More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2160 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2160  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 206 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17805  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4795  lysine exporter protein LysE/YggA  66.02 
 
 		 206 aa  275  4e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3025  amino acid transporter LysE  65.05 
 
 		 206 aa  265  4e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0495687 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2902  lysine exporter protein LysE/YggA  60.49 
 
 		 206 aa  250  1e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2656  lysine exporter protein LysE/YggA  65.28 
 
 		 207 aa  230  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1221  transporter, LysE family  57.49 
 
 		 209 aa  230  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360927  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6011  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  55.61 
 
 		 206 aa  227  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.513568 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  64.77 
 
 		 207 aa  226  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.071463  normal  0.0626704 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000642  transporter LysE family  55.61 
 
 		 204 aa  223  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2722  lysine exporter protein LysE/YggA  65.1 
 
 		 207 aa  223  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.299821  normal  0.0652266 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4701  lysine exporter protein LysE/YggA  54.63 
 
 		 207 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0229835 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1474  hypothetical protein  64.92 
 
 		 207 aa  207  7e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16960  amino acid transporter LysE  64.4 
 
 		 207 aa  204  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0385936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2246  amino acid efflux pump, RhtB family protein  53.33 
 
 		 222 aa  201  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.747875  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3023  amino acid efflux protein, putative  69.6 
 
 		 144 aa  168  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0879148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0891  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.02 
 
 		 209 aa  143  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  38.05 
 
 		 209 aa  137  7.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5067  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  50 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.33 
 
 		 212 aa  129  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3565  amino acid transporter LysE  38.46 
 
 		 203 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1323  lysine exporter protein LysE/YggA  37.14 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.848324 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2356  lysine exporter protein LysE/YggA  37.95 
 
 		 203 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2480  lysine exporter protein LysE/YggA  38.74 
 
 		 203 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2209  lysine exporter protein LysE/YggA  37.95 
 
 		 203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.1 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  35.68 
 
 		 212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5994  hypothetical protein  34.3 
 
 		 209 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0815  lysine exporter protein LysE/YggA  38.38 
 
 		 204 aa  118  7e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  36.04 
 
 		 211 aa  117  7.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  39.9 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69310  LysE family efflux protein  33.82 
 
 		 209 aa  115  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  37.19 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.31 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0328  lysine exporter protein LysE/YggA  39.44 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.872355  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  38 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  37.69 
 
 		 211 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  36.68 
 
 		 211 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4576  lysine exporter protein LysE/YggA  37.97 
 
 		 203 aa  111  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  34.95 
 
 		 208 aa  111  8.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  38 
 
 		 212 aa  111  9e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4165  amino acid transporter LysE  34.33 
 
 		 203 aa  111  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5476  lysine exporter protein LysE/YggA  31.25 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  37.31 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3288  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.75 
 
 		 211 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.47 
 
 		 213 aa  107  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3121  amino acid transporter LysE  34.95 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201026  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1528  hypothetical protein  33.5 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.95 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1739  lysine exporter protein LysE/YggA  34.93 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0365796  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  35.47 
 
 		 211 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00531331  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0308  lysine exporter protein LysE/YggA  35.47 
 
 		 211 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000182648  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3589  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.23 
 
 		 211 aa  105  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0368885 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3861  LysE family translocator protein  33.81 
 
 		 222 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0165555  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0048  lysine exporter protein LysE/YggA  35.71 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075881  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3800  LysE family translocator protein  33.81 
 
 		 222 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00135005  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.02 
 
 		 208 aa  103  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0029  amino acid transporter LysE  33.02 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0393564  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0266  lysine exporter protein LysE/YggA  30 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05364  putative threonine efflux protein  30.58 
 
 		 206 aa  102  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.02 
 
 		 208 aa  103  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5514  lysine exporter protein LysE/YggA  36.16 
 
 		 209 aa  102  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0050  lysine exporter protein LysE/YggA  34.17 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  36.16 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888062 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.99 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0303  lysine exporter protein LysE/YggA  35.47 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.85144e-16  normal  0.0852573 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0140  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.17 
 
 		 210 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2876  lysine exporter protein LysE/YggA  33.66 
 
 		 218 aa  99.4  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000054165  unclonable  0.00000000000000325534 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0198  amino acid transporter LysE  32 
 
 		 210 aa  99  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3501  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.64 
 
 		 207 aa  99  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648819  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.9 
 
 		 205 aa  98.2  7e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0403  lysine exporter protein LysE/YggA  34.2 
 
 		 211 aa  98.2  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0291  lysine exporter protein LysE/YggA  34.62 
 
 		 224 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  31.98 
 
 		 213 aa  97.8  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1710  lysine exporter protein LysE/YggA  37.7 
 
 		 209 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0974274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0823  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.68 
 
 		 208 aa  97.8  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000549104  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2108  lysine exporter protein LysE/YggA  36.36 
 
 		 213 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.451447 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0219  lysine exporter protein LysE/YggA  32 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.581325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4452  lysine exporter protein LysE/YggA  31.91 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000383536 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3117  lysine exporter protein LysE/YggA  35.42 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5250  lysine exporter protein LysE/YggA  35.42 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3625  amino acid transporter LysE  35.8 
 
 		 213 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.277347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0222  lysine exporter protein LysE/YggA  30.5 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5023  lysine exporter protein LysE/YggA  35.94 
 
 		 210 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.904579 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.75 
 
 		 208 aa  95.5  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2660  lysine exporter protein LysE/YggA  28.91 
 
 		 217 aa  95.5  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0329872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3915  lysine exporter protein LysE/YggA  33.65 
 
 		 212 aa  95.1  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652927 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4577  lysine exporter protein LysE/YggA  34.26 
 
 		 215 aa  95.1  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.499948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2770  lysine exporter protein LysE/YggA  33.71 
 
 		 233 aa  94.4  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2130  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.93 
 
 		 205 aa  94.4  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4137  lysine exporter protein LysE/YggA  35.29 
 
 		 205 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1618  lysine exporter protein LysE/YggA  39.69 
 
 		 209 aa  93.2  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2944  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 		 203 aa  93.6  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6784  LysE family amino acid efflux protein  35.79 
 
 		 206 aa  92.8  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400664 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  34.04 
 
 		 206 aa  92.8  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  28.79 
 
 		 206 aa  92.4  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1476  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.69 
 
 		 205 aa  92.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.779186  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  34.83 
 
 		 208 aa  92.4  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3615  lysine exporter protein LysE/YggA  30.85 
 
 		 208 aa  92  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0587499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0172  lysine exporter protein LysE/YggA  32.16 
 
 		 203 aa  92  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.253668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1609  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.87 
 
 		 210 aa  91.7  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.127652  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>