporter protein LysE/YggA  56.67 
 
 		 206 aa  70.9  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3025  amino acid transporter LysE  50.79 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0495687 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4795  lysine exporter protein LysE/YggA  47.62 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4701  lysine exporter protein LysE/YggA  46.03 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0229835 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000642  transporter LysE family  41.27 
 
 		 204 aa  54.3  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1221  transporter, LysE family  52.27 
 
 		 209 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360927  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6011  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.03 
 
 		 206 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.513568 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2160  lysine exporter protein LysE/YggA  50.79 
 
 		 206 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17805  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2246  amino acid efflux pump, RhtB family protein  44.83 
 
 		 222 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.747875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16960  amino acid transporter LysE  48.89 
 
 		 207 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0385936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1474  hypothetical protein  48.89 
 
 		 207 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>